معلومة

ب 5. تنشيط البروتياز والبروتيازوم - علم الأحياء


يحتمل أن يكون البروتياز خطيرًا إذا لم يتم تنظيم نشاطهم. من الطرق الشائعة لتجنب نشاط الأنزيم البروتيني غير المرغوب فيه تنشيط الإنزيم من مادة غير نشطة تسمى زيموجين. يؤدي التحلل البروتيني المحدود ولكن المنظم للبروتين الإنزيم إما عن طريق بروتياز مختلف أو عن طريق تحلل البروتين الذاتي إلى تنشيط نشاط التحلل البروتيني للزايموجين. أحد الأمثلة المهمة هو تنشيط procaspases إلى الكاسبيسات النشطة ، والتي هي عبارة عن بروتياز السيستين المنشط بالكالسيوم والتي تعتبر متجانسة. تفعيل الكاسبيز يبدأ موت الخلية المبرمج. وجدت الخلايا السرطانية الخالدة طرقًا لمنع تنشيط procaspase. ومن ثم فإن علاج السرطان المحتمل يمكن أن ينطوي على تنشيط المخدرات التي يسببها procaspases. استخدم Wolan et فحصًا عالي الدقة لتحديد المركبات التي تعزز تنشيط procaspase-3 في الظروف والتركيزات الفسيولوجية. تم العثور على عشرات المركبات لتعزيز هذا النشاط ، وتم استكشاف قدرتها على تنشيط إنزيمات أخرى مماثلة في عائلة procaspase. يبدو أن الكاسبيسات النشطة في حالة توازن بين حالة نشطة وحالة غير نشطة أكثر تشابهًا مع الزيموجين غير النشط. الدواء الصغير الذي يرتبط بشكل تفضيلي بالحالة النشطة من شأنه أن يحول التوازن من الحالة غير النشطة إلى الحالة النشطة. وبالمثل ، فإنه قد يرتبط بـ zymogen غير النشط ويعزز التشكل "النشط" للـ zymogen مما يؤدي إلى التنشيط الفعلي للـ zymogene عن طريق التحلل الذاتي للبروتين. اكتشف Wolan et al أن procaspase كان قادرًا على الخضوع لتغيير توافق مع إضافة منشط جزيء صغير محدد (يُشار إليه باسم 1541) مما جعل التشكل "on (النشط)" أكثر احتمالية ، وبالتالي شجع التنشيط الذاتي.

تم العثور على البروتياز في كل من خارج الخلية (الجهاز الهضمي والدم والمصفوفة خارج الخلية) والغشاء والمواقع داخل الخلايا. كما ذكرنا سابقًا ، يتمثل أحد أدوار البروتياز داخل الخلايا في تحطيم البروتينات "القديمة" والتالفة كيميائيًا. أحد أنواع البروتياز الرئيسية المشاركة في مثل هذا التحلل البروتيني داخل الخلايا هو معقد البروتين الكبير المسمى البروتيازوم. تتكون من ثلاثة هياكل كبيرة

  • مجمع واحد 700000 ميغاواط 20S يحتوي على 14 وحدة فرعية مختلفة مرتبة في 4 حلقات من 7 وحدات فرعية (نسختان من كل وحدة فرعية). الحلقات مكدسة على بعضها البعض. تحتوي الحلقتان الخارجيتان على وحدات فرعية α بينما تحتوي الحلقتان الأوسطتان على وحدات فرعية. يحدث الانقسام المعتمد على ATP لركائز البروتين داخل المجمع ، حيث تعمل مجموعات N الطرفية Ser أو Thr OH كأنواع نيوكليوفيل.
  • مجمعان 19S يغطيان طرفي مجمع 20S (لا يختلف عن هيكل مجمع E. Coli chaperone GroEL / ES.

يجب أولاً تعديل البروتينات المخصصة للانقسام بواسطة البروتيازوم كيميائيًا من خلال ربط نسخ متعددة من بروتين يوبيكويتين الذي يبلغ 8500 ميغاواط ، وهو بروتين شديد الحفظ موجود في كل مكان في حقيقيات النوى. (قمنا بنمذجة هذا البروتين في المختبر الأول باستخدام VMD و NAMD.) تشكل مجموعة الكربوكسيل لبقايا Gly الطرفية C من يوبيكويتين رابطًا أميدًا إلى مجموعة أمين السلسلة الجانبية لبقايا Lys في البروتين المستهدف للتحلل. الرابط الناتج هو رابطة إيزوببتيد لأن الطرف N للبروتين المستهدف لا يستخدم في رابطة الأميد. تشارك ثلاثة بروتينات مختلفة في ubiqutinylation للبروتين المستهدف ، بما في ذلك E1 (إنزيم منشط يوبيكويتين الذي يتطلب ATP) و E2 (إنزيم يوبيكويتين المترافق) و E3 (يوبيكويتين بروتين لياز). بمجرد إرفاقها ، يمكن لسلسلة جانبية Lys of ubiquitin أن تشكل رابطة إيزوببتيد أخرى لمجموعة كربوكسيل C- الطرفية من يوبيكويتين آخر ، وتشكل سلسلة يوبيكويتين متنامية على البروتين المستهدف. البروتينات التي تحتوي على 4 أو أكثر من يوبيكويتين مرتبطة هي ركائز أفضل للبروتيازوم. يبدو أن البروتينات ذات فترات نصف العمر القصيرة (تلك التي تحتوي على بعض الأحماض الأمينية الطرفية مثل الأرجينين أو الليوسين ، أو المخصب في Pro (P) و Glu (E) و Ser (S) و Thr (T) - (PEST) أفضل أهداف مسار اليوبيكويتين والتدهور اللاحق بواسطة البروتيازوم.

يرتبط نشاط البروتيازوم ارتباطًا وثيقًا بالصحة والمرض. يحدث الدور الرئيسي للبروتوزوم في التعرف المناعي على الذات وغير الذات. يجب أن يكون الجهاز المناعي قادرًا على التعرف على الخلية المصابة بالفيروس أو الورم (الخلايا الذاتية التي تعبر عن بروتينات غريبة أو شاذة) وكذلك الخلايا الغريبة مثل البكتيريا ، والتي يمكن أن تبتلعها الخلايا المناعية مثل البلاعم. تحدث مشاركة البروتوزوم عندما تتحلل البروتينات الفيروسية أو الورمية أو البكتيرية إلى ببتيدات قصيرة ، والتي تربط بروتينات التوافق النسيجي الرئيسية بين الخلايا وتنتقل إلى غشاء الخلية. تُعرض معقدات الببتيد / معقد التوافق النسيجي الكبير على سطح الخلية ويتم التعرف عليها بواسطة المستقبلات الموجودة على الخلايا المناعية (على وجه التحديد الخلايا التائية). لا تتعرف الخلايا التائية على الخلايا الذاتية لأن الببتيدات في الببتيد: مجمع MHC عبارة عن ببتيدات ذاتية مشتقة من بروتينات طبيعية. يتعرف مستقبل الخلايا التائية على المحددات لكل من بروتين معقد التوافق النسيجي الكبير والببتيد المقدم.

الرسوم المتحركة لمعالجة البروتين وعرض الببتيدات بواسطة بروتينات معقد التوافق النسيجي الكبير على سطح الخلية

الرسوم المتحركة HHMI لليوبيكويتين والبروتيازوم

عدم التعرف على الببتيد الذاتي: تمنع مجمعات معقد التوافق النسيجي الكبير جهاز المناعة من استهداف الخلايا السليمة الطبيعية. تنشأ أمراض المناعة الذاتية عندما يتعرف مستقبل الخلايا التائية على الببتيدات الذاتية المقدمة.

تم ربط مسارات اليوبيكويتين / البروتيازوم بمظاهر المرض في العديد من الأمراض العصبية التنكسية مثل الزهايمر ومرض هنتنغتون (الذي يتضمن الطي الشاذ لبروتين هنتنغتون الذي يحتوي على مجال بولي جلو موسع) ومرض باركنسون. يشارك مسار التحلل في العديد من الوظائف الخلوية العادية الأخرى بما في ذلك نسخ الجينات وموت الخلايا المبرمج.

جمول: بروتيازوم الثدييات المحدثة - (1IRU) جمول 14 (جافا) | JSMol (HTML5)


بيولوجيا النظم: تطوير طرق كمية وعالية الإنتاجية لدراسات تدهور البروتين

التحدي الشائع لدراسة علم الأحياء هو تعقيد الكائنات الحية وعدم الخطية للتفاعلات بين المكونات. الأساليب الكمية وعالية الإنتاجية التي عززت ، إلى حد كبير ، النجاح الكبير للبيولوجيا الجزيئية في العقود القليلة الماضية ، تسمح بالتنقل في تعقيد المكونات الجزيئية في الكائن الحي بمعلومات دقيقة لفهم الخصائص على مستوى النظام الملازمة لبيولوجيته. المهام. ومع ذلك ، توجد قيود على هذه الأساليب وسرعان ما أصبحت عقبة رئيسية أمام زيادة فهم النظم البيولوجية. كمثال بارز ، فإن معظم الطرق عالية الإنتاجية ، على سبيل المثال المصفوفات الدقيقة والتسلسل العميق وتنميط الريبوسوم ، التي تهدف إلى فهم التعبير الجيني تعمل على طول العقيدة المركزية ، مع التركيز على النسخ والترجمة. كما يتضح من العديد من الدراسات المقارنة ، فإن وفرة البروتين والرنا المرسال تظهر فقط مستوى منخفض إلى متواضع من الارتباط ، خاصة بالنسبة للبروتينات منخفضة الوفرة المخصبة بعوامل تنظيمية مهمة.

نحن ملتزمون بتطوير طرق كمية وعالية الإنتاجية من خلال التقاط وسيطة التحلل في مراحل فسيولوجية مختلفة لتسهيل الاكتشافات الوظيفية والميكانيكية فيما يتعلق بتدهور البروتين.


البروتياز 14 الخاص بـ Ubiquitin هو هدف علاجي جديد لعلاج الأمراض

مراسلة جينغ جاو ، قسم علم وظائف الأعضاء وبيولوجيا الخلية ، جامعة ولاية أوهايو ، 333 10th Ave ، Graves Hall 2166D ، كولومبوس ، أوهايو 43065 ، الولايات المتحدة الأمريكية.

Haichun Ma ، قسم التخدير ، المستشفى الأول بجامعة جيلين ، جامعة جيلين ، رقم 71 شارع شينمين ، تشانغتشون ، 130021 جيلين ، الصين.

قسم علم وظائف الأعضاء وبيولوجيا الخلية ، جامعة ولاية أوهايو ، كولومبوس ، أوهايو ، الولايات المتحدة الأمريكية

قسم علم وظائف الأعضاء وبيولوجيا الخلية ، جامعة ولاية أوهايو ، كولومبوس ، أوهايو ، الولايات المتحدة الأمريكية

مراسلة جينغ جاو ، قسم علم وظائف الأعضاء وبيولوجيا الخلية ، جامعة ولاية أوهايو ، 333 10th Ave ، Graves Hall 2166D ، كولومبوس ، أوهايو 43065 ، الولايات المتحدة الأمريكية.

Haichun Ma ، قسم التخدير ، المستشفى الأول بجامعة جيلين ، جامعة جيلين ، رقم 71 شارع شينمين ، تشانغتشون ، 130021 جيلين ، الصين.

قسم التخدير ، المستشفى الأول بجامعة جيلين ، تشانغتشون ، جيلين ، الصين

قسم التخدير ، المستشفى الأول بجامعة جيلين ، تشانغتشون ، جيلين ، الصين

مراسلة جينغ جاو ، قسم علم وظائف الأعضاء وبيولوجيا الخلية ، جامعة ولاية أوهايو ، 333 10th Ave ، Graves Hall 2166D ، كولومبوس ، أوهايو 43065 ، الولايات المتحدة الأمريكية.

Haichun Ma ، قسم التخدير ، المستشفى الأول بجامعة جيلين ، جامعة جيلين ، رقم 71 شارع شينمين ، تشانغتشون ، 130021 جيلين ، الصين.

قسم علم وظائف الأعضاء وبيولوجيا الخلية ، جامعة ولاية أوهايو ، كولومبوس ، أوهايو ، الولايات المتحدة الأمريكية

قسم علم وظائف الأعضاء وبيولوجيا الخلية ، جامعة ولاية أوهايو ، كولومبوس ، أوهايو ، الولايات المتحدة الأمريكية

مراسلة جينغ جاو ، قسم علم وظائف الأعضاء وبيولوجيا الخلية ، جامعة ولاية أوهايو ، 333 10th Ave ، Graves Hall 2166D ، كولومبوس ، أوهايو 43065 ، الولايات المتحدة الأمريكية.

Haichun Ma ، قسم التخدير ، المستشفى الأول بجامعة جيلين ، جامعة جيلين ، رقم 71 شارع شينمين ، تشانغتشون ، 130021 جيلين ، الصين.

الملخص

البروتياز 14 الخاص بـ Ubiquitin (USP14) هو بروتياز خاص باليوبيكويتين يرتبط بالبروتيازوم ويلعب أدوارًا مهمة في الوظائف الخلوية ، والعدوى الفيروسية ، والاستجابات الالتهابية ، والأمراض التنكسية العصبية ، وتكوين الأورام. يبدو أن USP14 له وظيفة مزدوجة في تنظيم تدهور حال البروتين داخل الخلايا. يعيق USP14 تحلل البروتينات المنتشرة عن طريق إزالة سلاسل يوبيكويتين من ركائزها ، في حين أنه يمكن أن يعزز تدهور البروتين من خلال زيادة تنشيط البروتياز. أظهرت أدلة متزايدة أن USP14 متورط أيضًا في تنظيم الالتهام الذاتي. وبالتالي ، قد يعمل USP14 كمنظم رئيسي في مسارين رئيسيين لتحلل البروتين داخل الخلايا: نظام يوبيكويتين - البروتوزوم (UPS) والالتهام الذاتي. شجعت الأدوار المهمة لـ USP14 في العديد من الأمراض على تطوير مضادات USP14 القابلة للتطبيق سريريًا. تلخص هذه المراجعة الحالة الحالية للمعرفة حول تنظيم تعبير USP14 ونشاطه ووظائفه في العمليات الفسيولوجية والمرضية.


شكر وتقدير

يتم دعم AC من قبل: مؤسسة سرطان البروستاتا (PCF) إسرائيل - برنامج مراكز الامتياز - مؤسسة العلوم الإسرائيلية - برنامج مراكز الامتياز وهو أستاذ ممول من قبل صندوق أبحاث السرطان الإسرائيلي (ICRF) بالولايات المتحدة الأمريكية ومؤسسة تعزيز البحث في التخنيون. تم شراء معدات البنية التحتية للعمل التجريبي في مركز السرطان وبيولوجيا الأوعية الدموية ، كلية الطب ومعهد الأبحاث في رابابورت ، معهد التخنيون الإسرائيلي للتكنولوجيا ، حيفا ، إسرائيل ، بدعم من صندوق وولفسون الخيري - مركز التميز للدراسات حول دوران البروتينات الخلوية وآثارها على الأمراض التي تصيب الإنسان.


يؤدي تثبيط البروتوزوم إلى تنشيط جميع أفراد عائلة عامل الصدمة الحرارية

تشارك بروتينات الصدمة الحرارية والمرافقون الجزيئي في عمليات التمثيل الغذائي الخلوي المختلفة بما في ذلك تخليق البروتين وتدهوره. ترتفع هذه التعبيرات عند مستوى النسخ عن طريق تراكم البروتينات غير الطبيعية عند حدوث اضطراب في عمليات التمثيل الغذائي هذه. تشير الأعمال الحديثة إلى تحريض بروتينات الصدمة الحرارية بواسطة مثبط البروتيازوم. لتوضيح آلية هذا الاستقراء ، قمنا بفحص تنشيط عوامل نسخ الصدمة الحرارية بواسطة مثبطات البروتوزوم في خلايا الطيور. تم إنتاج تنشيط اثنين من العوامل المحفزة للصدمة الحرارية ، HSF1 و HSF3 ، عن طريق معالجة الخلايا بمثبطات البروتوزوم. لم ينتج هذا التنشيط عن طريق العلاج بمختلف مثبطات الأنزيم البروتيني الأخرى. تم حظر تنشيط HSF بواسطة مثبطات البروتوزوم تمامًا في وجود مثبط تخليق البروتين cycloheximide. بشكل غير متوقع ، تم تنشيط العامل المرتبط بالتنمية HSF2 أيضًا بواسطة مثبطات البروتوزوم ، مع زيادة مستوى البروتين. تشير هذه النتائج إلى أن مسار ubiqutin-proteasome قد ينظم جميع HSFs الثلاثة من خلال التحكم في مستوى بعض العوامل التنظيمية لـ HSF أو HSF نفسه ، بالإضافة إلى التحكم في البروتينات غير الطبيعية.


تغيير هيكل البروتوزوم والوظيفة والأكسدة في العضلات المسنة

المؤلف المراسل: Deborah A. Ferrington، Department of Ophthalmology، 380 Lions Research Building، 2001 6th Street S.E.، University of Minnesota، Minneapolis، MN 55455. E-mail: [email protected]

قسم طب وجراحة العيون ، جامعة مينيسوتا ، مينيابوليس ، مينيسوتا

قسم الطب الفيزيائي وإعادة التأهيل ، جامعة مينيسوتا ، مينيابوليس ، مينيسوتا

قسم الطب الفيزيائي وإعادة التأهيل ، جامعة مينيسوتا ، مينيابوليس ، مينيسوتا

قسم طب وجراحة العيون ، جامعة مينيسوتا ، مينيابوليس ، مينيسوتا

المؤلف المراسل: Deborah A. Ferrington، Department of Ophthalmology، 380 Lions Research Building، 2001 6th Street S.E.، University of Minnesota، Minneapolis، MN 55455. E-mail: [email protected]

قسم طب وجراحة العيون ، جامعة مينيسوتا ، مينيابوليس ، مينيسوتا

قسم الطب الفيزيائي وإعادة التأهيل ، جامعة مينيسوتا ، مينيابوليس ، مينيسوتا

قسم الطب الفيزيائي وإعادة التأهيل ، جامعة مينيسوتا ، مينيابوليس ، مينيسوتا

نبذة مختصرة

البروتيازوم هو البروتياز الرئيسي الذي يعمل على تحطيم البروتينات المؤكسدة. سألنا عما إذا كانت وظيفة البروتوزوم المتغيرة تساهم في تراكم بروتينات العضلات المؤكسدة مع تقدم العمر. تمت مقارنة بنية البروتيازوم والوظيفة وحالة الأكسدة في العضلات الهيكلية سريعة النتوء سريعة الفئران F344BN. في المتجانسات المخصبة بالبروتوزوم من العضلات المسنة ، لاحظنا زيادة بمقدار ضعفين إلى ثلاثة أضعاف في محتوى البروتوزوم 20S الذي كان ناتجًا عن زيادة مقابلة في مناعة المناعة. تم تقليل محتوى البروتينات التنظيمية ، PA700 و PA28 ، بالنسبة إلى 20S بنسبة 75 ٪ مع تقدم العمر. عند إضافة PA700 الخارجية ، كانت هناك زيادة مضاعفة في التحلل المائي للببتيد في العضلات المسنة ، مما يشير إلى أن المحتوى الداخلي لـ PA700 غير كافٍ للتفعيل الكامل لـ 20S. أظهرت مقاييس النشاط التحفيزي انخفاضًا بنسبة 50٪ في نشاط معين للمجانسات المخصبة بالبروتوزوم مع تقدم العمر. مع تنقية 20S ، كان نشاط البروتيازوم مكافئًا بين الأعمار ، مما يشير إلى أن المنظمات الداخلية تثبط البروتوزوم في العضلات المسنة. لوحظ تحلل أقل بكثير للكالموديولين المؤكسد بحلول 20 ثانية من الشيخوخة العضلية. الإنقاذ الجزئي للنشاط لعمر 20S بواسطة DTT يعني أكسدة السيستين المهمة وظيفيًا. توضح هذه النتائج تغييرات كبيرة مرتبطة بالعمر في بنية البروتياز ، ووظيفتها ، وحالة الأكسدة التي يمكن أن تمنع إزالة البروتينات المؤكسدة.


هيكل ووظيفة البروتيازوم 26S

كنقطة نهاية لنظام ubiquitin-proteasome ، فإن البروتيازوم 26S هو آلة التحلل البروتيني الرئيسية المسؤولة عن تدهور البروتين المنظم في الخلايا حقيقية النواة. تتراوح الوظائف الخلوية للبروتوزوم من التوازن البروتيني العام واستجابة الإجهاد إلى التحكم في العمليات الحيوية مثل انقسام الخلايا ونقل الإشارة. لمعالجة جميع البروتينات المقدمة إليه في البيئة الخلوية المعقدة بشكل موثوق ، يجب أن يجمع البروتيازوم بين الاختلاط العالي والانتقائية الاستثنائية للركيزة. ألقت الدراسات الهيكلية والبيوكيميائية الحديثة الضوء على العديد من الخطوات المتضمنة في معالجة الركيزة الأولية ، بما في ذلك التعرف ، وإزالة التكوُّن ، والانتقال والتكشف المدفوعين بالـ ATP. بالإضافة إلى ذلك ، كشفت هذه الدراسات عن مشهد توافقي معقد يضمن الاختيار المناسب للركيزة قبل أن يلتزم البروتيازوم بالتدهور التشغيلي. مهدت هذه التطورات في فهمنا للآلية المعقدة للبروتيزوم المسرح للدراسات المستقبلية حول كيفية عمل البروتوزوم كمنظم رئيسي للبروتينات حقيقية النواة.


ب 5. تنشيط البروتياز والبروتيازوم - علم الأحياء

يتم توفير جميع المقالات المنشورة بواسطة MDPI على الفور في جميع أنحاء العالم بموجب ترخيص وصول مفتوح. لا يلزم الحصول على إذن خاص لإعادة استخدام كل أو جزء من المقالة المنشورة بواسطة MDPI ، بما في ذلك الأشكال والجداول. بالنسبة للمقالات المنشورة بموجب ترخيص Creative Common CC BY ذي الوصول المفتوح ، يمكن إعادة استخدام أي جزء من المقالة دون إذن بشرط الاستشهاد بالمقال الأصلي بوضوح.

تمثل الأوراق الرئيسية أكثر الأبحاث تقدمًا مع إمكانات كبيرة للتأثير الكبير في هذا المجال. يتم تقديم الأوراق الرئيسية بناءً على دعوة فردية أو توصية من المحررين العلميين وتخضع لمراجعة الأقران قبل النشر.

يمكن أن تكون ورقة الميزات إما مقالة بحثية أصلية ، أو دراسة بحثية جديدة جوهرية غالبًا ما تتضمن العديد من التقنيات أو المناهج ، أو ورقة مراجعة شاملة مع تحديثات موجزة ودقيقة عن آخر التقدم في المجال الذي يراجع بشكل منهجي التطورات الأكثر إثارة في العلم. المؤلفات. يوفر هذا النوع من الأوراق نظرة عامة على الاتجاهات المستقبلية للبحث أو التطبيقات الممكنة.

تستند مقالات اختيار المحرر على توصيات المحررين العلميين لمجلات MDPI من جميع أنحاء العالم. يختار المحررون عددًا صغيرًا من المقالات المنشورة مؤخرًا في المجلة ويعتقدون أنها ستكون مثيرة للاهتمام بشكل خاص للمؤلفين أو مهمة في هذا المجال. الهدف هو تقديم لمحة سريعة عن بعض الأعمال الأكثر إثارة المنشورة في مجالات البحث المختلفة بالمجلة.


ب 5. تنشيط البروتياز والبروتيازوم - علم الأحياء

يتم توفير جميع المقالات المنشورة بواسطة MDPI على الفور في جميع أنحاء العالم بموجب ترخيص وصول مفتوح. لا يلزم الحصول على إذن خاص لإعادة استخدام كل أو جزء من المقالة المنشورة بواسطة MDPI ، بما في ذلك الأشكال والجداول. بالنسبة للمقالات المنشورة بموجب ترخيص Creative Common CC BY ذي الوصول المفتوح ، يمكن إعادة استخدام أي جزء من المقالة دون إذن بشرط الاستشهاد بالمقال الأصلي بوضوح.

تمثل الأوراق الرئيسية أكثر الأبحاث تقدمًا مع إمكانات كبيرة للتأثير الكبير في هذا المجال. يتم تقديم الأوراق الرئيسية بناءً على دعوة فردية أو توصية من المحررين العلميين وتخضع لمراجعة الأقران قبل النشر.

يمكن أن تكون ورقة الميزات إما مقالة بحثية أصلية ، أو دراسة بحثية جديدة جوهرية غالبًا ما تتضمن العديد من التقنيات أو المناهج ، أو ورقة مراجعة شاملة مع تحديثات موجزة ودقيقة عن آخر التقدم في المجال الذي يراجع بشكل منهجي التطورات الأكثر إثارة في العلم. المؤلفات. يوفر هذا النوع من الأوراق نظرة عامة على الاتجاهات المستقبلية للبحث أو التطبيقات الممكنة.

تستند مقالات اختيار المحرر على توصيات المحررين العلميين لمجلات MDPI من جميع أنحاء العالم. يختار المحررون عددًا صغيرًا من المقالات المنشورة مؤخرًا في المجلة ويعتقدون أنها ستكون مثيرة للاهتمام بشكل خاص للمؤلفين أو مهمة في هذا المجال. الهدف هو تقديم لمحة سريعة عن بعض الأعمال الأكثر إثارة المنشورة في مجالات البحث المختلفة بالمجلة.


Adams J 2003 إمكانية تثبيط البروتوزوم في علاج السرطاناكتشاف المخدرات اليوم 8 307–315

Adrain C و Creagh E M و Cullen S P و Martin S J 2004 تثبيط معتمد على Caspased لوظيفة البروتوزوم أثناء موت الخلية المبرمج فيذبابة الفاكهة ورجلJ. بيول. تشيم. 279 36923–36930

Apcher G S و Heink S و Zantopf D و Kloetzel P M و Schmid H P و Mayer R J و Kruger E 2003 يتفاعل فيروس نقص المناعة البشرية -1 Tat مع الوحدات الفرعية المتميزة لألفا وبيتاFEBSLett. 553 200–204

Arendt C S and Hochstrasser M 1999 Eukaryotic 20S بروبتيدات الوحدة الفرعية التحفيزية البروتيازوم تمنع تعطيل الموقع النشط عن طريق الأستلة الطرفية N وتعزز تجميع الجسيماتEMBO J. 18 3575–3585

Arrigo A P و Tanaka K و Goldberg A L و Welch W J 1988 هوية جسيم "prosome" 19S مع مجمع البروتياز الكبير متعدد الوظائف لخلايا الثدييات (البروتيازوم)الطبيعة (لندن) 331 192–204

Arthur J S و Elce J S و Hegadorn C و Williams K و Greer P A 2000 اختلال جين الوحدة الفرعية الصغيرة لفأر الفئران ، Capn4: calpain ضروري للتطور الجنيني ولكن ليس لنمو الخلايا وانقسامهامول. زنزانة. بيول. 20 4474–4481.

Barton LF و Cruz M و Rangwala R و Deepe G S Jr و Monaco J J 2002 تنظيم التعبير عن الوحدة الفرعية المناعيةفي الجسم الحي بعد العدوى الفطرية المسببة للأمراضJ. إمونول. 169 3046–3052

Barton LF و Runnels H A و Schell T D و Cho Y و Gibbons R و Tevethia S S و Deepe G S Jr و Monaco J J 2004 العيوب المناعية في 28 كيلو دالتون المنشط البروتيني للفئران التي تعاني من نقص جاماJ. إمونول. 172 3948–3954.

Benaroudj N و Goldberg A L 2000 PAN ، النوكليوتيداز المنشط للبروتياز من البكتيريا القديمة ، هو مرافق جزيئي يتكشف البروتيننات. زنزانة. بيول. 2 833–839

Benaroudj N و Zwickl P و Seemuller E و Baumeister W و Goldberg A L 2003 التحلل المائي ATP بواسطة المركب التنظيمي البروتيني PAN يخدم وظائف متعددة في تدهور البروتينمول. زنزانة 11 69–78

Berndt C و Bech-Otschir D و Dubiel W و Seeger M 2002 نظام Ubiquitin: التشويش في اسم الغطاءبالعملة. بيول. 12 R815-R817

Brown M S و Ye J و Rawson R B و Goldstein J L 2000 التحلل البروتيني داخل الغشاء المنظم: آلية تحكم محفوظة من البكتيريا إلى البشرزنزانة 100 391–398

Burri L و Hockendorff J و Boehm U و Klamp T و Dohmen R J و Levy F 2000 تحديد وتوصيف بروتين ثديي يتفاعل مع سلائف البروتيازوم 20Sبروك. ناتل. أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 97 10348–10353

Cardozo T and Pagano M 2004 The SCF ubiquitin ligase: نظرة ثاقبة على الآلة الجزيئيةنات. القس مول. زنزانة. بيول. 5 739–751

Chu-Ping M و Slaughter C A و Demartino G N 1992 تنقية وتوصيف مثبط بروتين لـ 20S proteasome (macropain)بيوتشيم. بيوفيز. اكتا 1119 303–311

Chandu D و Nandi D 2002 من البروتينات إلى الببتيدات إلى الأحماض الأمينية: الجينوميات المقارنة للإنزيمات المشاركة في أحداث المصب أثناء تحلل البروتين الخلويتطبيق جينوم. بروتين. 4 235–252

Chandu D و Nandi D 2004 علم الجينوم المقارن والأدوار الوظيفية للبروتياز المعتمد على ATP Lon و Clp أثناء تدهور البروتين الخلويالدقة. ميكروبيول. 155 710–719

Chen P and Hochstrasser M 1996 أزواج معالجة الوحدة الفرعية ذاتية التحفيز تشكيل موقع نشط في البروتيازوم 20S لإكمال التجميعزنزانة 86 961–972

Ciechanover A و Hod Y و Hershko A 1978 مكون متعدد الببتيد مستقر للحرارة لنظام التحلل البروتيني المعتمد على ATP من الخلايا الشبكيةبيوتشيم. بيوفيز. الدقة. كومون. 81 1100–1105

Ciechanover A و Finley D و Varshavsky A 1984 اعتماد Ubiquitin على تدهور البروتين الانتقائي الذي يظهر في دورة خلية الثدييات المتحولة ts85زنزانة 37 57–66

Ciechanover A و Ben-Saadon R 2004 التواجد الطرفي N: ينضم المزيد من ركائز البروتيناتجاهات خلية بيول. 14 103–106

Ciechanover A و Iwai K 2004 نظام يوبيكويتين: من الآليات الأساسية إلى سرير المريضالحياة IUBMB 56 193–201

Cuervo A M و Palmer A و Rivett A J و Knecht E 1995 تدهور البروتيازومات بواسطة الجسيمات الحالة في كبد الفئرانيورو. J. Biochem. 227 792–800

Dahlmann B و Kopp F و Kuehn L و Niedel B و Pfeifer G و Hegerl R و Baumeister W 1989 إن بروتيناز متعدد التحفيز (prosome) موجود في كل مكان من حقيقيات النوى إلى البكتيريا البدائيةFEBS ليت. 251 125–131

داروين K H ، Ehrt S ، Gutierrez-Ramos J C ، Weich N و Nathan C F 2003 البروتيازوم منالسل الفطري مطلوب لمقاومة أكسيد النيتريكعلم 302 1963–1966

Darwin K H و Lin G و Chen Z و Li H و Nathan C F 2005 توصيف aالسل الفطري متماثل البروتوزومال ATPaseمول. ميكروبيول. 55 561–571

تؤثر De M و Jayarapu K و Elenich L و Monaco J J و Colbert R A و Griffin T A 2003 Beta 2 propeptides على تجميع البروتيازوم التعاونيJ. بيول. تشيم. 278 6153–6159

Dick T P، Ruppert T، Groettrup M، Kloetzel P M، Kuehn L، Koszinowski U H، Stevanovic S، Schild H and Rammensee H G 1996 تؤدي الانقسامات المزدوجة المنسقة التي يسببها المنظم البروتيازومي PA28 إلى روابط MHC المهيمنةزنزانة 86 253–262

Etlinger J D and Goldberg A L 1977 نظام بروتيني قابل للذوبان يعتمد على ATP مسؤول عن تحلل البروتينات غير الطبيعية في الخلايا الشبكيةبروك. ناتل. أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية. 74 54–58

Enenkel C و Lehmann A و Kloetzel P M 1998 يشير التوزيع الخلوي للبروتيازومات إلى موقع رئيسي لتدهور البروتين في شبكة المغلف النووي ER في الخميرةEMBOJ. 17 6144–6154

Elsasser S and Finley D 2005 تسليم ركائز منتشرة إلى آلات تكشف البروتيننات. سيلبيول. 7 742–749

Fabunmi R P و Wigley W C و Thomas P J و DeMartino G N 2000 نشاط وتنظيم البروتيازوم المرتبط بالجسيم المركزيJ. بيول. تشيم. 275 409–413

Fehling H J و Swat W و Laplace C و Kuhn R و Rajewsky K و Muller U و von Boehmer H 1994 تعبير MHC من الفئة الأولى في الفئران التي تفتقر إلى الوحدة الفرعية البروتياز LMP-7علم 265 1234–1237

Fenteany G و Standaert R F و Lane W S و Choi S و Corey E J و Schreiber S L 1995 تثبيط أنشطة البروتياز وتعديل ثريونين الأميني الخاص بالوحدة الفرعية بواسطة اللاكتاسيستينعلم 268 726–731

Finley D و Ciechanover A و Varshavsky A 1984 القابلية الحرارية لإنزيم تنشيط اليوبيكويتين من دورة خلية الثدييات المتحولة ts85زنزانة 37 43–55

Förster A و Whitby F G و Hill C P 2003 يتميز مسام البروتيازومات 20S المنشط بتشكيل متماثل مرتب بسبعة أضعافEMBOJ. 22 4356–4364

Förster A و Masters E I و Whitby F G و Robinson H و Hill C P 2005 البنية 1.9 Å لمركب منشط aproteasome-11S وآثاره على تفاعلاتproteasome-PAN / PA700مول. زنزانة 18 589–599

يتم تجميع بروتيازوم Frentzel S و Pesold-Hurt B و Seelig A و Kloetzel P M 1994 20 S عبر مجمعات سليفة مميزة. تتم معالجة البروتينات الأولية LMP2 و LMP7 في مجمعات سابقة للبروتين 13-16 ثانيةجيه مول. بيول. 236 975–981

يشكل كل من Gaczynska M و Osmulski P A و Gao Y و Post M J و Simons M 2003 Proline والببتيدات الغنية بالأرجينين فئة جديدة من مثبطات التباين في نشاط البروتيازالكيمياء الحيوية 42 8663–8670.

Gao Y و Lecker S و Post MJ و Hietaranta AJ و Li J و Volk R و Li M و Sato K و Saluja AK و Steer ML و Goldberg AL و Simons M 2000 تثبيط ubiquitin-proteasome pathway I kappa B alpha بواسطة ببتيد طبيعي مضاد للبكتيرياJ. كلين. استثمار. 106 439–448.

Glickman M H و Rubin D M و Fried V A و Finley D 1998 الجسيم التنظيمي لـخميرة الخميرة معقد بروتيني في الخليةمول. زنزانة. بيول. 18 3149–3162

Goldstein J L 2004 العلم الشاهق: أوقية من الإبداع تستحق الكثير من التأثيرنات. ميد. 10 1015–1016

Griffin T A و Nandi D و Cruz M و Fehling H J و Kaer L V و Monaco J J و Colbert R A 1998 التجمع المناعي: التضمين التعاوني للوحدات الفرعية القابلة للتحفيز من الإنترفيرون جاما (IFN-gamma)ياء إكسب. ميد. 187 97–104

Griffin T A و Slack J P و McCluskey T S و Monaco J J و Colbert R A 2000 تحديد البروتيسسمبلين ، وهو متماثل للثدييات لبروتين الخميرة ، Ump1p ، المطلوب للتجميع الطبيعي للبروتيازمول. زنزانة. بيول. الدقة. كومون. 3 212–217

Groll M و Ditzel L و Lowe J و Stock D و Bochtler M و Bartunik H D و Huber R 1997 هيكل 20S Proteasome من الخميرة بدقة 2.4 درجةالطبيعة (لندن) 386 463–470

Groll M و Heinemeyer W و Jager S و Ullrich T و Bochtler M و Wolf D H و Huber R 1999 المواقع التحفيزية لبروتيازوم 20S ودورها في نضج الوحدة الفرعية: دراسة طفرية وبلوريةبروك. ناتل. أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 96 10976–10983

Groll M و Kim K B و Kairies N و Huber R و Crews C M 2000 التركيب البلوري للإيبوكسوميسين: 20S proteasome يكشف عن انتقائية الباسيفور الجزيئي لـ alpha "beta" - مثبطات epoxyketone proteasomeجيه. تشيم. شركة 122 1237–1238

Groll M and Huber R 2004 مثبطات الجسيمات الأساسية البروتيازوم حقيقية النواة 20S: نهج هيكليبيوكيم. بيوفيز. اكتا 1695 33–44

Grune T و Jung T و Merker K و Davies K J 2004 انخفاض تحلل البروتين الناتج عن تكتلات البروتين وأجسام التضمين واللويحات والدهون الدهنية والسيرويد و "aggresomes" أثناء الإجهاد التأكسدي والشيخوخة والمرضكثافة العمليات J. Biochem. زنزانة. بيول. 36 2519–2530

Grziwa A و Maack S و Puhler G و Wiegand G و Baumeister W و Jaenicke R 1994 تفكك وإعادة تكوين البروتيازوم الحرارييورو. J. Biochem. 223 1061–1067

Guo G G و Gu M و Etlinger J D 1994 240-kDa مثبط البروتوزوم (CF-2) مطابق لنزعة حمض دلتا أمينوليفولينكJ. بيول. تشيم. 269 12399–12402

Harbers K، Muller U، Grams A، Li E، Jaenisch R and Franz T 1996 دمج Provirus في الجين الذي يشفر إنزيم يوبيكويتين المترافق يؤدي إلى خلل في المشيمة وفتك للجنينبروك. ناتل. أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 93 12412–12417

Harris J L ، Alper P B ، Li J ، Rechsteiner M and Backes B J 2001 خصوصية الركيزة للبروتيازوم البشريتشيم. بيول. 8 1131–1141

Heink S و Ludwig D و Kloetzel P و Kruger E 2005 التكيف المناعي الناجم عن IFNγ لنظام البروتياز هو استجابة سريعة وعابرةبروك. ناتل. أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية. 102 9241–9246

Hendil K B و Khan S و Tanaka K 1998 الربط المتزامن لمنشطات PA28 و PA700 ببروتيازوم 20Sبيوتشيم. ج. 332 749–754

Hershko A و Ciechanover A و Rose I A 1979 قرار لنظام التحلل البروتيني المعتمد على ATP من الخلايا الشبكية: مكون يتفاعل مع ATPبروك. ناتل. أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 76 3107–3110

Hershko A و Ciechanover A و Heller H و Haas A L و Rose I A 1980 الدور المقترح لـ ATP في انهيار البروتين: اقتران البروتين مع سلاسل متعددة من polypeptide لتحلل البروتين المعتمد على ATPبروك. ناتل. أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 77 1783–1786

Hershko A و Ciechanover A و Rose I A 1981 تحديد بقايا الأحماض الأمينية النشطة لبولي ببتيد لتحلل البروتين المعتمد على ATPJ. بيول. تشيم. 256 1525–1528

Hershko A و Eytan E و Ciechanover A و Haas A L 1982 التحليل الكيميائي المناعي لدوران اتحادات بروتين يوبيكويتين في الخلايا السليمة. العلاقة بانهيار البروتينات غير الطبيعيةJ. بيول. تشيم. 257 13964–13970

Hershko A و Heller H و Elias S و Ciechanover A 1983 مكونات نظام ليغاز بروتين يوبيكويتين. الدقة وتنقية التقارب والدور في تكسير البروتينJ. بيول. تشيم 258 8206–8214

Hershko A و Helen H و Eytane و Ressy 1986 موقع ربط ركيزة البروتين لنظام Ubiquitin-Protein ligaseJ. بيول. تشيم. 261 11982–11989

Hershko A و Ganoth D و Sudakin V و Dahan A و Cohen L H و Luca F C و Ruderman J V و Eytan E 1994 مكونات النظام الذي يربط السيكلين بـ يوبيكويتين وتنظيمها بواسطة بروتين كيناز cdc2J. بيول. تشيم. 269 4940–4946

Heinemeyer W و Fischer M و Krimmer T و Stachon U و Wolf D H 1997 المواقع النشطة للبروتيازوم حقيقيات النوى 20 S ومشاركتها في معالجة سلائف الوحدة الفرعيةJ. بيول. تشيم. 272 25200–25209

تنظيم البروتين Hicke L 2001 بواسطة المونوبيكويتيننات. القس مول. زنزانة. بيول. 2 195–201

Hirano Y و Hendil K B و Yashiroda H و Iemura S و Nagane R و Hioki Y و Natsume T و Tanaka K و Murata S 2005 مجمع غير متجانس يشجع على تجميع البروتيازوم 20S للثديياتالطبيعة (لندن) 437 1381–1385

Hoffman L و Pratt G و Rechsteiner M 1992 أشكال متعددة من 20 S multicatalytic و 26 S ubiquitin / ATP المعتمد على البروتياز من محللة الخلايا الشبكية للأرنبJ. بيول. تشيم. 267 22362–22368

Hoppe T 2005 Multiubiquitylation بواسطة إنزيمات E4: "حجم واحد" لا يناسب الجميعاتجاهات Biochem. علوم. 30 183–187

Hough R و Pratt G و Rechsteiner M 1986 متقارنات Ubiquitin-lysozyme. تحديد وتوصيف البروتياز المعتمد على ATP من محللات الخلايا الشبكية للأرانبي. بيول. تشيم. 261 2400–2408

Hu Z و Zhang Z و Doo E و Coux O و Goldberg A L و Liang T J 1999 يعتبر بروتين فيروس التهاب الكبد B X عبارة عن ركيزة ومثبط محتمل لمركب البروتيازJ. فيرول. 73 7231–7240

Jager S و Groll M و Huber R و Wolf D H و Heinemeyer W 1999 الوحدات الفرعية من نوع بيتا Proteasome: أدوار غير متكافئة للبروببتيدات في نضج الجسيمات الأساسية والتسلسل الهرمي لوظيفة الموقع النشطجيه مول. بيول. 291 997–1013

Johnston J A و Ward C L و Kopito R R 1998 Aggresomes: استجابة خلوية للبروتينات غير المطويةJ. الخلية. بيول. 143 1883–1898

Karin M و Ben-Neriah Y 2000 تجتمع الفسفرة مع الانتشار: التحكم في نشاط NF- [kappa] BAnnu. القس إمونول. 18 621–663

Khan S و van den Broek M و Schwarz K و de Giuli R و Diener P A و Groettrup M 2001 Immunoproteasomes تحل إلى حد كبير محل البروتيازومات التأسيسية أثناء الاستجابة المناعية المضادة للفيروسات والبكتيريا في الكبدJ. إمونول. 167 6859–6868

Kim J H ، و Park K C ، و Jung S S ، و Bang O ، و Chung C H 2003 إزالة التكوُّن من الإنزيمات كمنظِّمات خلويةJ. Biochem. 134 9–18

Kingsbury D J و Griffin T A و Colbert R A 2000 وظيفة بروبتيد جديدة في 20 S تؤثر على تكوين الوحدة الفرعية بيتاJ. بيول. تشيم. 275 24156–24162

Kishino T و Lalande M و Wagstaff J. 1997 تسبب طفرات UBE3A / E6-AP متلازمة أنجلماننات. جينيه. 15 70–73

Kisselev A F و Akopian T N و Goldberg A L 1998 مجموعة من أحجام منتجات الببتيد المتولدة أثناء تحلل البروتينات المختلفة بواسطة البروتيازومات البدائيةJ. بيول. تشيم. 273, 1982–1989

Kisselev A F و Akopian T N و Woo K M و Goldberg A L 1999 أحجام الببتيدات المتولدة من البروتين بواسطة بروتيازوم الثدييات 26 و 20 S. الآثار المترتبة على فهم آلية التحلل وعرض المستضدJ. بيول. تشيم. 274 3363–3371

Kisselev A F و Songyang Z و Goldberg A L 2000 لماذا يعمل الثريونين ، وليس السيرين ، كموقع نيوكليوفيل نشط في البروتيازومات؟J. بيول. تشيم. 275 14831–14837

Kloetzel P M 2004 معالجة مستضد البروتيازوم والفئة الأولى من معقد التوافق النسيجي الكبيربيوكيم. بيوفيز. اكتا 1695 225–233

Knipfer N and Shrader T E 1997 تعطيل البروتيازوم 20S فيالمتفطرة اللطخةمول. ميكروبيول. 25 375–383

نولتون جي آر ، جونستون إس سي ، ويتبي إف جي ، رياليني سي ، زانج زد ، ريكستاينر إم وهيل سي بي 1997 هيكل المنشط البروتياز ريجالفا (PA28alpha)الطبيعة (لندن) 390 639–643

Koegl M و Hoppe T و Schlenker S و Ulrich H D و Mayer T U و Jentsch S 1999 عامل تواجد جديد ، E4 ، يشارك في تجميع سلسلة multubiquitinزنزانة 96 635–644

Kostova Z and Wolf D H 2003 لمن تدق الأجراس: مراقبة جودة البروتين في الشبكة الإندوبلازمية واتصال اليوبيكويتين بالبروتيازEMBOJ. 22 2309–2317

Kruger E و Kloetzel P M و Enenkel C 2001 20S البروتيازومبيوكيمي 83 289–293

Leggett D S و Hanna J و Borodovsky A و Crosas B و Schmidt M و Baker R T و Walz T و Ploegh H و Finley D 2002 البروتينات المتعددة المرتبطة تنظم التركيب والوظيفة البروتيازمول. زنزانة. 10 495–507

Li J و Gao X و Joss L و Rechsteiner M 2000 المنشط البروتيازومي 11 S REG أو PA28: تتورط الكيميرات في تسلسل الكاربوكسيل الطرفي في قليل القلة والارتباط بالبروتياز ولكن ليس في تنشيط وحدات فرعية تحفيزية بروتيازوم معينةجيه مول. بيول. 299 641–654

Liu C W و Corboy M J و DeMartino G N و Thomas P J 2003 نشاط التحلل الداخلي للبروتيسومعلم 299 408–411

Lowe J و Stock D و Jap B و Zwick P و Baumeister W و Huber R 1995 هيكل بلوري لـ 20S Proteasome من ArchaeonT. أسيدوفيلوم بدقة 3.4 درجةعلم 268 533–539

Lupas A و Zwickl P و Baumeister W 1994 متواليات بروتيازوم في eubacteriaاتجاهات Biochem. علوم. 19 533–534

Lykke-Andersen K و Schaefer L و Menon S و Deng X W و Miller J B و Wei N 2003 يتسبب اضطراب الوحدة الفرعية لـ COP9 Ssn2 في الفئران في تكاثر الخلايا الناقص وتراكم p53 و cyclin E والموت الجنيني المبكرمول. خلية بيول. 23 6790–6797

Matsumoto M و Yada M و Hatakeyama S و Ishimoto H و Tanimura T و Tsuji S و Kakizuka A و Kitagawa M و Nakayama K I 2004 يتم تنظيم التخليص الجزيئي لـ ataxin-3 بواسطة الثدييات E4EMBOJ. 23 659–669

McCutchen-Maloney S L و Matsuda K و Shimbara N و Binns D D و Tanaka K و Slaughter C A و DeMartino G N 2000 cDNA الاستنساخ والتعبير والتوصيف الوظيفي لـ PI31 ، وهو مثبط برولينيريتش للبروتوزومJ. بيول. تشيم. 275 18557–18565

McDonough H و Patterson C 2003 CHIP: رابط بين أنظمة chaperone و proteasomeمرافقات إجهاد الخلية 8 303–308

Meiners S و Heyken D و Weller A و Ludwig A و Stangl K و Kloetzel P M و Kruger E 2003 يؤدي تثبيط نشاط البروتياز إلى التعبير المتضافر عن الجينات البروتيازومية ومن جديد تشكيل بروتيازومات الثديياتJ. بيول. تشيم. 278 21517–21525

Meng L ، Mohan R ، Kwok B H ، Elofsson M ، Sin N and Crews C M 1999 Epoxomicin ، مثبط بروتيازوم قوي وانتقائي ، يعرض في نشاط مضاد للالتهابات في الجسم الحيبروك. ناتل. أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 96 10403–10408

Monaco J J and McDevitt H O 1984 تتجمع مستضدات بولي ببتيد منخفضة الوزن الجزيئي مرتبطة بـ H-2 في مجمع جزيئي غير عاديالطبيعة (لندن) 309 797–799

Murata S و Kawahara H و Tohma S و Yamamoto K و Kasahara M و Nabeshima Y و Tanaka K و Chiba T 1999 تأخر النمو في الفئران التي تفتقر إلى المنشط البروتياز PA28gammaJ. بيول. تشيم. 274 38211–38215

Murata S, Udono H, Tanahashi N, Hamada N, Watanabe K, Adachi K, Yamano T, Yui K, Kobayashi N, Kasahara M, Tanaka K and Chiba T 2001 Immunoproteasome assembly and antigen presentation in mice lacking both PA28alpha and PA28betaEMBO J. 20 5898–5907

Murray A W 2004 Recycling the cell cycle: cyclins revisitedزنزانة 116 221–234

Nandi D, Woodward E, Ginsburg D B and Monaco J J 1997 Intermediates in the formation of mouse 20S proteasomes: implications for the assembly of precursor beta subunitsEMBO J. 16 5363–5375

Nandi D, Marusina K and Monaco J J 1998 How do endogenous proteins become peptides and reach the endoplasmic reticulumبالعملة. قمة. ميكروبيول. إمونول. 232 15–47

Niedermann G, Grimm R, Geier E, Maurer M, Realini C, Gartmann C, Soll J, Omura S, Rechsteiner M C, Baumeister W and Eichmann K 1997 Potential immunocompetence of proteolytic fragments produced by proteasomes before evolution of the vertebrate immune systemياء إكسب. ميد. 186 209–220

Park Y, Hwang Y P, Lee J S, Seo S H, Yoon S K and Yoon J B 2005 Proteasomal ATPase-associated factor 1 negatively regulates proteasome activity by interacting with proteasomal ATPasesمول. زنزانة. بيول. 25 3842–3853

Pickart C M 2001 Mechanisms underlying ubiquitinationAnnu. القس Biochem. 70 503–533

Pickart C M and Cohen R E 2004 Proteasomes and their kin: proteases in the machine ageنات. القس مول. زنزانة. بيول. 5 177–187

Ping M C, Willy P J, Slaughter C A and DeMartino G N 1993 PA28, an activator of the 20 S proteasome, is inactivated by proteolytic modification at its carboxyl terminusJ. بيول. تشيم. 268 22514–22519

Rajkumar S V, Richardson P G, Hideshima T and Anderson K C 2005 Proteasome inhibition as a novel therapeutic target in human cancerJ. كلين. اونكول. 23 630–639

Ramos P C, Hockendorff J, Johnson E S, Varshavsky A and Dohmen R J 1998 Ump1p is required for proper maturation of the 20S proteasome and becomes its substrate upon completion of the assemblyزنزانة 92 489–499

Rao H, Uhlmann F, Nasmyth K and Varshavsky A 2001 Degradation of a cohesin subunit by the N-end rule pathway is essential for chromosome stabilityNature (London) 410 955–959

Rechsteiner M and Hill C P 2005 Mobilizing the proteolytic machine: cell biological roles of proteasome activators and inhibitorsTrends Cell. بيول. 15 7–33

Reits E A, Benham A M, Plougastel B, Neefjes J and Trowsdale J 1997 Dynamics of proteasome distribution in living cellsEMBO J. 16 6087–6094

Richard I, Roudaut C, Marchand S, Baghdiguian S, Herasse M, Stockholm D, Ono Y, Suel L, Bourg N, Sorimachi H, Lefranc G, Fardeau M, Sebille A and Beckmann J S 2000 Loss of calpain 3 proteolytic activity leads to muscular dystrophy and to apoptosis-associated IkappaBalpha/nuclear factor kappaB pathway perturbation in miceJ. الخلية. بيول. 151 1583–1590

Rock K L, Gramm C, Rothstein L, Clark K, Stein R, Dick L, Hwang D and Goldberg A L 1994 Inhibitors of the proteasome block the degradation of most cell proteins and the generation of peptides presented on MHC class I moleculesزنزانة 78 761–771

Ruepp A, Eckerskorn C, Bogyo M and Baumeister W 1998 Proteasome function is dispensable under normal but not under heat shock conditions inاسيدوفيلوم ثيرموبلازماFEBS ليت. 425 87–90

Sassetti C M, Boyd D H and Rubin E J 2003 Genes required for mycobacterial growth defined by high density mutagenesisمول. ميكروبيول. 48 77–84

Schauber C, Chen L, Tongaonkar P, Vega I, Lambertson D, Potts W and Madura K 1998 Rad23 links DNA repair to the ubiquitin/proteasome pathwayNature (London) 391 715–718

Schmid H P, Akhayat O, Martins De Sa C, Puvion F, Koehler K and Scherrer K 1984 The prosome: an ubiquitous morphologically distinct RNP particle associated with repressed mRNPs and containing specific ScRNA and a characteristic set of proteinsEMBO J. 3 29–34

Schwechheimer C 2004 The COP9 signalosome (CSN): an evolutionary conserved proteolysis regulator in eukaryotic developmentبيوكيم. Biophys. اكتا 1695 45–54

Seemuller E, Lupas A, Stock D, Lowe J, Huber R and Baumeister W 1995 Proteasome fromاسيدوفيلوم ثيرموبلازما: a threonine proteaseعلم 268 579–582

Semple C A, Riken Ger Group and GSL Members 2003 The comparative proteomics of ubiquitination in mouseالدقة الجينوم. 13 1389–1394

Soza A, Knuehl C, Groettrup M, Henklein P, Tanaka K and Kloetzel P M 1997 Expression and subcellular localization of mouse 20S proteasome activator complex PA28FEBS ليت. 413 27–34

Staub O, Gautschi I, Ishikawa T, Breitschopf K, Ciechanover A, Schild L and Rotin D 1997 Regulation of stability and function of the epithelial Na+ channel (ENaC) by ubiquitinationEMBO J. 16 6325–6336

Sun X M, Butterworth M, MacFarlane M, Dubiel W, Ciechanover A and Cohen G M 2004 Caspase activation inhibits proteasome function during apoptosisمول. زنزانة. 14 81–93

Tanaka K, Ii K, Ichihara A, Waxman L and Goldberg A L 1986 A high molecular weight protease in the cytosol of rat liver. I. Purification, enzymological properties, and tissue distributionJ. بيول. تشيم. 261 15197–15203

Tanaka K, Yoshimura T and Ichihara A 1989 Role of substrate in reversible activation of proteasomes (multi-protease complexes) by sodium dodecyl sulfateJ. Biochem. (Tokyo) 106 495–500

Turk V, Turk B and Turk D 2001 Lysosomal cysteine proteases: facts and opportunitiesEMBO. ج. 20 4629–4633

Unno M, Mizushima T, Morimoto Y, Tomisugi Y, Tanaka K, Yasuoka N and Tsukihara T 2002 The structure of the mammalian 20S proteasome at 2.75 Å resolutionStructure (Camb). 10 609–618

Ustrell V, Hoffman L, Pratt G and Rechsteiner M 2002 PA200, a nuclear proteasome activator involved in DNA repairEMBO J. 21 3516–3525

Van Kaer L, Ashton-Rickardt P G, Eichelberger M, Gaczynska M, Nagashima K, Rock K L, Goldberg A L, Doherty P C and Tonegawa S 1994 Altered peptidase and viral-specific T cell response in LMP2 mutant miceImmunity 1 533–541

Varshavsky A 2005 Regulated protein degradationTrends Biochem Sci. 30 283–286

Vassilev L T, Vu B T, Graves B, Carvajal D, Podlaski F, Filipovic Z, Kong N, Kammlott U, Lukacs C, Klein C, Fotouhi N and Liu E A 2004في الجسم الحي activation of the p53 pathway by small-molecule antagonists of MDM2علم 303 844–848

Velichutina I, Connerly P L, Arendt C S, Li X and Hochstrasser M 2004 Plasticity in eucaryotic 20S proteasome ring assembly revealed by a subunit deletion in yeastEMBO J. 23 500–510

Verma R, Chen S, Feldman R, Schieltz D, Yates J, Dohmen J and Deshaies R J 2000 Proteasomal proteomics: identification of nucleotide-sensitive proteasome-interacting proteins by mass spectrometric analysis of affinity-purified proteasomesمول. بيول. زنزانة. 11 3425–3439

Verma R, Aravind L, Oania R, McDonald W H, Yates J R 3rd, Koonin E V and Deshaies R J 2002 Role of Rpn11 metalloprotease in deubiquitination and degradation by the 26S proteasomeعلم 298 611–615

Voges D, Zwickl P and Baumeister W 1999 The 26S proteasome: a molecular machine designed for controlled proteolysisAnnu. القس Biochem. 68 1015–10168

Wang H R, Kania M, Baumeister W and Nederlof P M 1997 Import of human and Thermoplasma 20S proteasomes into nuclei of HeLA cells requires functional NLS sequencesيورو. J. الخلية. بيول. 73 105–113

Ward C L, Omura S and Kopito R R 1995 Degradation of CFTR by the ubiquitin-proteasome pathwayزنزانة 83 121–127

Weissman A M 2001 Themes and variations on ubiquitylationنات. القس مول. زنزانة. بيول. 2 169–178

Whitby F G, Masters E I, Kramer L, Knowlton J R, Yao Y, Wang C C and Hill C P 2000 Structural basis for the activation of 20S proteasomes by 11S regulatorsNature (London) 408 115–120

Wigley W C, Fabunmi R P, Lee M G, Marino C R, Muallem S, DeMartino G N and Thomas P J 1999 Dynamic association of proteasomal machinery with the centrosomeJ. الخلية. بيول. 145 481–490

Wilk S and Orlowski M 1983 Evidence that pituitary cation-sensitive neutral endopeptidase is a multicatalytic protease complexJ. نيوروتشيم. 40 842–849

Wilkinson K D, Urban M K and Haas A L 1980 Ubiquitin is the ATP-dependent proteolysis factor I of rabbit reticulocytesJ. بيول. تشيم. 255 7529–7532

Wilkinson C R, Wallace M, Morphew M, Perry P, Allshire R, Javerzat J P, McIntosh J R and Gordon C 1998 Localization of the 26S proteasome during mitosis and meiosis in fission yeastEMBO. ج. 17 6465–6476

Witt E, Zantopf D, Schmidt M, Kraft R, Kloetzel P M and Kruger E 2000 Characterisation of the newly identified human Ump1 homologue POMP and analysis of LMP7 (β5i) incorporation into 20S proteasomesجيه مول. بيول. 30 1–9

Wojcik C and DeMartino G N 2003 Intracellular localization of proteasomesكثافة العمليات J. Biochem. زنزانة. بيول. 35 579–589

Yao T and Cohen R E2002 A cryptic protease couples deubiquitination and degradation by the proteasomeNature (London) 419 403–407

Yen H C, Gordon C and Chang E C 2003شيزوساكارومايس بومب Int6 and Ras homologs regulate cell division and mitotic fidelity via the proteasomeزنزانة 112 207–217

Zaiss D M, Standera S, Holzhutter H, Kloetzel P and Sijts A J 1999 The proteasome inhibitor PI31 competes with PA28 for binding to 20S proteasomesFEBSLett. 457 333–338

Zaiss D M, Standera S, Kloetzel P M and Sijts A J 2002 PI31 is a modulator of proteasome formation and antigen processingبروك. ناتل. أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 99 14344–14349

Zhang Z, Clawson A and Rechsteiner M 1998a The proteasome activator 11 S regulator or PA28. Contribution By both alpha and beta subunits to proteasome activationJ. بيول. تشيم. 273 30660–30668

Zhang Z, Clawson A, Realini C, Jensen C C, Knowlton J R, Hill C P and Rechsteiner M 1998b Identification of an activation region in the proteasome activator REGalphaبروك. ناتل. أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 95 2807–2811

Zwickl P, Kleinz J and Baumeister W 1994 Critical elements in proteasome assemblyنات. هيكل. بيول. 1 765–770

Zwickl P, Ng D, Woo K M, Klenk H P and Goldberg A L 1999 An archaebacterial ATPase, homologous to ATPases in the eukaryotic 26 S proteasome, activates protein breakdown by 20 S proteasomesJ. بيول. تشيم. 274 26008–26016