معلومة

كيف تم تمييز فيروس كورونا؟


لقد قرأت الكثير عن تفشي فيروس كورونا ، وأنا أعلم أنه في يناير قام العلماء بالفعل بترتيب الجينوم الفيروسي.

كيف تم التعرف على الفيروس قبل التسلسل

بالنظر إلى أن الفيروسات ليست مثل الجراثيم التي يمكنك رؤيتها وتمييزها بسهولة في المجهر ، فكيف يمكن للعلماء معرفة أن هناك شيئًا جديدًا حول المرض الجديد وكيف يمكنهم تنقية العامل الممرض الذي يسبب هذا المرض دون معرفة ماهيته ودون معرفة ذلك الكود الجيني؟

أين يمكنني العثور على معلومات حول الإجراءات المستخدمة لتحديد مسببات الأمراض الفيروسية الجديدة؟

بالنظر إلى وجود مجموعة من الأشخاص المصابين بأمراض مشبوهة ، ما هي إجراءات المختبر يستخدم للقضاء على مسببات الأمراض المعروفة وكيف تكتشف أن لديك فيروسًا جديدًا دون معرفة تسلسله الجيني (وبدون القدرة على استخراجه - على حد علمي لا يمكنك عزل جسيم الفيروس بالملاقط ...).

شكرا لك!


هذا هو علم الأوبئة الأساسي. عندما يلاحظ المهنيون الطبيون أن مجموعة من الأشخاص لديهم بعض السمات المشتركة ، يُنظر إليهم على أنهم مصابون بمرض مشابه ، فإنهم يسألون عما إذا كان هناك اتصال. في هذه الحالة ، تم تشخيص العديد من الأشخاص في ووهان بالتهاب رئوي حاد ، ولاحظ الأطباء أنهم يعملون في نفس الموقع.

أصيب ثلاثة مرضى بالتهاب رئوي حاد وتم نقلهم إلى مستشفى في ووهان في 27 ديسمبر 2019 ... كانت مهنتها بائع تجزئة في سوق بيع المأكولات البحرية بالجملة ... لقد كان زائرًا متكررًا لسوق بيع المأكولات البحرية بالجملة.

- فيروس كورونا المستجد من مرضى الالتهاب الرئوي في الصين ، 2019

تزداد احتمالية متابعتك للمرض عندما يكون المرض غير عادي أو شديد ، وعندما يكون عامل الربط غير عادي أو مريب. في هذه الحالة ، يُفترض أن الالتهاب الرئوي الحاد كان غير متوقع ، وأسواق الحيوانات الحية لديها دائمًا إمكانية لانتقال المرض.

(في الواقع ، من المحتمل جدًا أن يكون الفيروس قد انتشر في المنطقة لأسابيع قبل ملاحظة هذه المجموعة ، وأن الحالات السابقة لم تكن مفاجئة بما يكفي لتحريك البحث اللازم لتحديد فيروس جديد ؛ على الرغم من أنه من المحتمل أيضًا أن لاحظ العاملون الطبيون في ووهان أن هناك عددًا كبيرًا من حالات الالتهاب الرئوي وكانوا يبحثون بالفعل عن اتصال.)

انظر أيضًا إجابات كيف اكتشف العلماء فيروس نقص المناعة البشرية ؟. لطالما كان علم الأوبئة القديم أمرًا بالغ الأهمية.

تشرح نفس المقالة كيفية تسلسل الفيروس:

تم جمع عينات سائل غسل القصبات الهوائية في أكواب معقمة أضيف إليها وسيط نقل الفيروس ... تم استخدام الحمض النووي الريبي المستخرج من سائل غسل القصبات الهوائية والمواد الطافية المزروعة كقالب لاستنساخ الجينوم وتسلسله. استخدمنا مزيجًا من تسلسل Illumina وتسلسل النانو لتوصيف جينوم الفيروس.

ومعزولة:

... تم تلقيح مادة طافية من عينات سائل غسل القصبات الهوائية على السطح القمي لمزارع الخلية ... بعد ثلاثة ممرات ، تم تحضير العينات القمية والخلايا الظهارية لمجرى الهواء البشري للإرسال بالمجهر الإلكتروني ...

لفترة وجيزة ، أخذوا عينات من المرضى ، وزرعوها على خلايا مستنبتة ، واستخدموا المجهر الإلكتروني للتحقق من نوع الفيروس. قاموا بتسلسل السائل (وليس الخلايا ، حيث سيتم إفراز الفيروس في السائل ، مما يجعله مصدرًا نقيًا نسبيًا للحمض النووي الريبي للفيروس) ثم تسلسله باستخدام نهج التسلسل القياسي عالي الإنتاجية ؛ معرفة النوع المحتمل للفيروس سيجعل هذا أسهل ولكنه ليس ضروريًا. كان من الممكن أن يكون هناك الكثير من الحمض النووي الريبي البشري في التسلسل ، ولكن من السهل فصل ذلك بشكل بيولوجي وقصر تحليلك على التسلسلات الفيروسية. كما أن عزل الفيروس لم يكن ضروريًا لتحديد الهوية ؛ معرفة التسلسل هو المعلومات الهامة اليوم. لكن وجود عزل فيروسي يجعل بالتأكيد كل الأعمال اللاحقة أسهل بكثير.

هذا هو علم الأحياء الجزيئي المعياري الحديث ، وليس مهارة مقصورة على فئة معينة.