معلومة

1.5: الواجبات - علم الأحياء


المهام في هذه الدورة التدريبية مرخصة بشكل علني ومتوفرة كما هي أو يمكن تعديلها لتناسب احتياجات طلابك. تتوفر مفاتيح الإجابة لأعضاء هيئة التدريس الذين يتبنون دورات Waymaker أو OHM أو Candela بدعم مدفوع من Lumen Learning. يساعدنا هذا النهج في حماية السلامة الأكاديمية لهذه المواد من خلال ضمان مشاركتها فقط مع أعضاء هيئة التدريس والموظفين المرخصين والمنتسبين إلى المؤسسة.

يتم توفير مطالبات التعيين في هذه الدورة التدريبية ليستخدمها المعلمون وفقًا لتقديرهم. تقدم هذه الدورة 10 محفزات ونماذج تصنيف للواجبات الكتابية ، المصممة لتتماشى مع نتائج الدورة. يمكنك عرضها من خلال النقر على روابط المهام في وحدات الدورة التدريبية.

إذا قمت باستيراد هذه الدورة التدريبية إلى إدارة التعلم (Blackboard ، و Canvas ، وما إلى ذلك) ، فسيتم تحميل المهام تلقائيًا في أداة الواجب. يمكنك مشاهدتها أدناه أو طوال الدورة.

ملفات الواجبوحدة المحاذاة
رائد فضاء بيولوجي (قم بتنزيل .docx، .rtf)بعد كل من الوحدة 1: مقدمة في علم الأحياء والوحدة 2: كيمياء الحياة
التغذية ليوم واحد (تنزيل docx ، .rtf)بعد الوحدة 3: الجزيئات البيولوجية المهمة
منشئ الخلية (قم بتنزيل .docx ، .rtf)بعد الوحدة 4: الهيكل الخلوي
الأغشية على قيد الحياة! (تنزيل docx و. rtf)بعد الوحدة 5: أغشية الخلايا
مراقبة معاملات الطاقة (تنزيل docx ، .rtf)بعد الوحدة 6: مسارات التمثيل الغذائي
مهام الإنترنت Mitosis و Meiosis (تنزيل .docx ، .rtf)بعد الوحدة 7: تقسيم الخلية
أيهما يحتوي على المزيد من الحمض النووي؟ (تنزيل docx و. rtf)بعد الوحدة 8: بنية الحمض النووي والنسخ المتماثل
كيف تعمل الطفرات (قم بتنزيل .docx ، .rtf)بعد كل من الوحدة 9: نسخ الحمض النووي وترجمته ، والوحدة 10: التعبير الجيني
دراجون جينيتكس (قم بتنزيل .docx ، .rtf)الوحدة 11: بعد وراثة السمات
عندما هجوم Jabberjays! (تنزيل docx ، .rtf)بعد كل من الوحدة 12: نظرية التطور والوحدة 13: علم الأحياء الحديث

1.5: الواجبات - علم الأحياء

الواجبات التحضيرية للمحاضرة ربيع 2016

اقرأ أو راجع البنود الواردة في الجدول أدناه استعدادًا لمحاضرة ذلك اليوم.
سوف أقوم بتحديث هذا الجدول أسبوعيًا لمطابقة ما نقوم به أو سنفعله في المحاضرة.

اقرأ واعرف
هذه الوحدات قبل المحاضرة
(p # هي صفحة البداية)
(1.1 = الفصل 1 ،
وحدة 1)

فقط المقشود
هذه الوحدات قبل المحاضرة
(p # هي صفحة البداية)
(1.1 = الفصل 1 ، الوحدة 1)

موقع الكتروني
قم بقراءة هذه المحاضرة قبل المحاضرة ثم تعرف على النحو المنصوص عليه في المحاضرة

موقع الكتروني
قم بقراءة هذه المحاضرة قبل المحاضرة ثم تعرف على النحو المنصوص عليه في المحاضرة

موقع الكتروني
قم بقراءة هذه المحاضرة قبل المحاضرة ثم تعرف على النحو المنصوص عليه في المحاضرة

معمل الكمبيوتر MSLC
انظر المفتاح أسفل هذا الجدول

اسأل استشاري الكمبيوتر MSLC عن سماعات الرأس عند الاستخدام
فيزيولوجيا آدم التفاعلي بحيث يمكنك الاستماع إلى السرد!
1/19 علم الأحياء والتعلم أمبير ----- 26.8،9 ص 526
28.2،6 ص 565
35.1,4,9,10,11,15,17
ص 700 ------ ----- ----- ----- ابدأ العمل على:
AIP - العضلات: مراجعة التشريح: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.
AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.
AIP - Nervous II: Anatomy Review: 1-9 Use 28.6، p 569 in support.
الهدف هو معرفة الاختبار 1 1/21 علم الأحياء والتعلم أمبير ----- 26.8،9 ص 526
28.2،6 ص 565
35.1,4,9,10,11,15,17
ص 700 ------ ----- ----- Skim The Workplace Realities مقالة (ساكاي ، مجلد الموارد) كن يعمل على:
AIP - Muscular: Anatomy Review: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.
AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.
AIP - Nervous II: Anatomy Review: 1-9 Use 28.6، p 569 in support.
الهدف هو معرفة الاختبار 1 1/26 علم الأحياء والتعلم - نماذج الكائنات الحية 28.2،6 ص 565 1.2 ص 3
3. مقدمة ، 12 ، 17 ص 32
13.6 ، 7 ، 14 ص 262
26.8،9 ص 526
35.1,4,9,10,11,15,17
ص 700 ------ ----- ----- Skim The Workplace Realities مقالة (ساكاي ، مجلد الموارد) كن يعمل على:
AIP - العضلات: مراجعة التشريح: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.
AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.
AIP - Nervous II: Anatomy Review: 1-9 Use 28.6، p 569 in support.
& quotKnowKnow & quot هؤلاء لمدة 2/4 محاضرة. 1/28 علم الأحياء ، النماذج الحيوية و LTP 26.8،9 ص 526
28.2،6 ص 565
35.1 ص 700 1.2 ص 3
3. مقدمة ، 12 ، 17 ص 32
13.6 ، 7 ، 14 ص 262
35.4,9,10,11,15,17
ص 703 ------ ----- ----- Skim The Workplace Realities مقالة (ساكاي ، مجلد الموارد)
اقرأ وتعرف على سياسة الدورة كن يعمل على:
AIP - العضلات: مراجعة التشريح: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.
AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.
AIP - Nervous II: Anatomy Review: 1-9 Use 28.6، p 569 in support.
& quotKnowKnow & quot هؤلاء لمدة 2/4 محاضرة. 2/2 علم الأحياء والكيمياء والظهور 26.8،9 ص 526
28.2،6 ص 565
35.1 ص 700 1.1،2،3،4،5 ص 2
3. مقدمة ، 12 ، 17 ص 32
5.10 ، ص 80
13.6 ، 7 ، 14 ص 262
35.4,9,10,11,15,17,21
ص 703 ------ ----- ----- Skim The Workplace Realities مقالة (ساكاي ، مجلد الموارد) كن يعمل على:
AIP - العضلات: مراجعة التشريح: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.
AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.
AIP - Nervous II: Anatomy Review: 1-9 Use 28.6، p 569 in support.
& quotKnowKnow- اقتباس هذه لمحاضرة 2/4. 2/4 ظهور العضلات والهيكل العظمي 1.1،2،3،4،5 ص 2
5.10 ، ص 80
26.8،9 ص 526
28.2،6 ص 565
35.1 ص 700 3. مقدمة ، 12 ، 17 ص 32
13.6 ، 7 ، 14 ص 262
35.4,9,10,11,15,17,21
ص 703 ------ ----- ----- ----- أعرف:
AIP - العضلات: مراجعة التشريح: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.
AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.
AIP - Nervous II: Anatomy Review: 1-9 Use 28.6، p 569 in support. 2/9 الظهور والتطور 1.1،2،3،4،5 ص 2
5.10 ، ص 80
26.8،9 ص 526
28.1،2،6 ص 565
30.7 ، 8 ، ص 611
35.1 ص 700 3. مقدمة ، 12 ، 17 ص 32
13.6 ، 7 ، 14 ص 262
35.4,9,10,11,15,17,21
ص 703 ------ ----- ----- ----- أعرف:
AIP - Muscular: Anatomy Review: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.
AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.
AIP - Nervous II: Anatomy Review: 1-9 Use 28.6، p 569 in support. 2/11 الامتحان 1 تعرف على الاختبار 1:
1.1،2،3،4،5 ص 2
5.10 ، ص 80
26.8،9 ص 526
28.1،2،6 ص 565
30.7 ، 8 ، ص 611
35.1 ص 700

احصل على نوم جيد ليلاً!
(يُعرف بأنه 8+ ساعات)

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30. استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30. استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30. استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30. استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30. استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30. استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30. استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

احصل على نوم جيد ليلاً!
(يُعرف بأنه 8+ ساعات)

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30.
استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30.
استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30.
استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30.
استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30.
استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.

احصل على نوم جيد ليلاً!
(يُعرف بأنه 8+ ساعات)

تناول الإفطار!
كل الغذاء! أحضر # 2 قلم رصاص وممحاة! ----- ----- تعرف على الاختبار 3:

AIP- العضلات: نظرية الفتيل الانزلاقي: 1-30.
استخدم 30.9،10 ص 612 في الدعم.


AIP - Muscular: Anatomy Review: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.

AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.


AIP - Muscular: Anatomy Review: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.

AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.


AIP - Muscular: Anatomy Review: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.

AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.


AIP - Muscular: Anatomy Review: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.

AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.


AIP - العضلات: مراجعة التشريح: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.

AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.


AIP - العضلات: مراجعة التشريح: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.

AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.


AIP - العضلات: مراجعة التشريح: 4-11 استخدم 30.8 ، ص 612 في الدعم.

AIP - Nervous I: مراجعة التشريح: 3-11
استخدم 28.1،2 ص 564 في الدعم.

احصل على نوم جيد ليلاً!
(يُعرف بأنه 8+ ساعات)

البرامج موجودة في مجلد سطح المكتب Bio 100.

1. UB = فهم علم الأحياء! برنامج
- اختر زر مينيكورس ، ثم منطقة الموضوع ، ثم مينيكورس.
المفتاح: UB-Subject area: minicourse name: Cards to view
2. AIP = برنامج علم وظائف الأعضاء التفاعلي ADAM
- حدد زر النظام ، ثم زر منطقة الموضوع.
المفتاح: AIP - النظام: الموضوع: بطاقات للعرض


هيكل الماء

يحتوي جزيء الماء على ثلاث ذرات اثنتين هيدروجين ذرات مرتبطة بواحد الأكسجين هذا يعطيها الصيغة الكيميائية لـ ح2ا. تظهر المعادلة الكيميائية لتكوين الماء أدناه:

ترتبط ذرات الهيدروجين بذرة الأكسجين مع روابط تساهمية. في هذه السندات ، التكافؤ يتم مشاركة الإلكترون في كل ذرة هيدروجين مع الأكسجين ، بحيث يمكن للذرات الثلاث أن تكمل غلاف التكافؤ. كل جزيء ماء مرتبط بجزيئات الماء الأخرى من خلال هيدروجين الترابط. وهذه هي ضعيف الروابط التي تحافظ على جزيئات الماء معًا كمادة.


نتائج ومناقشة

بروتوكول شرح الجينوم باستخدام قاعدة بيانات COG

الشكل 1 يصور خطوات الإجراء المستخدم في شرح الجينوم القائم على COG. لا يقتصر هذا البروتوكول على تحليل COGNITOR المباشر ، ولكنه يستفيد أيضًا من المعلومات التطورية المغلفة في COGs ، بشكل أساسي في شكل أنماط النشوء والتطور ، والتي يمكن استخدامها لتوجيه البحث عن أعضاء COG المفقودين (الموصوفة بالتفصيل في [18]) ). باختصار ، كلما لم يتم تمثيل أحد الجينومات التي تم تحليلها بشكل غير متوقع في COG ، تم إجراء تحليل إضافي لتحديد الأعضاء المتباعدون المحتملين باستخدام بحث قاعدة بيانات تكراري مع برنامج PSI-BLAST ، أو للكشف عن الأعضاء الذين ربما فقدوا في الأصل. شرح الجينوم باستخدام ترجمة عمليات البحث باستخدام برنامج TBLASTN. في التحليل الحالي لاثنين من الجينومات البدائية ، تضمنت حالات الغياب غير المتوقعة هذه COGs ممثلة في جميع الأنواع الأخرى أو معظمها أو في جميع الأنواع القديمة الأخرى. على العكس من ذلك ، تم فحص الأحداث غير المتوقعة للجينومات التي تم تحليلها في COGs ، على سبيل المثال العضو البدائي الأول في COG البكتيرية البحتة ، كل حالة على حدة للكشف عن أحداث نقل الجينات الأفقية المحتملة والوظائف الجديدة في الجينوم البدائي.

مخطط انسيابي لعملية شرح الجينوم باستخدام COGs. NR هي قاعدة بيانات التسلسل غير الزائدة في المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية.

تقييم التخصيص الحسابي للبروتينات إلى COGs

تم تعيين البروتينات إلى COGs من خلال جولتين من المقارنة الآلية باستخدام COGNITOR ، متبوعة بفحص يدوي للمهام. تحاول الجولة الأولى تعيين البروتينات إلى COGs الموجودة عادةً ، ويتم إجراء 90٪ من التعيينات في هذه الخطوة. تخدم الجولة الثانية غرضين: أولاً ، تعيين نظائر مماثلة كان من الممكن أن يتم تفويتها في الجولة الأولى إلى مجموعات COG الموجودة وثانيًا ، لإنشاء COGs جديدة من تلك البروتينات التي ظلت غير مخصصة. بهدف تحديد المستوى الأمثل للأتمتة لمثل هذه المهام ، قمنا بتقييم أداء الإجراء الآلي للتعليق التوضيحي أ. بيرنيكس الجينوم ، الذي ينتمي إلى تصنيف رئيسي ، Crenarchaeota ، الذي لم يتم تمثيله حتى الآن في قاعدة بيانات COG. لأغراض المقارنة ، فإن أداء الإجراء الآلي لتعليق البروتينات من Pyrococcus abyssi تم تقييمه أيضًا. أبيسسي هو عضو في Euryarchaeota وترتبط ارتباطًا وثيقًا بـ هوريكوشي بي، والتي يتم تمثيلها حاليًا في COGs. يتم عرض البيانات في الجدول 1. يتم النظر في ثلاث فئات رئيسية من تخصيصات البروتين: الإيجابيات الحقيقية والإيجابيات الخاطئة والسلبيات الزائفة.

الإيجابيات الحقيقية هي البروتينات التي تم تخصيصها بشكل صحيح إما إلى COG الحالي أو COG الذي تم إنشاؤه نتيجة لإضافة الأنواع الجديدة. بعد فحص مفصل لنتائج COGNITOR ، يتم تعيين 95 ٪ من النتائج تلقائيًا أ. بيرنيكس و 97٪ من البروتينات المخصصة تلقائيًا أبيسسي تم تصنيف البروتينات على أنها إيجابية حقيقية. كما هو متوقع ، اختلف عدد COGs التي تم إنشاؤها نتيجة لإضافة كل نوع بشكل كبير. أبيسسي، التي تنتمي إلى كليد تم تمثيله سابقًا ، ساهمت فقط بثلاث مجموعات COG جديدة ، كل منها يمثل عائلة محفوظة مفقودة في هوريكوشي بي. في المقابل ، تم إنشاء 27 COGs جديدة نتيجة للإضافة أ. بيرنيكس البروتينات.

الإيجابيات الكاذبة عبارة عن بروتينات تم تعيينها بشكل غير صحيح إلى COG ، وتنقسم هذه إلى فئتين. الفئة الأولى هي تلك البروتينات التي يجب إزالتها تمامًا (أي غير مدرجة في أي COG). في مثل هذه الحالات ، على الرغم من استيفاء معيار أن بروتين الاستعلام لديه ما لا يقل عن ثلاثة أفضل نتائج محددة للجينوم لأعضاء COG المعين ، أظهر الفحص التفصيلي أن هذه النتائج على الأرجح نشأت عن طريق الصدفة (انظر قسم المواد والأساليب) . الفئة الثانية هي تلك البروتينات التي تم تعيينها إلى COG بواسطة COGNITOR ، ولكن تم نقلها لاحقًا إلى COG آخر. في أغلب الأحيان (21 من 23 حالة ل أ. بيرنيكس، وجميع حالات أبيسسي) ، تم نقل البروتينات إلى COG ذات الصلة (على سبيل المثال ، بين اثنين من COGs التي تتضمن عائلات متميزة ، ولكن مرتبطة من ATPases).

السلبيات الكاذبة عبارة عن بروتينات لم يتم تعيينها لأي COG بواسطة COGNITOR لأنها فشلت في معيار أفضل ثلاثة (انظر قسم المواد والأساليب) ، ولكن تم تضمينها لاحقًا كنتيجة لمقارنات تسلسل إضافية بدأت عند فحص أنماط النشوء والتطور غير المتوقعة . مرة أخرى ، حدوث سلبيات كاذبة لـ أبيسسي كان حوالي نصف ذلك من أ. بيرنيكس (1٪ مقابل 2٪). من بين 17 حالة حذف تم تحديدها من بين أ. بيرنيكس البروتينات ، 11 نتيجة للمعالجة المسبقة لتسلسل البروتين للمناطق منخفضة التعقيد باستخدام برنامج SEG. عندما تم تشغيل COGNITOR بدون تصفية ، تم تعيين هذه البروتينات تلقائيًا إلى COGs. الباقي ، بما في ذلك جميع السلبيات الخاطئة التي شوهدت أبيسسي، فشلوا في معيار الثلاثة الأفضل ضربًا لأنهم أظهروا تشابهًا ضعيفًا فقط مع أعضاء COG المعني. ومع ذلك ، نظرًا لأنهم كانوا أفضل المرشحين لملء الفجوات غير المتوقعة في أنماط النشوء والتطور ، وأيضًا نظرًا لاحتوائهم على نماذج التسلسل النموذجية للعائلات المعنية ، تم تضمين هذه البروتينات في COGs.

شرح ايروبيروم بيرنيكس و Pyrococcus abyssiiمجموعات البروتين

ايروبيروم بيرنيكس تم الإبلاغ عن ترميز 2694 بروتينًا مفترضًا في جينوم 1.67 ميغا بايت (MB) [17]. من بين هؤلاء ، تم تعيين 633 بروتينًا وظيفة أو توصيفًا جزئيًا في التقرير الأصلي ، على أساس مقارنة التسلسل مع البروتينات في قواعد بيانات GenBank و SWISS-PROT و EMBL و PIR و Owl. تحتوي كل من قواعد البيانات هذه على بروتينات مشروحة بشكل فردي. في المقابل ، تشرح قاعدة بيانات COG عائلات البروتين بدلاً من البروتينات الفردية ، والطريقة المستخدمة لبناء COGs غالبًا ما تسمح بتمييز العلاقات البعيدة. وبالتالي ، فإن استخدام قاعدة بيانات COG لتعليق الجينوم المتسلسل حديثًا من المحتمل أن يزيد من عدد التعيينات الوظيفية. في الواقع ، لقد قمنا بتعيين 1،102 أ. بيرنيكس البروتينات إلى COGs. بعض هذه البروتينات (154) هي أعضاء في COGs تنتمي إلى مجموعة (S) غير المميزة ، والتي لا يُعرف عنها سوى القليل باستثناء أنها تشكل عائلة محفوظة [12]. بطرحها ، تمت إضافة التعليق التوضيحي إلى 315 بروتينًا - بزيادة تبلغ حوالي 50٪ مقارنةً بالتعليق التوضيحي الأصلي. وتشمل هذه ، من بين أمور أخرى ، إنزيمات الجلوكوز الرئيسية أيزوميراز الجلوكوز 6-فوسفات (APE0768 ، COG0166) وإيزوميراز ثلاثي فوسفات (APE1538 ، COG0149) ، وإنزيمات البيريميدين التخليقية الحيوية orotidine-5'-phosphate decarboxylase (APE0768 ، COG0448). (APE0401 ، COG0528) ، cytidylate kinase (APE0978 ، COG1102) ، و thymidylate kinase (APE2090 ، COG0125). وبالمثل ، تم تعيين وظائف مهمة في تكرار وإصلاح الحمض النووي بثقة لعدد كبير من أ. بيرنيكس البروتينات التي تم وصفها في التعليق التوضيحي الأصلي ببساطة على أنها "بروتين افتراضي". ومن الأمثلة على ذلك ، إنزيم DNA Primase من النوع البكتيري (COG0358) ، والوحدة الفرعية الكبيرة من بريماز من النوع البدائي حقيقية النواة (COG2219) ، وليغاز الحمض النووي المعتمد على ATP الثاني (COG1423) ، وثلاثة فوتوليازات متوازية (COG1533) ، والعديد من الهليكازات والنوكلياز. من خصائص مختلفة.

توضح حالة الوحدة الفرعية الكبيرة من البدائية البدائية حقيقية النواة بشكل جيد مساهمة أنواع مختلفة من الاستدلال في شرح الجينوم. فشل COGNITOR في تعيين ملف أ. بيرنيكس البروتين لهذا COG. نظرًا لوجود هذه الوحدة الفرعية في كل مكان في euryarchaea وحقيقيات النوى [19] ، ومع ذلك ، ووجود وحدة فرعية صغيرة يمكن اكتشافها بسهولة في أ. بيرنيكس (COG1467) ، تم إجراء تحليل أكثر تفصيلاً عن طريق إجراء عمليات بحث PSI-BLAST مقابل قاعدة بيانات NR مع جميع أعضاء COG الأصلي كطلبات بدء. عندما Archaeoglobus fulgidus تم استخدام تسلسل primase (AF0336) لبدء البحث ، وتم استخدام أ. بيرنيكس تم اكتشاف النظير (APE0667) بالفعل عند مستوى ذي دلالة إحصائية.

هناك حالة مثيرة للاهتمام لإعادة كتابة البروتين بوظيفة حرجة ، والتي أدت أيضًا إلى استنتاجات أكثر عمومية ، وهي uracil DNA glycosylase (UDG COG1573). يتم حاليًا شرح أعضاء COG هذا إما كبوليميراز DNA مفترض (APE0427 from أ. بيرنيكس و AF2277 من A. fulgidus) أو كبروتين افتراضي. ومع ذلك ، فقد تم عرض نشاط UDG تجريبياً للبروتينات المعنية من Thermotoga maritima [20] و A. fulgidus [21]. سبب التعليق التوضيحي الخاطئ كبوليميراز DNA هو الاندماج المستقل لـ uracil DNA glycosylase مع polymerases DNA في العاثية SPO1 وفي يرسينيا بيستيس. على الرغم من أن هذه الاندماجات أعاقت التعليق التوضيحي الصحيح في التحليل الأصلي للجينومات البدائية ، إلا أنها تبدو مفيدة وظيفيًا ، مما يشير إلى أن هذا النوع من UDG يعمل بالاقتران مع بوليميراز الحمض النووي التكراري.وهذا يتفق مع تقرير حديث بأن بوليمرات الدنا البدائية تتعطل في وجود اليوراسيل قبل إساءة دمج الأدينين [22].

عمليات الجمع والطرح والتغييرات في أ. بيرنيكسمجموعة البروتين

إجمالاً ، 1102 من أصل 2694 متوقعة أ. بيرنيكس تم تضمين البروتينات (41 ٪) في COGs ، في حين أن 1404 من 1765 المتوقعة أبيسسي تم تضمين البروتينات (79٪). النسبة المئوية ل أ. بيرنيكس كانت البروتينات المضمنة في COGs أقل بكثير من المتوسط ​​(72٪) لمجموعات البروتينات الأثرية الخمس الأخرى المدرجة حاليًا في قاعدة بيانات COG (الجدول 2). يبدو من المحتمل أن هذا يرجع إلى المبالغة في تقدير العدد الإجمالي لـ ORFs في أ. بيرنيكس الجينوم. العديد من ORFs التي لا تشابه مع البروتينات في قواعد البيانات المتسلسلة (1538 ، أو 57.1٪ [17]) تتداخل مع ORFs من العائلات المحفوظة ، بما في ذلك أعضاء COG. على أساس متوسط ​​تمثيل جميع الجينومات في COGs (67٪) ومتوسط ​​العتائق الأخرى (72٪) ، يمكن للمرء تقدير العدد الإجمالي لـ أ. بيرنيكس البروتينات ما بين 1550 و 1700. يتوافق هذا النطاق مع حجم أ. بيرنيكس الجينوم (1.67 ميجا بايت) بالنظر إلى كثافة الجين لحوالي جين واحد لكل كيلو قاعدة وهو نموذجي للبكتيريا والعتائق. معتبرا أن أ. بيرنيكس هو أول مشهد متسلسل ، وهو أيضًا الهوائي البدائي الوحيد الذي تم تسلسله حتى الآن ، قد يتوقع المرء أن تمثيل أ. بيرنيكس يمكن أن تكون البروتينات في COGs أقل إلى حد ما من متوسط ​​Euryarchaeota. بأخذ 60٪ كتقدير متحفظ ، فإن هذا يضع الحد الأعلى لجينات ترميز البروتين أ. بيرنيكس حوالي 1900. إعادة الإعمار الكامل لملف أ. بيرنيكس البروتيوم خارج نطاق هذا العمل ، ولكن 849 ORFs ، التي تم شرحها في الأصل كبروتينات ، والتي تداخلت بشكل كبير مع أعضاء COG يمكن استبعادها بثقة ، مما يجعل عدد الجينات بحد أقصى 1873.

على الرغم من التمثيل الزائد الواضح لـ ORFs في أ. بيرنيكس، مع ذلك ، أضفنا 28 ORFs لم يتم تحديدها سابقًا والتي تمثل عائلات بروتينية محفوظة ، بما في ذلك البروتينات التي لا غنى عنها وظيفيًا مثل طفرة المشيمية (APE0563a ، COG1605) ، عامل بدء الترجمة IF-1 (APE_IF-1 ، COG0361) ، وسبعة بروتينات ريبوسومية (APE_rpl21E ، COG2139) APE_rps14 ، COG0199 APE_rpl29 ، COG0255 APE_rplX ، COG2157 APE_rpl39E ، COG2167 APE_rpl34E ، COG2174 APE_rps27AE ، COG1998). تم التعرف على هذه الجينات المفقودة من خلال البحث في تسلسل الجينوم المترجم في جميع الإطارات الستة لأعضاء محتملين من COGs مع أنماط سلالة غير متوقعة. على سبيل المثال ، احتوى عامل بدء الترجمة IF-1 COG0361 على بروتين واحد بالضبط من كل نوع من الأنواع الممثلة في COGs ، باستثناء أ. بيرنيكس. بالنظر إلى أهمية هذا البروتين في الترجمة وحفظه عبر جميع الأنواع في COGs ، بدا من غير المحتمل أن يكون مفقودًا من أ. بيرنيكس، وبالفعل ، تم تحديد أخصائي تقويم العظام IF-1 الذي تم الحفاظ عليه بدرجة عالية بسهولة في ترجمة عمليات البحث مع أعضاء COG المعنيين كاستفسارات. ليس بشكل غير متوقع ، كل ما تم تحديده حديثًا أ. بيرنيكس الجينات تشفر البروتينات الصغيرة.

يوضح الحفاظ على جوهر COGs الأثرية ذلك أ. بيرنيكسهو أركيون نموذجي

لأن أ. بيرنيكس هو أول جينوم crenarchaeal يتم تسلسله بالكامل ، كان من المهم التحقق مما إذا كان الجينات البدائية المحفوظة التي تم تحديدها مسبقًا من خلال التحليل المقارن لجينوم euaryarchaea [19] مشتركة أم لا بواسطة crenarchaea. تشير البيانات الواردة في الجدول 3 إلى أن هذا هو الحال بالفعل - في جميع الفئات الوظيفية لـ COGs ، تشتمل غالبية COGs التي تحتوي على ممثلين من جميع الأنواع euryarchaeal الخمسة أيضًا أ. بيرنيكس. تم التوصل إلى استنتاج مشابه جدًا بشكل مستقل في تحليل عنقودي حديث للبروتينات البدائية [23]. جزء من أ. بيرنيكس مجموعة الجينات التي تنتمي إلى هذا اللب المحفوظ ، حوالي 30 ٪ ، تشبه إلى حد بعيد تلك الموجودة في كل من euryarchaea إذا كان عدد أ. بيرنيكس يتم تعديل الجينات كما هو موضح أعلاه (الشكل 2). علاوة على ذلك ، يبدو أن نمط انهيار البروتينات إلى أعضاء من COGs بما في ذلك جميع الأنواع الأثرية ، وتلك الموجودة في COGs مع مجموعة فرعية من الأنواع الأثرية ، وتلك الموجودة في COGs التي لا تحتوي على أنواع أثرية أخرى ، وتلك التي لا تتضمن COGs ، تم حفظها في أ. بيرنيكس وكل من Euryarchaeota ، مما يشير إلى الاتجاهات التطورية المشتركة (الشكل 2).

الأنماط الجينية الرئيسية للبروتينات المتوقعة المشفرة في ستة جينومات بدائية. Af ، Archaeoglobus fulgidus جبل ، الميثانوبكتيريوم الحرارية، بنسلفانيا ، Pyrococcus abyssi Mj ، Methanococcus jannaschii Ph ، بيروكوكوس هوريكوشي أب ، ايروبيروم بيرنيكس. 1 ، أعضاء COGs بما في ذلك جميع الأنواع الأثرية 2 ، وأعضاء COGs بما في ذلك مجموعة فرعية من الأنواع الأثرية 3 ، وأعضاء COGs التي لا تشمل أي أنواع بدائية أخرى ثم المجموعة التي تم تحليلها 4 ، وليس في COGs. يشار إلى النسبة المئوية للبروتينات في كل فئة.

توضح مصفوفة التواجد المشترك للجينومات في COGs (الجدول 4) أن الذخيرة الجينية لـ أ. بيرنيكس تتداخل إلى حد أكبر مع تلك الموجودة في Euryarchaeota مقارنة بتلك الموجودة في البكتيريا أو الخميرة. عادة ، هناك عدد أقل من COGs الشائعة بين أ. بيرنيكس و euryarchaeal من الأنواع الأخيرة ، على الرغم من بعض التواجد التفضيلي أ. بيرنيكس مع نوعي بيروكوكس ملحوظ (الجدول 4). لمزيد من تقييم العلاقات بين الجينومات ، استخدمنا بيانات التواجد المشترك لإنشاء مصفوفة مسافة (انظر قسم المواد والأساليب) ، والتي تم استخدامها بدورها لإنشاء مخطط شجر عنقودي وربط الجوار والأشجار ذات المربع الأقل (الشكل 3). هذا التحليل ليس فقط بشكل لا لبس فيه أ. بيرنيكس داخل المجال الأصلي ، ولكن تم تجميعه مع بيروكوكس الأنواع في مخطط الشجرة العنقودية (الشكل 3 أ) والشجرة المرتبطة بالجوار (الشكل 3 ب) ، على الرغم من أنها ليست في الشجرة ذات المربع الأقل حيث تم وضعها في قاعدة الفرع الأثري وخارج منطقة Euryarchaeota (البيانات غير معروضة). نتيجة هذا النوع من التحليل ، الذي يشبه من الناحية المفاهيمية المحاولات الأخيرة لبناء أشجار تطورية "محتوى الجينات" [24 ، 25 ، 26] ، هو انعكاس مختلط للعلاقات والتشابهات أو الاختلافات الجينية في ذخيرة الجينات المتعلقة بأنماط حياة الكائنات الحية المعنية. يتم توضيح مساهمة العوامل غير التطورية الأخيرة بشكل جيد من خلال تجميع البكتيريا الطفيلية مثل ، على سبيل المثال ، المستدمية النزلية و هيليكوباكتر بيلوري، وهو ما يتعارض مع التقارب الواضح للتطور من السابق مع الإشريكية القولونية، والتفرع العميق للميكوبلازما ، أكثر الطفيليات البكتيرية تدهورًا ، بدلاً من التجمع المبرر نسبيًا مع العصوية الرقيقة (الشكل 3). على نفس المنوال ، يبدو أن تجميع ملفات أ. بيرنيكس مع البيروكوتشي في المقام الأول يعكس بعض الجوانب الشائعة لعملية التمثيل الغذائي الخاصة بهم والتي لم يتم تحديدها بعد. يبدو أيضًا أن مساهمة التبادل الجيني الجانبي التفضيلي في هذه المجموعة ممكنة. بعض الجينات المشتركة أ. بيرنيكس و pyrococci ، باستثناء بقية Euryarchaeota ، تمت مناقشتها أدناه. أ. بيرنيكس لم تظهر أي علاقة أوثق بالخميرة مما فعلته euryarchaea (الجدول 4 والشكل 3 أ ، ب). وهكذا ، على الأقل على مستوى التواجد المشترك في COGs ، أو بعبارة أخرى ، جزء من أطباء تقويم العظام المشتركين ، لا نرى أي دعم لفرضية أصل حقيقيات النوى من crenarchaea [27 ، 28].

تصنيف الجينومات عن طريق التواجد المشترك في COGs. (أ) مخطط الشجرة العنقودية. (ب) شجرة الجار المنضمة. للاختصارات ، راجع قسم المواد والأساليب.

داخل النواة الأثرية المحفوظة ، هناك عدد كبير من الجينات التي تتكون إما من COGs البدائية الفريدة (أمثلة على ذلك موضحة في الجدول 5) أو موجودة بشكل متقطع في بعض الأنواع البكتيرية ، ولكن ليس في حقيقيات النوى. تحظى مجموعات COG هذه بأهمية خاصة من وجهة نظر "النموذج القياسي" لتطور مجالات الحياة الثلاثة ، والذي ينطبق بشكل أساسي على أنظمة معالجة المعلومات في الخلية ويضع جذر الشجرة بين البكتيريا وحقيقيات النوى البدائية [29 ، 30] ، لأنها يمكن اعتبارها تشابكًا مشابكًا تحدد الحالة البدائية (من المرجح أن يفسر التمثيل المتقطع لبعض COGs في البكتيريا عن طريق النقل الأفقي للجينات). تشتمل هذه البروتينات الأثرية المميزة ، على سبيل المثال ، على النوع الأثري من حل تقاطع Holliday ، والوحدة الفرعية ATPase الخاصة بـ TopoVI الخاصة بالأثرية (الجدول 5) و primase الشبيه بـ DnaG مع تنظيم المجال الفريد (COG0358 [19]). إن اكتشاف أن هذه البروتينات مشتركة بين Euryarchaeota و Crenarchaeota أمر مهم لأنه يشير إلى أن الجينات المعنية كانت على الأرجح موجودة في السلف المشترك للعتائق وحقيقيات النوى ، ولكن تم إزاحتها في سلالة حقيقية النواة.

أدى تحليل التسلسل التفصيلي للجينات البدائية الأساسية ، والذي تضمن مقارنة تسلسل البروتين من مجموعات COG المعنية إلى ملفات التعريف المحسوبة مسبقًا لمجالات بروتين معينة ، إلى التنبؤ بأدوار محتملة غير معيّنة سابقًا في الأنظمة المحفوظة لبعض منها. على سبيل المثال ، تحتوي البروتينات في COG1571 على مجالين معترف بهما سابقًا ، وهما مجال OB المرتبط بالحمض النووي المشابه لتلك الموجودة في بروتين RPA المرتبط بـ ssDNA وفي الوحدات الفرعية DNA polymerase من العتائق والبكتيريا [31] و- شريط ربط Zn [32]. يشتمل الجزء amino-terminal من هذه البروتينات على مجال كروي متوقع يحدث أيضًا كبروتين مستقل في بعض euryarchaea ويحتوي على توقيع محفوظ GxDDXD مسبوقًا بحبل ß متوقع. يشير الجمع بين هذا المجال الأنزيمي المحتمل مع مجالين متوقعين لربط الحمض النووي إلى أن أعضاء عائلة البروتين هذه من المحتمل أن يكونوا إنزيمات لها دور مهم في استقلاب الحمض النووي البدائي ، وعلى الأرجح نقل النيوكليوتيديل أو نوكليازات. أعضاء COG1444 عبارة عن بروتينات متعددة المجالات تجمع بين نطاق ATPase الفائق الطرفي الأميني I مع مجال ناقل أسيتيل طرفي كربوكسي. يشير تنظيم المجال هذا إلى دور في نظام النسخ القاعدي باعتباره ناقل أسيتيل معدل للبروتين. من المتوقع أن يقوم COG1094 (مجالات KH + S1) و COG1096 (مجال شريط Si + Zn) بترميز بروتينات ربط RNA التي يمكن أن تشارك في معالجة RNA أو في دور متعلق بالترجمة. يتضمن COG1293 بروتينات محفوظة غير معيّنة يحتمل أن يكون أخصائي تقويم العظام منها العقدية تم شرحه كبروتين مرتبط بالفيبرونيكتين [33]. ومع ذلك ، فإن حفظها وتوزيعها أكثر اتساقًا مع الوظيفة الأساسية الأساسية. تمشيا مع هذا ، اكتشفنا في هذه البروتينات نسخة محددة من وحدة ربط الحمض النووي اللولبي - دبوس الشعر - اللولب الحلزوني ، والتي تشبه على وجه التحديد تلك الموجودة في البروتينات الريبوزومية لعائلة S13 / S18 (LA ، ملاحظات غير منشورة) وتقترح وظيفة لأعضاء COG هذا كبروتين مرتبط بالريبوسوم أو RNA مرتبط أو ، على الأرجح ، مكون غير مميز لنظام إصلاح DNA.

حصيلة COGs التي يتم مشاركتها بواسطة أ. بيرنيكس مع كل نوع من الأنواع الخمسة euryarchaeal ، باستثناء بقية euryarchaea ، يظهر انتشار واضح للارتباط مع pyrococci و A. fulgidus (البيانات غير ظاهرة). بالنظر إلى العدد الأكبر من الجينات في الأخير ، فإن العلاقة مع البيروكوتشي هي الأكثر وضوحًا ، بالاتفاق مع بيانات التجميع المقدمة أعلاه. أ. بيرنيكس وتشترك البيروكوتشي في بعض البروتينات البكتيرية النموذجية ، على سبيل المثال الريبونوكليز E / G ، وإنزيم معالجة الحمض النووي الريبي (COG1530) ، ونظام الانقسام الجليسين (COGs 0403 ، 0404 ، 0509 و 1003). هذا متوافق مع نقل الجينات الأفقي بين هذين السلالتين البدائيتين بعد اكتساب الجين المعني من بكتيريا.

أ. بيرنيكس يُظهر ندرة ملحوظة في إشارات البروتينات ، تشبه في هذا الصدد Methanococcus jannaschii والبكتيريا الطفيلية. أ. بيرنيكس و M. jannaschii لا تحتوي على مجالات هيستيدين كيناز أو PAS أو GAF ، على عكس الميثانوبكتيريوم الحرارية و A. fulgidus، حيث تشكل هذه المجالات أساس نظام الإشارات. هذه المجالات موجودة في pyrococci ، ولكن بأعداد أقل بكثير من الموجودة في M. thermoautotrophicum و A. fulgidus. أ. بيرنيكس, M. jannaschii و pyrococci يشفر أيضًا عددًا قليلاً جدًا من كينازات السيرين / ثريونين ، وتلك الموجودة هي ممثلين محفوظين للغاية لعائلة Ri01 ، والتي من المحتمل أن تشارك في تنظيم النسخ بدلاً من الإشارات النموذجية [34]. لذلك يبدو أن الإشارات التقليدية التي تتم بوساطة الفسفرة يتم اختيارها مقابل في أ. بيرنيكس وغيرها من محبي الحرارة. في المقابل ، كل هذه العتيقة ، بما في ذلك أ. بيرنيكس، تمتلك أعدادًا قابلة للمقارنة من عوامل النسخ المتوقعة ، خاصة تلك الخاصة بفئة اللولب الدوراني الحلزوني [32] ، والتي يمكن لبعضها ربط الجزيئات الصغيرة مباشرةً وتحويل الإشارات إلى مخرجات نسخية.

Crenarchaeota كفرع متميز من الأركيا

على الرغم من التكتل غير المتوقع إلى حد ما مع المكورات الحشرية التي شوهدت في التصنيف القائم على التكرار (الشكل 3) ، يوفر تحليل COG دليلًا على تميز Crenarchaeota كما يمثله أ. بيرنيكس. على المستوى الكمي ، يمكن توضيح ذلك من خلال مقارنة عدد مجموعات COG التي يكون فيها كل نوع من الأنواع البدائية مفقودًا ولكن يتم تمثيل الباقي. يكون عدد مجموعات COG أكبر بشكل ملحوظ في حالة أ. بيرنيكس من كل نوع من أنواع euryarchaeal (الشكل 4). من الناحية النوعية ، فإن عددًا كبيرًا من الجينات الأساسية الظاهرة المحفوظة في euryarchaea مفقود فيها أ. بيرنيكس (الجدول 6). أ. بيرنيكس من المتوقع أن يقوم بترميز البروتينات غير المرتبطة أو ذات الصلة البعيدة التي تؤدي هذه الوظائف (إزاحة الجينات غير المتعامدة [35]). بشكل ملحوظ ، على عكس euryarchaea مع جينومات متسلسلة بالكامل ، أ. بيرنيكس لا يقوم بترميز إنزيمات من جديد مسار التخليق الحيوي البيورين (الجدول 6). إنزيمات التحويل البيني لـ IMP و GMP و AMP موجودة ، ويبدو من المحتمل أن أ. بيرنيكس يعتمد جزئيًا على مسارات الإنقاذ لتكوين نيوكليوتيدات البيورين ، ولكن من المحتمل أيضًا استيراد النيوكليوسيدات و / أو القواعد إلى الخلية. في هذا الصدد، أ. بيرنيكس يشبه البكتيريا الطفيلية مثل جرثومة المعدة, بوريليا برغدورفيرية، و الكلاميديا التي لا تمتلك قدرات التخليق الحيوي البيورين وتستورد النيوكليوسيدات أو القواعد من الوسط المحيط. في المقابل ، فإن جينات مسار التخليق الحيوي للبيريميدين موجودة في أ. بيرنيكس، كما هو الحال في العتائق الأخرى.

لم يتم تمثيل COGs في كل نوع من الأنواع الأثرية مع تضمين أعضاء الأنواع الخمسة المتبقية. ل هوريكوشي بي و أبيسسي، تم السماح بغياب الأنواع الثانية من المكورات الحقلية. للاختصارات ، راجع قسم المواد والطرق.

أ. بيرنيكس يفتقر إلى بعض الإنزيمات المحفوظة المعدلة للحمض النووي الريبي مثل سينثاز pseudouridine الخاص بـ tRNA (COG0101) ، والذي تم اعتباره في كل مكان حتى الآن ، و archaeosine transglycosylase (COG1549). يشير عدم وجود الإنزيم الأخير إلى أن الأركوزين يمكن أن يكون تعديل الحمض النووي الريبي الخاص بـ euryarchaea.

ومن المثير للاهتمام، أ. بيرنيكس يفتقر إلى العديد من البروتينات المحفوظة وميزات بنية المجال التي يتم مشاركتها على وجه التحديد بواسطة euryarchaea و eukaryotes. الغياب الملحوظ بشكل خاص هو وجود وحدتين فرعيتين من بوليميريز الحمض النووي euryarchaeal (الجدول 6). الوحدة الفرعية الكبيرة موجودة فقط في euryarchaea [36] ، في حين أن الوحدة الفرعية الصغيرة ، التي تنتمي إلى عائلة calcineurin الفائقة من phosphoesterases ويتوقع أن تمتلك نشاط الفوسفاتيز ، يتم حفظها في euryarchaea وحقيقيات النوى [37]. على عكس euryarchaea ، فإن بوليميرات الحمض النووي التكراري في أ. بيرنيكس يتم تمثيلها فقط من قبل ثلاثة أفراد شبه متماثل من عائلة B (أحدهم ربما يكون COG0417 معطلاً) ، والتي تشترك فيها البدائيات وحقيقيات النوى [38]. عامل النسخ A (RPA) تقويم العظام (COG1599) من أ. بيرنيكس يحتوي على مجال OB-fold واحد بينما تقوم euryarchaea و eukaryotes بترميز الأشكال مع تكرارات ترادفية متعددة لطي OB والتي تكون أكثر تشابهًا مع بعضها البعض. يحتوي مكون إصلاح الحمض النووي حقيقي النواة ERCC4 وجهاز تقويم العظام الخاص به في euryarchaea على نطاقات هليكاز ونوكلياز من النوع الثاني مدمجين (COG1111 و COG1948 [39]). في المقابل ، crenarchaea أ. بيرنيكس و سلفولوبس تمتلك فقط مجال نوكلياز (ممثل أيضًا في A. fulgidus) ، مع عدم وجود نظير لمجال هليكاز. يتم أيضًا مشاركة مروحيتين متوقعتين لهما وظيفة محتملة في إصلاح الحمض النووي (COG1112 ، وهي عبارة عن مجموعة كبيرة من النوع الأول هيليكس ، و COG1205 ، وهي عبارة عن هليكاز من الفصيلة الثانية مدمجة في مجال نوكلياز متنبأ به يعتمد على المعدن) يتم مشاركتها أيضًا بواسطة euryarchaea وحقيقيات النوى ، مع استبعاد أ. بيرنيكس. آلية النسخ أ. بيرنيكس يُظهر أيضًا العديد من الانحرافات عن النمط العام لحقيقية النواة وحقيقية النواة. عامل النسخ TFIIB من كليهما أ. بيرنيكس و سلفولوبس (COG1405) يحتوي على مجال شريط Zn amino-terminal معطل. لكن، أ. بيرنيكس يقوم بترميز إصدار مستقل من شريط TFIIB Zn (APE0508 ​​في COG1405) والذي يمكن أن يحل محل الإصدار المعطل في العابرة. الأهم من ذلك ، أن الهستونات التي تعمل في صيانة البنية الصبغية وربما أيضًا في النسخ في euryarchaea (COG2036) تفتقر إلى أ. بيرنيكس (انظر الجدول 6 لمزيد من التفاصيل). عامل استطالة بوليميراز الحمض النووي الريبي ELP3 ، الذي يجمع بين مجال سينسيز البيوتين مع مجال هيستون أسيتيلاز ويتم مشاركته بواسطة euryarchaea وحقيقيات النوى (COG1243) ، مفقود في أ. بيرنيكس.

لم تكن مجموعة COG الحالية مناسبة تمامًا لاكتشاف COGs التي يتم تمثيلها حصريًا في crenarchaea وفي حقيقيات النوى لأنه يتم تمثيل نوع واحد فقط من كل من هذه الأصناف. ومع ذلك ، كشف تحليلنا الإضافي عن عدد قليل جدًا من هذه الجينات في أ. بيرنيكس ولم يتم الكشف عن أي اتجاهات تدعم علاقة أسلاف محتملة بين Crenarchaeota وحقيقيات النوى (LA و E.V.K. ، ملاحظات غير منشورة). الوضع الحالي لتحليل الجينوم البدائي ، مع وجود المزيد من السمات "حقيقية النواة" التي تظهر في euryarchaea مقارنةً بالكريناركيا ، لا تقدم أي دعم لـ "فرضية الخلية eocyte" ، التي تفترض أصل حقيقيات النوى من crenarchaea [28]. للحصول على تفسير أكثر تحديدًا للعلاقات التطورية بين البدئيات وحقيقيات النوى ، يلزم وجود تسلسلات جينوم إضافية ، خاصة تلك الموجودة في crenarchaea الأخرى.

ايروبيرومالجينات بدون متماثلات في Euryarchaeota واكتساب الجينات البكتيرية عن طريق النقل الأفقي

48 COGs التي تتضمن ممثلًا من أ. بيرنيكس ولكن ليس من euryarchaea من المرجح أن يعكس اكتساب الجينات البكتيرية عن طريق crenarchaea أو فقدان جينات الأجداد في وقت مبكر من تطور euryarchaea (الجدول 7). قد يكون التمييز الدقيق بين هذين الاحتمالين صعبًا ، ولكن في حالات معينة هناك مؤشرات لصالح أحدهما عندما يكون هناك تشابه واضح بين أ. بيرنيكس البروتين وأخصائيي تقويم العظام من سلالة بكتيرية معينة (الجدول 7). بشكل عام ، يبدو أن نقل الجينات الأفقي هو السيناريو الأكثر منطقية لأصل هذه الجينات في أ. بيرنيكس لأنه لم يتم العثور على أي من الجينات في هذه الـ 48 COGs في جميع البكتيريا وحقيقيات النوى ، ولا يظهر أي منها تقاربًا محددًا مع أخصائيي تقويم حقيقيات النوى. كان العكس يقترح أصل الأجداد.

أبرز مجموعة الجينات الموجودة في أ. بيرنيكس، ولكن ليس في euryarchaea ، يعكس التمثيل الغذائي الهوائي. كطائرة ، أ. بيرنيكس يشفر المجموعة الكاملة من إنزيمات دورة دورة حمض الكربوكسيل (TCA) ، على عكس الإنزيمات اللاهوائية التي تمتلك نسخة مقطوعة من هذا المسار (الجدول 7). بالإضافة الى، أ. بيرنيكس يشفر الإنزيمات الملحقة اللازمة لتشكيل مركب نازعة الهيدروجين البيروفات ، مثل سينثاز ليبوات (COG0320) وليغاز البروتين الدهني (COG0095). طقم من أ. بيرنيكس تتضمن البروتينات المرتبطة بالتنفس والتي لا تُرى في euryarchaea بالإضافة إلى ذلك مكونات محددة لسلسلة نقل الإلكترون مثل السيتوكروم ب، أوكسيديز السيتوكروم ، اختزال النترات ، NADH-ubiquinone oxidoreductase ، NADPH: اختزال الكينون وبروتين Rieske Fe-S.

يتم مشاركة مجموعة من 23 COGs بواسطة أ. بيرنيكس، الخميرة ومجموعة فرعية من البكتيريا ، لاستبعاد euryarchaea. يبدو أن هذه الحالات يمكن تفسيرها بسهولة من خلال الاكتساب الجانبي للجينات من مصدر بكتيري في كل من حقيقيات النوى (بشكل كبير من الميتوكوندريا) و crenarchaea. الإنزيمات المتعلقة بالتنفس المذكورة أعلاه هي حالة واضحة في هذا الصدد ، ولكن هذا التفسير يمكن أن ينطبق أيضًا على الأقل على بعض مجموعات COG القليلة المتبقية في هذه المجموعة ، على سبيل المثال ، RecQ-family هيليكاز (COG0514).

الكشف عن الاختلافات بين الأنواع في Pyrococcus abyssi و هوريكوشي بي

في حالة اثنين من الجينوم المرتبطين ارتباطًا وثيقًا ، مثل جينوم أبيسسي و هوريكوشي بي، يوفر تحليل COG لطرح الجينوم المباشر (الجدول 8). نظرًا للمستوى العالي من حفظ التسلسل بين البروتينات المتعامدة من هذين النوعين (عادةً أكثر من 70٪ هوية) ، يبدو أنه من غير المتوقع إلى حد ما أن تحتوي 80 COGs على بروتينات من أبيسسي، لكن لا هوريكوشي بي، بينما يظهر معكوس في 46 COGs. من المحتمل أن تعكس العديد من هذه الاختلافات فقدان الجينات التفاضلي ، في حين أن البعض الآخر ربما يرجع إلى اكتساب الجينات الأفقية. العدد الأكبر من COGs ذلك أبيسسي ممثلة في ، مع استبعاد هوريكوشي بي، يبدو أنه يعكس الهبة الأيضية الأكبر للأول. على وجه الخصوص ، توجد مسارات الأحماض الأمينية العطرية والتخليق الحيوي للسيستين بالكامل في أبيسسي ولكن ليس في هوريكوشي بي (الجدول 8). في حالة مسار الأحماض الأمينية العطرية ، يبدو أن اتجاه التطور واضح - فقدان الجينات المعنية بواسطة هوريكوشي بي في سياق تكيفه مع نمط الحياة غير المتجانسة الذي يبدو أنه ذهب إلى أبعد من ذلك أبيسسي. ومع ذلك ، فإن حالة مسار السيستين مثيرة للاهتمام بشكل خاص لأنه ، من بين جميع الأركيا التي تتوفر جينوماتها حاليًا ، يتم مشاركتها فقط بواسطة أ. بيرنيكس و أبيسسي تظل آلية تكوين السيستين في euryarchaea الأخرى لغزا [19]. في هذه الحالة ، يبدو أن الحصول على الجينات المعنية من البكتيريا عبر النقل الأفقي هو الاحتمال الأرجح لأن سيناريو فقدان الجينات سيتطلب عدة أحداث مستقلة في euryarchaea. ومن المثير للاهتمام ، أن الاكتساب الأفقي المحتمل للجينات البكتيرية التي تشفر إنزيمات مسار التخليق الحيوي للسيتوزين قد تم وصفه أيضًا في euryarchaeon ميثانوسارسينا باركيري [40]. COGs الأخرى مع التمثيل التفاضلي للاثنين بيروكوكس تميل الأنواع إلى تضمين الجينات المتنقلة بطبيعتها مثل أنظمة تعديل التقييد (الجدول 8).


الآلية الكيميائية هي المهيمنة

هنا ، يتم اختيار الجين السلف لأن بروتينه المشفر يوفر الإستراتيجية الهيكلية لتثبيت الوسائط / حالات الانتقال المطلوبة للتحول الجديد المطلوب [11 ، 12]. أبسط موقف هو أن السلف والإنزيم الجديد يحفزان نفس التفاعل ولكن بخصائص مختلفة ، كما هو الحال بالنسبة لأفراد عائلة سيرين بروتياز المتنوعة [13]. بدلاً من ذلك ، قد يحفز السلف والإنزيم الجديد تفاعلات مختلفة تستخدم نفس النوع من الوسيط ، مثل وسيط enolic في التفاعلات المحفزة بواسطة أعضاء عائلة enolase الفائقة المتنوعة ميكانيكيًا [14]. بغض النظر عن الموقف ، قد يكون السلف "مختلطًا" وقد يحفز مستويات منخفضة من التفاعل الجديد [15 ، 16]. التطور المتباين سيعزز التفاعل المختلط ، ربما على حساب رد الفعل الأصلي. هذه البروتينات المتماثلة هي أعضاء في عائلات فائقة متنوعة ميكانيكيًا.


واجب بيولوجي

أو لن يتم قبوله. لن يتم قبول أي عمل في وقت متأخر! ملحوظة:

قد يتم تعيين واجبات منزلية إضافية

II. مراجعة القسم 75 نقطة.

ثالثا. الفصل الثاني التقييم 40 نقطة

رابعا. يتم توزيع أوراق العمل المصاحبة في فئة 40 نقطة.

الفصل 38 حزمة الواجب المنزلي

التوجيهات: أكمل المهام التالية باستخدام أوراق منفصلة من

ورقة لكل رقم. سيتم تحديد تاريخ استحقاق في تاريخ لاحق. تأكد

لتسليم أوراقك وفقًا للترتيب المحدد أدناه ومع

العناوين المناسبة لكل مهمة. استخدم جمل كاملة عندما

الإجابة على سؤال. يجب أن تكون هذه الورقة مصاحبة لحزمتك في تاريخ الاستحقاق

أو لن يتم قبوله. لن يتم قبول أي عمل في وقت متأخر! ملحوظة:

قد يتم تعيين واجبات منزلية إضافية

II. مراجعة القسم 75 نقطة.

ثالثا. الفصل 38 التقييم 40 نقطة

رابعا. يتم توزيع أوراق العمل المصاحبة في فئة 40 نقطة.

الفصل 7 حزمة الواجب المنزلي

التوجيهات: أكمل المهام التالية باستخدام أوراق منفصلة من

ورقة لكل رقم. سيتم تحديد تاريخ استحقاق في تاريخ لاحق. تأكد

لتسليم أوراقك وفقًا للترتيب المحدد أدناه ومع

العناوين المناسبة لكل مهمة. استخدم جمل كاملة عندما

الإجابة على سؤال. يجب أن تكون هذه الورقة مصاحبة لحزمتك في تاريخ الاستحقاق

أو لن يتم قبوله. لن يتم قبول أي عمل في وقت متأخر! ملحوظة:

قد يتم تعيين واجبات منزلية إضافية

II. مراجعة القسم 75 نقطة.

ثالثا. الفصل السابع التقييم 40 نقطة

رابعا. يتم توزيع أوراق العمل المصاحبة في فئة 40 نقطة.

الفصل 10 / 11.4 حزمة الواجب المنزلي

التوجيهات: أكمل المهام التالية باستخدام أوراق منفصلة من

ورقة لكل رقم. سيتم تحديد تاريخ استحقاق في تاريخ لاحق. تأكد

لتسليم أوراقك وفقًا للترتيب المحدد أدناه ومع

العناوين المناسبة لكل مهمة. استخدم جمل كاملة عندما

الإجابة على سؤال. يجب أن تكون هذه الورقة مصاحبة لحزمتك في تاريخ الاستحقاق

أو لن يتم قبوله. لن يتم قبول أي عمل في وقت متأخر! ملحوظة:

قد يتم تعيين واجبات منزلية إضافية

II. مراجعة القسم 75 نقطة.

ثالثا. الفصل العاشر التقييم 40 نقطة

رابعا. يتم توزيع أوراق العمل المصاحبة في فئة 40 نقطة.

الفصل 8/9 حزمة الواجب المنزلي

التوجيهات: أكمل المهام التالية باستخدام أوراق منفصلة من

ورقة لكل رقم. سيتم تحديد تاريخ استحقاق في تاريخ لاحق. تأكد

لتسليم أوراقك وفقًا للترتيب المحدد أدناه ومع

العناوين المناسبة لكل مهمة. استخدم جمل كاملة عندما

الإجابة على سؤال. يجب أن تصاحب هذه الورقة الحزمة الخاصة بك في تاريخ الاستحقاق

أو لن يتم قبوله. لن يتم قبول أي عمل في وقت متأخر! ملحوظة:

قد يتم تعيين واجبات منزلية إضافية

II. مراجعة القسم 75 نقطة.

ثالثا. الفصل 8/9 التقييم 40 قرشاً

رابعا. يتم توزيع أوراق العمل المصاحبة في فئة 40 نقطة.

الفصل 2 حزمة الواجب المنزلي

التوجيهات: أكمل المهام التالية باستخدام أوراق منفصلة من

ورقة لكل رقم. سيتم تحديد تاريخ استحقاق في تاريخ لاحق. تأكد

لتسليم أوراقك وفقًا للترتيب المحدد أدناه ومع

العناوين المناسبة لكل مهمة. استخدم جمل كاملة عندما

الإجابة على سؤال. يجب أن تصاحب هذه الورقة الحزمة الخاصة بك في تاريخ الاستحقاق

أو لن يتم قبوله. لن يتم قبول أي عمل في وقت متأخر! ملحوظة:

قد يتم تعيين واجبات منزلية إضافية

II. مراجعة القسم 75 نقطة.

ثالثا. الفصل 12 التقييم 40 نقطة

رابعا. يتم توزيع أوراق العمل المصاحبة في فئة 40 نقطة.

الفصل 11 حزمة الواجب المنزلي

التوجيهات: أكمل المهام التالية باستخدام أوراق منفصلة من

ورقة لكل رقم. سيتم تحديد تاريخ استحقاق في تاريخ لاحق. تأكد

لتسليم أوراقك وفقًا للترتيب المحدد أدناه ومع

العناوين المناسبة لكل مهمة. استخدم جمل كاملة عندما

الإجابة على سؤال. يجب أن تكون هذه الورقة مصاحبة لحزمتك في تاريخ الاستحقاق

أو لن يتم قبوله. لن يتم قبول أي عمل في وقت متأخر! ملحوظة:

قد يتم تعيين واجبات منزلية إضافية

II. مراجعة القسم 75 نقطة.

أ. اقرأ الصفحات 35-39263-266 # 1-5

ثالثا. الفصل 11 التقييم 40 نقطة

رابعا. يتم توزيع أوراق العمل المصاحبة في فئة 40 نقطة.

الفصل 3 حزمة الواجب المنزلي

التوجيهات: أكمل المهام التالية باستخدام أوراق منفصلة من

ورقة لكل رقم. سيتم تحديد تاريخ استحقاق في تاريخ لاحق. تأكد

لتسليم أوراقك وفقًا للترتيب المحدد أدناه ومع

العناوين المناسبة لكل مهمة. استخدم جمل كاملة عندما

الإجابة على سؤال. يجب أن تكون هذه الورقة مصاحبة لحزمتك في تاريخ الاستحقاق

أو لن يتم قبوله. لن يتم قبول أي عمل في وقت متأخر! ملحوظة:

قد يتم تعيين واجبات منزلية إضافية

II. مراجعة القسم 75 نقطة.

ثالثا. الفصل الثالث التقييم 40 نقطة

رابعا. يتم توزيع أوراق العمل المصاحبة في فئة 40 نقطة.

الفصل 4 حزمة الواجب المنزلي

التوجيهات: أكمل المهام التالية باستخدام أوراق منفصلة من

ورقة لكل رقم. سيتم تحديد تاريخ استحقاق في تاريخ لاحق. تأكد

لتسليم أوراقك وفقًا للترتيب المحدد أدناه ومع

العناوين المناسبة لكل مهمة. استخدم جمل كاملة عندما

الإجابة على سؤال. يجب أن تصاحب هذه الورقة الحزمة الخاصة بك في تاريخ الاستحقاق

أو لن يتم قبوله. لن يتم قبول أي عمل في وقت متأخر! ملحوظة:

قد يتم تعيين واجبات منزلية إضافية

II. مراجعة القسم 75 نقطة.

ثالثا. الفصل الرابع التقييم 40 نقطة

رابعا. يتم توزيع أوراق العمل المصاحبة في فئة 40 نقطة.

الفصل 15 حزمة الواجب المنزلي

التوجيهات: أكمل المهام التالية باستخدام أوراق منفصلة من

ورقة لكل رقم. سيتم تحديد تاريخ استحقاق في تاريخ لاحق. تأكد

لتسليم أوراقك وفقًا للترتيب المحدد أدناه ومع

العناوين المناسبة لكل مهمة. استخدم جمل كاملة عندما

الإجابة على سؤال. يجب أن تكون هذه الورقة مصاحبة لحزمتك في تاريخ الاستحقاق


1.5: الواجبات - علم الأحياء

1/14/98
تامرين: اقرأ الفصل الأول والصفحات 194-210

1/16/98
خذ سؤال المنزل: لنفترض أنك كنت تعيش في زمن أفيري وزملائه في العمل.

  • أنبوب اختبار لخلايا R الحية
  • أنبوب اختبار لخلايا S. الحية
  • موقد بنسن
  • لوحات أجار
  • أنبوب من DNAse
  • أنبوب من الأنزيم البروتيني
  • أنبوب من RNAase
  • أنبوب من الليباز
  • أنبوب من الجلوكوزيداز

ماذا تتوقع أن تكون النتيجة إذا كانت فرضيتك صحيحة؟

1/19/98
تاميرين: المشاكل المعينة: الفصل 9 ، الصفحة 232: # 4 ، 7 ، 16 ، 17 ، 18 ، 21
قراءة الفصل الرابع عشر ، الصفحات: 390-402

1/21/98
تاميرين: المشاكل المعينة: الفصل 14 ، الصفحة 407: # 1 ، 4 ، 7 ، 14 +15 (أول سؤالين فقط) اقرأ الفصل 3 ، الصفحات 45-60

1/26/98
تاميرين: المشاكل المعينة: الفصل 3 ، الصفحة 64: # 1-7 ، 10 ، 12 ، 15 ، 19 ، 22 ، 24 ، 25 ، 27 ، 28

1/30/98
تاميرين: المشاكل المعينة: الفصل 2 ، الصفحة 39: # 1 ، 9 ، 10 ، 28 ، 29 ، 30 ، 31 ، 32 ، 33 ، 35
اقرأ الفصل 2 ، الصفحات 17-25

2/2/98
مجموعة المشاكل الجينية I
1. في خنازير غينيا ، الفراء الأسود هو المسيطر على الفراء الأبيض. بالنسبة إلى التهجينات التالية ، قم بإدراج الأمشاج التي ينتجها كل من الوالدين والأنماط الجينية والأنماط الظاهرية لسلالة F1.
أ) أسود متماثل الزيجوت × أبيض متماثل


ب) أبيض متماثل الزيجوت × أسود متغاير الزيجوت


ج) أسود متماثل الزيجوت x أسود متغاير الزيجوت


د) أسود متغاير الزيجوت x أسود متغاير الزيجوت

2. تزاوج العديد من خنازير غينيا السوداء من نفس التركيب الوراثي ، وأنتجت 29 ذرية سوداء و 9 ذرية بيضاء. ماذا تتوقع أن تكون الأنماط الجينية للوالدين؟

3. في ذبابة الفاكهة ، يكون الجناح الأثري (عديم الأجنحة) متنحيًا للأجنحة العادية. إذا تم عبور ذبابين متغاير الزيجوت وتم استرداد 100 ذرية ، فكم تتوقع أن تكون بلا أجنحة؟

4. في صليب آخر ، تم عبور الذباب الأثري إلى الذباب الطبيعي. كل ذرية F1 كانت طبيعية.
أ) إذا تم عبور الذباب F1 فيما بينها ، فما هي النسب المتوقعة للنوع الجيني والنمط الظاهري F2؟


ب) ما هي النسب المظهرية والجينية المتوقعة إذا انتقل الذباب F1 إلى الذباب الأثري؟ للذباب العادي متماثل الزيجوت؟

5. عادة ما يتم توريث لون العين البشرية كما لو كانت العيون البنية ناتجة عن عامل مهيمن والأزرق إلى المقابل المتنحي. الرجل ذو العيون الزرقاء يتزوج امرأة بنية العينين والدتها زرقاء العينين. ما هي نسبة الأطفال المتوقع أن يكون لديهم عيون زرقاء؟

6. الريش الحريري في الدواجن ناتج عن جين يكون تأثيره متنحي للريش الطبيعي.
أ) إذا تم تربية 96 طائرًا من تهجين بين أفراد متغاير الزيجوت لهذا الجين ، فكم من المتوقع أن يكون حريريًا وكم عددًا طبيعيًا؟

ب) إذا كان لديك طائر عادي ذو ريش ، فما طريقتان يمكنك تحديد ما إذا كان متماثل الزيجوت أو متخالف الزيجوت؟

7. تمت مقاضاة رجل من فصيلة الدم "ب" من قبل امرأة من فصيلة الدم "أ" بسبب الأبوة. طفل المرأة هو فصيلة الدم O.
أ) إذا كان هذا الرجل هو بالفعل والد هذا الطفل ، فحدد الأنماط الجينية لكلا الوالدين.

ب) إذا كان من المستحيل أن يكون هذا الرجل من المجموعة "ب" أباً لطفل من النوع O ، حدد التركيب الوراثي له.

ج) إذا كان الرجل من فصيلة الدم AB ، فهل يمكن أن يكون أبًا لطفل من المجموعة O؟

ما نوع الميراث الذي يشير إليه السؤال رقم 7؟

8. لون المعطف الأصفر في خنازير غينيا ينتج عن النمط الوراثي متماثل اللواقح CyCy ، واللون الكريمي عن طريق النمط الوراثي متغاير الزيجوت CyCw ، والأبيض عن طريق النمط الوراثي متماثل الزيجوت CwCw. ما هي النسب الوراثية والمظهرية التي من المحتمل أن ينتجها التزاوج بين الأفراد ذوي اللون الكريمي؟

9. في الدجاج ، لون الريش الأسود لا يهيمن تمامًا على الأبيض. في الأفراد غير المتجانسين ، يكون لون الريش رماديًا مزرقًا. حدد إجراء تربية حيث يمكن إنشاء سلالة تربية حقيقية من الدجاج بالريش الأسود من دجاجة رمادية مزرقة ودجاجة بيضاء.

ما نوع الميراث الذي يشير إليه السؤالان رقم 8 و 9؟

تعليمات حول مهام كتابة "علم الوراثة في الأخبار"

ابحث عن مقالتين من الصحف أو المجلات أو الإنترنت الحالية التي تتناول بعض جوانب علم الوراثة.

قم بعمل نسخة واحدة من مقالاتك ، وانشرها على علم الوراثة في لوحة إعلانات الأخبار في مختبر علم الوراثة. (إذا تمت إزالة مصدر المقالة من الصفحة بعد قصها ، فاكتبها في مكان ما في المقالة. مثال- New York Times ، 1-10-98). لوحة الإعلانات موجودة لكي تنظر إليها وتتعرف على بعض أحدث الاكتشافات في علم الوراثة. استفد منه!

لكل مقالتين من مقالاتك ، اكتب تقريرًا من صفحة واحدة يلخص النقاط الرئيسية للمقالة. تأكد من تضمين عنوان ومصدر المقال.

سلم في تقريرك 2 بحلول 25 مارس ، في الصف.

* آمل أن تجعلك هذه المهمة على دراية ببعض التطورات الحالية في مجال علم الوراثة ، وكيف تؤثر الجينات على حياتنا كلها *

2/11/98
Tamerin ، المشاكل المعينة في الفصل 4 ، الصفحة 75: # 6 ، 7 ، 16 ، 17
اقرأ الصفحات 67-73 (تجاوز الجزء المتعلق بنظرية ذات الحدين)

2/13/98
تاميرين ، المشاكل المعينة في الفصل 2 صفحة 39: # 2 ، 3 ، 34 ، 36 ، 37 ، 39 ، 40 ، 42
اقرأ الصفحات 25-35

2 صفتان (ثنائي هجين) غير مرتبطين
1. في خنازير غينيا ، يكون المعطف الأملس (S) هو المسيطر على الطبقة (الطبقات) الخشنة والغطاء الأسود (B) هو المسيطر على المعطف الأبيض (ب). في التقاطع SsBb X SsBb ، كم عدد النسل الذي سيكون له معطف أسود أملس؟ أ) 9 من 16 ب) 1 من 16 ج) 6 من 16 د) كل النسل سيكون له هذا النمط الظاهري

2. في الطماطم ، الفاكهة الحمراء (R) هي المسيطرة على الفاكهة الصفراء (r) والطول (T) هو المسيطر على القصر (t). يتم تهجين النبات الذي هو RrTT مع نبات rrTt. ما هي احتمالات أن يكون النسل متغاير الزيجوت لكلتا الصفتين؟ أ) لا شيء ب) 1/2 ج) 1/4 د) 9/16

3. بالإشارة إلى المعلومات الواردة في السؤال السابق ، إذا تم تهجين نبات ذو التركيب الوراثي RrTt مع نبات rrtt: أ) سيكون كل النسل طويل القامة مع فاكهة حمراء ب) سيكون 12 من أصل 16 طويل القامة مع فاكهة حمراء ج) 8 من أصل 16 سيكون طويلًا مع فاكهة حمراء د) 4 من 16 سيكون طويلًا مع فاكهة حمراء
19. في الخيول ، B = معطف أسود ، ب = معطف بني ، و T = خبب ، t = pacer. خبب أسود له نسل بني هو: أ) BT ب) BbTt ج) bbtt د) Bbtt

4. الشعر الطويل في الأرانب يحكمه الجين السائد (L) والشعر القصير بواسطة أليله المتنحي (l). ينتج الشعر الأسود عن عمل الجين السائد (ب) والبني من الجين المتنحي (ب). في التهجينات التالية ، ضع قائمة بالنسب الوراثية والنمط الظاهري المتوقعة في السلالة. الجينان غير مرتبطين.

أ) LlBb × LlBb
ب) LlBb × رطل
ج) Llbb x LlBb
د) LLBb × رطل

5. بالنظر إلى نفس الجينات المذكورة في المشكلة أعلاه ، ما هي الأنماط الجينية للوالدين في الأبناء التاليين؟

عدد الوالدين من ذرية

طويل أسود طويل بني قصير أسود قصير بني
أسود طويل × أسود طويل 9 4 3 1
أسود طويل × بني قصير 3 4 3 4
أسود طويل × بني قصير 5 0 5 0
أسود طويل × بني قصير 9 0 0 0
طويل بني × بني طويل 0 8 0 3

تقاطعات ثلاثية الهجين
6. ضع في اعتبارك التهجين ثلاثي الهجين: AABBCC x aabbcc ، حيث تكون A و B و C هي المهيمنة. ما هو النمط الجيني لسلالة F1؟ من ذرية F2

7. افترض أن الهجين ثلاثي الهجين AABBrr x aabbRR مصنوع في أنواع نباتية تكون فيها A و B و R. ضع في اعتبارك ذرية F2 من هذا التهجين ، وافترض تشكيلة مستقلة.
أ) كم عدد الفئات المظهرية المتوقعة؟

ب) ما هو احتمال وجود النمط الجيني aabbRR في النسل F2؟

ج) ما هي النسبة التي يُتوقع أن تكون متماثلة اللواقح لجميع الجينات الثلاثة في ذرية F2؟

8. في التهجين AaBbCc x AaBbCc ، حيث تخضع جميع الجينات لتشكيلة مستقلة ، ما هي نسبة النسل المتوقع أن تكون متغايرة الزيجوت لجميع الجينات الأربعة؟

التفاعلات الجينية التي تنتج أنماطًا ظاهرية جديدة
9. في الدواجن ، تعطي جينات مشط الورد ومشط البازلاء (P) ، إذا وجدت معًا ، مشط الجوز. الأليلات المتنحية لكل جين ، عندما تكون موجودة معًا في حالة متماثلة اللواقح ، تعطي مشطًا واحدًا. ماذا ستكون خصائص المشط لنسل الصلبان التالية؟

أ) RRPp x rrPp
ب) rrPP x RrPp
ج) Rrpp x rrPp
د) RrPp x RrPp
ه) Rrpp x Rrpp

10. بالنسبة إلى التهجينات التالية التي تتضمن خاصية المشط في الدواجن ، حدد الأنماط الجينية للوالدين:
أ) الجوز المتقاطع مع نسل واحد ينتج عنه 1/4 من الجوز ، 1/4 وردة ، 1/4 حبة البازلاء ، و 1/4 مفردة.

ب) الوردة المتقاطعة مع الجوز تنتج ذرية 3/8 منها الجوز ، 3/8 وردة ، 1/8 حبة البازلاء ، و 1/8 مفردة.

ج) الوردة المتقاطعة مع البازلاء تنتج خمسة من الجوز وستة نسل من الورود.

د) حبة الجوز مع الجوز تنتج وردة واحدة ، واثنين من الجوز ، ونسل واحد.

رعاف
11. في الأرانب ، هناك حاجة إلى إنزيم واحد (نتاج جين وظيفي A) لإنتاج مادة ضرورية للسمع. هناك حاجة إلى إنزيم آخر (نتاج الجين الوظيفي B) لإنتاج مادة أخرى مطلوبة أيضًا للسمع. لا ترتبط الجينات المسؤولة عن الإنزيمين. الأفراد المتماثلون لأي من الأليلات المتنحية غير الوظيفية أو كلاهما ، أ أو ب ، أصم.

أ) إذا تم إجراء عدد كبير من التزاوج بين اثنين من متغاير الزيجوت ، فما النسبة المظهرية المتوقعة في النسل؟

ب) ما هي النسبة المظهرية التي يمكن توقعها إذا تم تزاوج الأرانب متجانسة الزيجوت المتنحية للسمة A ومتغايرة الزيجوت للصفة B مع الأرانب غير المتجانسة لكلتا الصفتين؟

12. ضع في اعتبارك المسار الكيميائي الحيوي لتركيب الأنثوسيانين الصباغ الأرجواني في أزهار نباتات البازلاء.

وسيطة عديمة اللون X -----------------> وسيطة عديمة اللون Y -------------------
رموز الجين C الجين P.
رموز إنزيم للإنزيم
مطلوب في هذه الخطوة المطلوبة في هذه الخطوة

------> أنثوسيانين الصباغ الأرجواني

عندما تم عبور الوالدين Ccpp x ccPP ، أعطى كل ذرية F1 أزهارًا أرجوانية. لم يتم العثور على نسبة F2 ثنائية الهجين النموذجية 9: 3: 3: 1. ما هي النسبة المظهرية التي تم العثور عليها في F2؟

2/18/98
المشاكل المعينة لـ Tamerin الصفحة 98: # 1 ، 9 ، 10 (تخطي أ) ، 17 ، 18 ، 20 ، 24 ، 25
اقرأ الفصل الخامس

2/23/98
المشاكل المعينة لـ Tamerin الصفحة 98: # 7 ، 8 (a-f) ، 16 (فقط أ)

2/27/98
المشاكل المعيّنة لـ Tamerin الصفحة 134: # 1 ، 5 ، 6 ، 24 ، 25 ، 26
اقرأ الفصل السادس الصفحات 104-113
مشاكل النشرات حول الارتباط الجيني في حقيقيات النوى

3/16/98
القراءات المعينة في Tamerin: الفصل 2 ، ص 35-38 الفصل 11 ، ص 270-271 الفصل 10 ، ص 234 الفصل 9 ، ص 211-230

3/18/98
Tamerin Assigned Problems chp 2 page 41: # 24، 25، 26
الفصل 9 ص 231-232: # 1، 5، 9، 10، 11، 12، 13، 22

3/23/98
اقرأ الفصل 10
الصفحات 267-268 مشاكل تاميرين: # 3 ، 4 ، 6 ، 7 ، 8 ، 18 ، 23 ، 24 ، 25 ، 26 ، 27 ، 28 ، 30 ، 31 ، 34

3/30/98
اقرأ الفصل 11
الصفحات 302-304 المشاكل المعينة لـ Tamerin: # 1 ، 5-8 ، 11-13 ، 15-19 ، 24-27 ، 29 ، 30

4/1/98
اقرأ الفصل 16 تامرين ص 458-478

4/8/98
المشاكل المعيّنة لـ Tamerin صفحة 487: # 14-18
ابدأ بقراءة الفصل 12

4/15/98
مشاكل في النشرات-الإجابات المنشورة في المختبر

4/17/98
مسائل Tamerin المعينة pgs 347-351: # 1، 2، 4، 5، 7، 8 (only a)، 10-12، 14، 17، 22 (only a)، 23، 26، 28، 32، 39

4/24/98
اقرأ الفصل 13 تامرين ، مشاكل الصفحة 382: # 1 ، 4 ، 11 ، 19 ، 20 ، 21 ، 26


تتكون National 5 Biology من الوحدات التالية:

الوحدة الأولى بيولوجيا الخلية

  • هيكل الخلية
  • النقل عبر أغشية الخلايا
  • الحمض النووي وإنتاج البروتينات
  • البروتينات والإنزيمات
  • الهندسة الوراثية
  • التنفس

الوحدة 2 الكائنات متعددة الخلايا

  • إنتاج خلايا جديدة - الخلايا الجذعية والانقسام
  • السيطرة والتواصل داخل الجسم
  • متوتر
  • هرمونات
  • التكاثر
  • الاختلاف والميراث
  • مصانع أنظمة النقل
  • أنظمة النقل الحيوانات

الوحدة 3 الحياة على الأرض

  • النظم البيئية
  • توزيع الكائنات الحية
  • البناء الضوئي
  • الطاقة في النظم البيئية
  • إنتاج الغذاء
  • تطور الأنواع

مهمة

بالإضافة إلى الوحدات الثلاث ، سيكون هناك أيضًا واجب (يساوي 25 درجة ويساهم بخمسة درجات امتحانك النهائي). ستشمل المهمة اختيار مجال موضعي من علم الأحياء للتحقيق والبحث ، وسيتم كتابة هذا كمهمة كتاب مفتوح خاضع للإشراف بناءً على الأبحاث التي تم إجراؤها.


ماجستير العلوم في علم الأحياء

حول برنامج الماجستير

برنامج الماجستير في علم الأحياء هو برنامج مدته سنتان يجب على الطالب فيه إكمال مجموعة الدورات الأساسية المطلوبة والدورات الاختيارية الإضافية. من المتوقع أن يتوج البرنامج الأكاديمي بأطروحة. خلال الفصل الدراسي الأول من البرنامج ، يجب على الطالب اختيار مستشار رئيسي يساعده في اختيار المقررات الاختيارية. سيرأس المستشار الرئيسي اللجنة الاستشارية للطالب للأطروحة. سيتعين اختيار عضوين إضافيين من اللجنة الاستشارية للخريجين الخاصة بالطالب.

يمكن أن يوفر برنامج الدراسات العليا خلفية قوية للدراسة المستقبلية في برنامج الدكتوراه. كما يوفر تدريبًا للخريجين كتحضير للدراسات المهنية في الطب أو طب الأسنان أو غيرها من مجالات العلوم الصحية. يتم أيضًا إعداد الطلاب الحاصلين على درجة الماجستير في علم الأحياء لمهنة في التدريس و / أو البحث.

تم جدولة العديد من فصول الدراسات العليا لاستيعاب الطلاب في وقت متأخر بعد الظهر والمساء.

متطلبات القبول

متطلبات القبول كطالب دراسات عليا مصنف هي درجة البكالوريوس في علم الأحياء أو مجال ذي صلة بمتوسط ​​تقدير لا يقل عن 2.75 في آخر 60 فصلًا دراسيًا (90 ربعًا) من وحدات عمل القسم العلوي ، وإكمال متطلبات التقييم كتابة التخرج ( GWAR) على مستوى الدراسات العليا وإكمال دورات تعادل درجة CSU Dominguez Hills في علم الأحياء. على وجه التحديد ، يجب أن يكون الطالب قد أكمل دورة من الدرجة العليا في كل مجال من مجالات المواد المدرجة أدناه بدرجة "B" أو أفضل.

موضوع النقاش

فسيولوجيا الحيوان أو الإنسان أو الميكروبات

يمكن قبول الطلاب الذين لا يستوفون جميع هذه المتطلبات كطالب ثان في البكالوريا أثناء إكمالهم للمتطلبات. يمكن قبول الطلاب الذين يستوفون جميع المتطلبات باستثناء واحد كطالب دراسات عليا مصنف بشكل مشروط وفقًا لتقدير لجنة الدراسات العليا في علم الأحياء. يجب أن يستوفوا أي شروط بحلول نهاية السنة الأولى في هذا الوضع.

يتم اتخاذ القرار النهائي بشأن القبول في برنامج الدراسات العليا من قبل لجنة الدراسات العليا في علم الأحياء.

إجراءات القبول

يجب على طلاب الدراسات العليا المحتملين:

1. تقديم طلب إلى الجامعة للقبول (أو إعادة القبول) مع وضع الخريجين ، والنصوص الرسمية لجميع أعمال الكلية السابقة باتباع الإجراءات الموضحة في قسم القبول في كتالوج الجامعة.

2. إرسال إلى منسق برنامج الدراسات العليا في علم الأحياء ، NSM A-143 ، CSU Dominguez Hills ، 1000 E. Victoria St.، Carson، CA 90747.

  1. مجموعة ثانية من النصوص الرسمية
  2. خطاب يصف الاهتمامات والأهداف والتوقعات في متابعة درجة الماجستير في علم الأحياء
  3. ثلاثة خطابات توصية يتم إرسالها مباشرة من الأفراد الذين يمكنهم تقييم إمكانات الدراسات العليا
  4. التحقق من إكمال متطلب تقييم كتابة التخرج (GWAR) إما عن طريق اجتياز امتحان كتابة التخرج (GWE) بدرجة ثمانية أو أعلى أو اجتياز دورة معتمدة بدرجة "B" أو أفضل ، قبل أن يكمل الطالب 9 وحدات فصل دراسي
  5. تطبيق الإدارات.

متطلبات الدرجة (30 وحدة)

تتطلب درجة الماجستير في العلوم في علم الأحياء إكمال 30 وحدة ، يجب أن يكون 15 منها على الأقل خريجين (500 مستوى) دورات في علم الأحياء.

أ.المقررات المطلوبة (19 وحدة):

BIO 421. علم الأحياء الجزيئي المتقدم (3) أو

بيو 440. علم الوراثة الجزيئية (3)

بيو 501. الأدب البيولوجي (3).

BIO 503. الأجهزة البيولوجية (3)

بيو 520. التطورات في الخلية والبيولوجيا الجزيئية (3)

بيو 590. ندوة الدراسات العليا (2 ، 2)

اختر مما يلي:

  1. دورات الدراسات العليا الأخرى (مستوى 500) في علم الأحياء. يمكن استخدام الدورة المطلوبة التي يُشار إليها على أنها قابلة للتكرار كدورة تدريبية مطلوبة وكمادة اختيارية.
  2. دورات في القسم العلوي (مستوى 400) في علم الأحياء.
  3. بيو 597. القراءة الموجهة (1-3)
  4. بيو 598. البحوث الموجهة (1-3)
  5. بيو 599. الرسالة (1-4)

ملحوظة: يمكن للطلاب الذين يكملون أطروحة حساب تسع وحدات كحد أقصى من BIO 597 و BIO 598 و BIO 599 معًا. ومع ذلك ، لا يجوز تطبيق أكثر من ست وحدات من BIO 599 على الدرجة.

4. أي من الدورات التالية:

320 هكم: الكيمياء الفيزيائية 1 (5)

451 هكم مختبر الكيمياء الحيوية 1 (1)

452 هكم الكيمياء الحيوية 2 (4)

453 هكم مختبر الكيمياء الحيوية الثاني (2)

يجب على الطلاب أخذ جميع الدورات في غضون خمس سنوات من تاريخ التخرج. إذا تمت الموافقة من قبل لجنة الدراسات العليا وعميد الدراسات العليا ، يجوز للطالب إعادة التحقق من عدد محدود من الدورات. ومع ذلك ، لا يمكن تحت أي ظرف من الظروف إعادة المصادقة على الدورة التي تستغرق أكثر من سبع سنوات قبل التخرج وحسابها في البرنامج.

درجات

مطلوب متوسط ​​عام "B" في الدورات في برنامج الطالب ويجب أن يتم اجتياز جميع الدورات بدرجة "B-" أو أعلى.

يجب على كل طالب اختيار مستشار رئيسي لإرشادهم في برنامجهم. سيختار الطالب والمستشار الرئيسي كليتين أخريين لتعمل كلجنة الدراسات العليا للطالب. يجب أن يكون اثنان على الأقل من اللجنة ، بما في ذلك الرئيس ، من أعضاء هيئة التدريس من قسم الأحياء CSUDH. عند الحاجة إلى خبرة إضافية ، قد يكون العضو الثالث عضو هيئة تدريس من قسم آخر ، أو مؤسسة أكاديمية أخرى.

الأطروحة مناسبة لجميع الطلاب وضرورة لأولئك الذين يخططون لمهنة في البحث ويخططون لمواصلة برنامج الدكتوراه. سيقوم الطالب ومستشاره الرئيسي بإعداد اقتراح من صفحة واحدة أو صفحتين على أساس فرضية لبحث الأطروحة جنبًا إلى جنب مع الجدول الزمني الذي لا يزيد عن عامين حتى الانتهاء. يجب أيضًا الموافقة على هذا الاقتراح من قبل العضوين الآخرين في لجنة أطروحة الطالب وتقديمه إلى لجنة الدراسات العليا في علم الأحياء للمراجعة والموافقة.

عند الانتهاء من الرسالة وقبولها ، سيقوم الطالب ومستشاره بترتيب دفاع شفهي عن الرسالة. عادة ما يتخذ هذا شكل ندوة يتم دعوة أعضاء هيئة التدريس والطلاب والجمهور لحضورها.

د- استمرار حالة الطالب

يجب على الطلاب الحفاظ على التسجيل المستمر طوال فترة وجودهم في برنامج الدراسات العليا. سيتعين على الطلاب الذين يتغيبون عن الفصل الدراسي إعادة التقديم للجامعة والبرنامج.

يمكن للطلاب الذين أكملوا عملهم الدراسي ويعملون على أطروحتهم التسجيل في دورة BIO 600 Graduate Continuation Course (0 وحدة) للحفاظ على الحضور المستمر. يجب أن يتم تسجيل الطلاب في الفصل الدراسي الذي يتخرجون فيه.

ه. سياسة برنامج الدراسات العليا في علم الأحياء بشأن إعادة التحقق من عمل الدورة التدريبية التي عفا عليها الزمن

يشترط قسم الأحياء أن يتم الانتهاء من جميع أعمال الدورة التي يتم إجراؤها في برنامج درجة الماجستير خلال السنوات الخمس التي تسبق تاريخ التخرج مباشرة.

قد يتم طلب إعادة التحقق من عمل الدورة التي عفا عليها الزمن من مكتب الدراسات العليا بالجامعة من خلال منسق الدراسات العليا في علم الأحياء. يُقصد بالعمل المقرر الذي عفا عليه الزمن الدورات التي تم إكمالها قبل خمس سنوات ، ولا تزيد عن سبع سنوات ، قبل تاريخ التخرج مباشرة. يجب أن يكون الطلب مصحوبًا باستدعاء من لجنة الدراسات العليا في علم الأحياء يتحقق من قيام الطالب بأحد الإجراءات التالية:

  1. أعادوا الدورة واجتازوها بدرجة "ب" أو أفضل
  2. اجتاز الاختبارات وأكمل مهام الدورة كما هو معروض حاليًا وحصل على درجة "B" أو أعلى
  3. حصل واجتاز قسمًا خاصًا من الكتاب الشامل المكتوب والذي يغطي محتويات الدورة.

يخضع اختيار طريقة إعادة التحقق لتقدير لجنة الدراسات العليا في علم الأحياء.

إذا تم قبول الطالب على أنه مصنف بشكل مشروط ، فيجب عليه أو عليها استيفاء شروط تصنيف الموقف بحلول نهاية السنة الأولى بعد القبول. يجب على الطالب تقديم طلب للحصول على مكانة سرية إلى عميد الدراسات العليا ، الذي سيرسل الطلب إلى منسق الدراسات العليا في علم الأحياء. للحصول على مكانة سرية ، يجب أن يكون لدى الطالب:

  1. أكمل جميع الدورات والمتطلبات الأساسية بما في ذلك GWAR
  2. متوسط ​​درجة 3.0 أو أعلى في جميع الدورات التي تم أخذها في CSUDH وحصلت على درجة B- أو أفضل في جميع الدورات.

ز. الترشح للترشح

يتم تقديم طلب التقدم للترشح عندما يكمل الطالب معظم أعمال الدورة وينتهي من الأطروحة. يتم تقديم الطلب من خلال منسق الدراسات العليا في علم الأحياء ويجب أن يتم قبل أن يتمكن الطالب من إكمال الأطروحة. سوف يسرد هذا التطبيق برنامج الطالب للدورات والمتطلبات الأخرى التي يجب إكمالها للحصول على الدرجة.

  1. مكانة مصنفة
  2. أكمل جميع الدورات المطلوبة
  3. حصل على GRE بحلول الفصل الدراسي الذي يتقدم فيه للتخرج
  4. حافظ على معدل تراكمي لا يقل عن 3.0 وحصل على درجة B- أو أفضل في جميع الدورات التي تم الحصول عليها في برنامج الدراسات العليا
  5. الموافقة على اقتراح أطروحته من قبل مستشار الدراسات العليا واللجنة.

يرسل منسق برنامج الخريجين طلب الترشيح إلى عميد الكلية وعميد الدراسات العليا الذي يحيله إلى وحدة التخرج في مكتب المسجل. يتم استخدامه للتحقق من الدرجة بعد أن يقدم الطالب استمارة طلب التخرج إلى مكتب المسجل.

بالإضافة إلى متطلبات البرنامج ، يجب على الطلاب استيفاء جميع متطلبات الجامعة للحصول على درجة الماجستير. يجب على الطلاب الرجوع إلى قسم الكتالوج بعنوان "متطلبات الحصول على درجة الماجستير".


1.5: الواجبات - علم الأحياء

وصف الدورة التدريبية: دورة معملية تغطي الجوانب العملية لتحديد التركيب البلوري للبروتين بواسطة التصوير البلوري بالأشعة السينية. على وجه التحديد ، سيحدد الطلاب بنية بروتيناز K ، إنزيم 28 كيلو دالتون ، عن طريق تنفيذ جميع خطوات تجربة بلورية نموذجية: التبلور ، والتحقق من مشتقات الذرة الثقيلة ، وجمع البيانات وتقليلها ، وتحديد مجموعة الفضاء ، وحل موضع الثقيل. مواقع الذرة ، وحساب مراحل MIRAS ، وتفسير كثافة الإلكترون ، وصقل نماذج الهيكل والتحقق من صحتها ، وعمل أشكال توضيحية. سوف يجتمع الطلاب في مجموعات صغيرة ، مرة واحدة في الأسبوع عن طريق التعيين لمدة 1.5-2 ساعة. سيتم إعطاء خمس مهام للتحقق من فهم مواد الدورة التدريبية وإعداد الطالب لنشر مقال في مجلة علم البلورات. تختلف مواقع الاجتماعات من أسبوع لآخر كما هو مذكور أدناه.

عندما يُطلب منك اسم تسجيل الدخول وكلمة المرور ، يرجى الرجوع إلى المنهج الذي تلقيته في اليوم الأول من الفصل.

M230D LAB MATERIALS: الإجراءات التجريبية ومواد القراءة المقترحة:

مواد القراءة / المشاهدة المقترحة:
1) فيديو مختبر ما قبل البلورة. مايكل صوايا 1/5/2021

2) ما يجب أن يعرفه عالم البلورات عن البروتين قبل بدء تجارب التبلور بواسطة مايكل صوايا.
3) سلامة الذرة الثقيلة والاختيار والفحص بقلم مايكل صوايا (2000).
4) فحص الذرات على مراحل في علم بلورات البروتين بواسطة Boggon & amp Shapiro (2000).
التجارب التي أجريت في المعمل:
1) تبلور بروتين K ومعقد مع PMSF
2) فحص مشتقات الذرة الثقيلة بواسطة الرحلان الكهربائي للهلام الأصلي
3) تحضير مشتقات الذرة الثقيلة

مواد القراءة المقترحة:
1) استراتيجيات جمع البيانات بواسطة Zbigniew Dauter (1999).
2) محتوى المذيبات في بلورات البروتين بواسطة B.W. ماثيوز (1968).
الأنشطة في المعمل:
1) فيديو بتقنية Cryo-crystallographic (ملف WMV 65 ميجا بايت ، مفتوح باستخدام Windows Media Player)
2) تدرب على إزالة وتخزين البلورات لرحلة السنكروترون
3) الشروع في جمع البيانات

مواد القراءة المقترحة:
1) الفصل 6 (صفحة 101-127) من جعل علم البلورات واضحًا تمامًا بواسطة جيل رودس.
الأنشطة في المعمل:
1) التعرف على أوامر يونكس البسيطة.
2) حساب خرائط باترسون المتشابه والشاذة.
تعيينات: تقارير باترسون مستحقة الأسبوع التالي

مواد القراءة المقترحة:
1) الفصل 6 (صفحة 101-127) من جعل علم البلورات واضحًا تمامًا بواسطة جيل رودس.
الأنشطة في المعمل:
1) التدرج مع MLPhaRe
2) التسطيح بالمذيبات
3) اختار اليد الصحيحة
4) حساب كثافة الإلكترون
5) كثافة العرض باستخدام "COOT"
تعيينات: التقارير المرحلية المستحقة الأسبوع التالي

مواد القراءة المقترحة:
1) التفسير لخريطة كثافة الإلكترون بواسطة T. A. Jones و M. Kjeldgaard.
الأنشطة في المعمل:
1) كثافة حلزونات ألفا وخيوط بيتا.
2) تعيين تسلسل البروتين للكثافة
3) تشغيل وتقييم برنامج تتبع السلسلة التلقائي
تعيينات: تقارير البناء النموذجي مستحقة في الأسبوع التالي

مواد القراءة المقترحة:
1) لا شيء حتى الآن.
الأنشطة في المعمل:
1) حساب فرق فورييه لخرائط كثافة الإلكترون.
2) تقويم الخرائط
3) صقل الهيكل
4) قم بتشغيل Procheck و Verify3D و Errat
تعيينات: تقارير الهيكل النهائية المستحقة الأسبوع التالي


شاهد الفيديو: الأحياء - الصف الثانى الثانوى - مراحل الهضم في الانسان (كانون الثاني 2022).