معلومة

ما هي وظيفة (وظائف) عناصر Alu في الخلية؟


يذكر كتابي في علم الأحياء لعام 2008 (1) أن حوالي 10٪ من الجينوم البشري يتكون من قصيرة نسبيًا (~ 300 نيوكليوتيد طويلة) ألو العناصر التي لا ترمز للبروتينات ولكن العديد منها يتم نسخها إلى RNA. افعل ذلك ألو العناصر لها أي وظيفة في الخلية؟

(1) علم الأحياء ، الطبعة الثامنة ، كامبل وريس ، 2008


عناصر Alu هي نوع من العناصر القابلة للتبديل. لديهم وسائل الازدواجية والحركة الخاصة بهم. Alu هو عنصر يشبه SINE يتم نسخه بواسطة RNA Pol III ، وبالتالي يمكن لنسخة واحدة من الحمض النووي أن تصنع نسخًا متعددة من الحمض النووي الريبي ، كل منها قادر على الإدخال في الحمض النووي ، لذلك فلا عجب أن يكون لديهم عدد نسخ مرتفع جدًا. هذه صورة لإحدى وسائل الإدراج http://www.nature.com/nrg/journal/v3/n5/box/nrg798_BX1.html ، على الرغم من وجود وسائل أخرى محتملة.

ليس لديهم "وظيفة" في حد ذاتها ، حيث لا يتم اختيارهم من أجلها ، ونادرًا ما يتم اختيارهم ضدها وهناك الكثير منهم. إنها لا تضيف وظائف ، ولكنها تمثل نصف "الحرب" بين العناصر القابلة للنقل والفيروسات مقابل تطور الجينوم للتخفيف من الضرر الذي تسببه. وهي ، بالطبع ، شائعة الاستخدام كمصادر للحمض النووي الجديد لتطور التسلسل ، أو يمكن استخدامها لإنشاء عمليات نقل أو إعادة ترتيب كروموسوم أخرى ، لكنها في الغالب تفشل في إحداث الكثير من الضرر وبالتالي تميل إلى التراكم في الجينوم.


بسبب قدرة الينقولات العكسية لـ Alu والعناصر المتناثرة الأخرى ، يمكن أن يساهم الإدخال في أجزاء من الجينوم في التنوع الجيني بين السكان. يمكن أن يكون هذا مشابهًا للطفرات العشوائية النقطية المتراكمة طوال العمر.

يمكن أن تكون بعض هذه الطفرات مفيدة وتزيد من اللياقة العامة للكائن الحي. ومع ذلك ، فإن العديد من هذه الطفرات والإدخالات العشوائية ضارة خاصة عندما تدخل العناصر نفسها في الجينات الأساسية أو الجينات الكابتة للورم (مما يؤدي إلى الإصابة بالسرطان).


لم أدرس هذا حقًا ، لكن ويكيبيديا تقوم بعمل جيد في الحديث عن بعض الوظائف ، لا سيما الأمراض المرتبطة بها التي تنتج عن التغيير في تلك التسلسلات. هذه الجملة ذات أهمية خاصة:

أدى اكتشاف فصائل Alu الفرعية إلى فرضية الجينات الرئيسية / المصدر ، وقدم رابطًا نهائيًا بين العناصر القابلة للنقل (العناصر النشطة) والحمض النووي المتكرر المتناثر (نسخ متحورة من العناصر النشطة).

تنتقل المقالة لمناقشة تأثيرات تغييرات Alu:

تعتبر عناصر Alu مصدرًا شائعًا للطفرات في البشر ، ولكن مثل هذه الطفرات غالبًا ما تكون محصورة في المناطق غير المشفرة حيث يكون لها تأثير ضئيل ملحوظ على حاملها [بحاجة لمصدر]. ومع ذلك ، يمكن استخدام التباين الناتج في دراسات حركة وأسلاف المجموعات البشرية [بحاجة لمصدر] ، وقد لعب التأثير المطفر لـ Alu [9] واللينقولات العكسية بشكل عام [10] دورًا رئيسيًا في التطور الأخير لـ الجينات البشرية. هناك أيضًا عدد من الحالات التي ترتبط فيها عمليات إدراج Alu أو الحذف بتأثيرات معينة على البشر:

الارتباط بالأمراض البشرية

أحيانًا تكون عمليات إدخال Alu معطلة ويمكن أن تؤدي إلى اضطرابات وراثية. ومع ذلك ، فإن معظم تباينات Alu تعمل كعلامات تنفصل عن المرض ، لذا فإن وجود أليل Alu معين لا يعني أن الناقل سيصاب بالتأكيد بالمرض. كان التقرير الأول عن إعادة التركيب بوساطة Alu التي تسبب الاستعداد الوراثي السائد للسرطان هو تقرير عام 1995 عن سرطان القولون والمستقيم الوراثي nonpolyposis.

تم ربط الأمراض البشرية التالية بإدراج Alu:

سرطان الثدي

ساركومة يوينغ

ارتفاع الكولسترول العائلي

الهيموفيليا

الورم العصبي الليفي

داء السكري من النوع الثاني

وقد ارتبطت الأمراض التالية بتغيرات الحمض النووي أحادي النوكليوتيدات في عناصر Alu التي تؤثر على مستويات النسخ:

مرض الزهايمر

سرطان الرئة

سرطان المعدة

الطفرات البشرية الأخرى المرتبطة بالو

يحتوي جين ACE ، الذي يقوم بترميز الإنزيم المحول للأنجيوتنسين ، على متغيرين شائعين ، أحدهما بإدخال Alu (ACE-I) والآخر يحتوي على Alu المحذوف (ACE-D). تم ربط هذا الاختلاف بالتغيرات في القدرة الرياضية: يرتبط وجود عنصر Alu بأداء أفضل في الأحداث الموجهة نحو التحمل (مثل الترياتلون) ، بينما يرتبط غيابه بالأداء الموجه للقوة والقوة

التكاثر الجيني opsin الذي أدى إلى إعادة اكتساب ثلاثية الألوان في الرئيسيات في العالم القديم (بما في ذلك البشر) محاط بعنصر Alu ، مما يشير إلى دور Alu في تطور رؤية الألوان الثلاثة.

بالطبع ، لا يزال هناك الكثير للدراسة في هذا الشأن. على سبيل المثال ، يوجد في جامعة أيوا فريق يدرس هذا الحمض النووي "غير المرغوب فيه".

قد يكمن جزء من الإجابة عن كيف ولماذا تختلف الرئيسيات عن الثدييات الأخرى ، ويختلف البشر عن الرئيسيات الأخرى ، في الامتدادات المتكررة للجينوم التي كانت تعتبر في السابق "خردة".

وجدت دراسة جديدة أجراها باحثون في كلية الطب بجامعة أيوا كارفر أنه عندما يتم إدخال نوع معين من قطع الحمض النووي المتكرر ، والمعروف باسم عنصر Alu ، في الجينات الموجودة ، فإنه يمكن أن يغير معدل إنتاج البروتينات - الآلية التي يمكن أن تسهم في تطور الخصائص البيولوجية المختلفة في الأنواع المختلفة. نُشرت الدراسة في عدد 15 فبراير من مجلة Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).

قال كبير مؤلفي الدراسة Yi Xing ، دكتوراه ، أستاذ مساعد في الطب الباطني والهندسة الطبية الحيوية ، والذي يحمل موعدًا مشتركًا في UI Carver College: "العناصر المتكررة للجينوم يمكن أن توفر ملعبًا لخلق خصائص تطورية جديدة". الطب وكلية الهندسة UI. "من خلال فهم كيفية عمل هذه العناصر ، يمكننا معرفة المزيد عن الآليات الجينية التي قد تساهم في السمات البشرية الفريدة."

عناصر Alu هي فئة محددة من الحمض النووي المتكرر ظهرت لأول مرة منذ حوالي 60 إلى 70 مليون سنة أثناء تطور الرئيسيات. لا توجد في جينومات الثدييات الأخرى. عناصر Alu هي الشكل الأكثر شيوعًا للحمض النووي المتحرك في الجينوم البشري ، وهي قادرة على الانتقال ، أو القفز ، إلى مواقع مختلفة في تسلسل الجينوم. عندما يقفزون إلى مناطق الجينوم التي تحتوي على جينات موجودة ، يمكن أن تصبح هذه العناصر إكسونات جديدة - أجزاء من الرنا المرسال التي تحمل المعلومات الجينية.

هناك ورقة كتبها Srikanta وآخرون بعنوان مسار بديل لـ Alu retrotransposition تقترح دورًا في إصلاح كسر الشريط المزدوج للحمض النووي (PDF).

امل ان يساعد.


نسخ عناصر Alu DNA في خلايا الدم لمرض كروتزفيلد جاكوب المتقطع (sCJD)

لطالما اعتبرت عناصر Alu DNA ليس لها أهمية بيولوجية وبالتالي تم تعريفها بشكل سيء فقط. ومع ذلك ، في الماضي ، تم الاشتباه في أن عناصر Alu DNA ذات تسلسل النيوكليوتيدات المحددة جيدًا تساهم في المرض ، ولكن نادرًا ما تم التحقيق في دور نسخ عنصر Alu DNA. لأول مرة ، قررنا في نهج الوقت الحقيقي نسخ عنصر Alu DNA في خلايا طبقة عازلة معزولة من دم البشر الذين يعانون من مرض كروتزفيلد جاكوب المتقطع (sCJD) واضطرابات تنكسية عصبية أخرى. تم تضخيم نسخ Alu المنسوخة العكسي وتم محاذاة تسلسل cDNA الخاص بهم مع المناطق الجينومية الأكثر ملاءمة لقاعدة بيانات تسلسل عنصر Alu DNA الجيني المودعة في قواعد بيانات UCSC و NCBI. تم توزيع تسلسلات Alu RNA / cDNA المستنسخة على نطاق واسع في الجينوم البشري ويفضل أن تنتمي إلى عائلة Alu Y & # x0201cyoung & # x0201d. لاحظنا أيضًا أن بعض نسخ RNA / cDNA يمكن أن تتماشى مع عدة كروموسومات بسبب نفس الدرجة من الهوية والنتيجة لعناصر الجينوم Alu DNA المقيمة. يُزعم أن هذه العناصر ، التي يطلق عليها Paralogues ، قد تم إنشاؤها مؤخرًا عن طريق التحويل الرجعي. إلى جانب حالات مرض كروتزفيلد جاكوب ، قمنا أيضًا بتضمين حالات الخرف ومرض الزهايمر. كشفت كل مجموعة عن نمط متباين من عناصر Alu المنسوخة. كان الكروموسوم 2 هو الموقع الأكثر تفضيلًا في حالات sCJD ، إلى جانب الكروموسوم 17 في حالات الزهايمر ، كان الكروموسوم 11 ممثلًا بشكل مفرط بينما كان الكروموسومات 2 و 3 و 17 مفضلًا لمواقع Alu النشطة في عناصر التحكم. أدت الكروموسومات 2 و 12 و 17 إلى ظهور نسخ Alu في حالات الخرف. اختلف الكشف عن نظائر Alu المفترضة اختلافًا كبيرًا حسب المرض. كشف بحث مفصل عن البيانات أن بعض نسخ Alu المستنسخة نشأت من نسخ RNA polymerase III منذ أن تم العثور على المواقع الجينية لعناصر Alu الخاصة بها بين الجينات. يمكن أن توجد عناصر Alu DNA الأخرى بالقرب من مناطق الجينات المشفرة أو داخلها. بشكل عام ، تشير ملاحظاتنا إلى أنه يمكن تطوير التعرف على عناصر Alu DNA النشطة وتحديد موقعها كعلامة بديلة للتعبير الجيني التفاضلي في المرض. عدد كافٍ من الحالات ضروري لدلالة إحصائية قبل أن يمكن اعتبار عناصر Alu DNA مفيدة للتمييز بين الأمراض التنكسية العصبية والضوابط.


Alu Insertion (نشاط)

ألو & # 8217s هي SINEs فريدة تظهر في سلالة الرئيسيات وتكشف عن نسب وتنوع الرئيسيات. في حين أن الينقولات العكسية يمكن أن تعطل الجين (كما هو الحال في بعض حالات الهيموفيليا) ، فإنها غالبًا ما تهبط خارج الجينات أو داخل الإنترونات دون تأثير. تم العثور على أحد الأمثلة على عنصر Alu غير المضطرب في البشر في الموقع الذي يسمى PV92 على الكروموسوم 16. هذا العنصر هو من أصغر فصيلة Alu ، تسمى Ya5 .

نظرًا لأن PV92 لا تسبب أي آثار ضارة ، فيمكن استخدامها كعلامة غير محددة لتوضيح النسب. بعض الناس لديهم ألو عنصر في موقعه بينما لا يفعل الآخرون. يُنظر إلى وجود أو عدم وجود هذه العلامة على أنه أليل. يستخدم هذا المعمل التمهيدي الذي يحيط بموقع ألو الإدراج الذي يمتد 416 نقطة أساس. إذا كان ألو موجود ، فإن الحمض النووي المكبر سيكون 300 نقطة أساس (حجم ألو) بسرعة 731 نقطة أساس.


تصميم قاعدة البيانات

ال ألو تم تنفيذ قاعدة بيانات الجينات باستخدام لغة الاستعلام المحددة (SQL) من خادم قاعدة بيانات MySQL (http://www.mysql.com/). تدمج قاعدة البيانات ثلاثة مكونات رئيسية: (1) خريطة mRNAs جنبًا إلى جنب على الجينوم البشري ، (2) خريطة لـ ألو التسلسل و (3) مقارنة (محاذاة) لكل منهما ألو عنصر بتسلسل إجماعي للعائلة الفرعية التي تنتمي إليها. حاليًا ، تعتمد قاعدة البيانات على إصدار مايو 2003 من تسلسل الجينوم البشري NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) ، وسيتم تحديثها مع كل إصدار جديد. استخدمنا نصوص Perl لاستخراج مواضع وتسلسلات الجينات وتسلسل ترميزها من ملفات GenBank. تم تخزين إحداثيات وتوجهات contig كبيانات تعيين لكل جين. تم أيضًا تخزين بيانات وصفية إضافية لـ mRNAs ، مثل إدخال LocusLink وإدخال البروتين ، في قاعدة البيانات. تم تخزين مواقع exons و intron في جداول مميزة.

استخدمنا برنامج RepeatMasker (http: //ftp.genome. washington.edu/RM/RepeatMasker.html) للبحث عن ألو تسلسل في contigs الجينوم البشري. لكل ألو الدخول وموقعه على contig والتوجيه والتسلسل تم تخزينها في قاعدة البيانات. المواقع الجينومية لـ ألو تم حساب s والجينات من موقعها في contigs والموقع النسبي للكونتيج داخل الكروموسوم وفقًا لملف seq_contig.md في NCBI. باستخدام ClustalW (15) ، لكل منهما ألو تمت محاذاة التسلسل مع التسلسل الإجماعي لعائلته الفرعية (A. F. A. Smit and P. Green ، بيانات غير منشورة). تم تفسير Indels على أنه عمليات إدخال أو حذف ، على التوالي ، وفقًا لغياب أو وجود نيوكليوتيدات غير خالية في المواضع المحاذية في تسلسل الإجماع.

ال ألو تحتوي قاعدة بيانات الجينات على خريطة النسخة البشرية وخريطة وخصائص ألو تسلسل في الجينوم البشري. يتم تقسيم النسخة إلى ثلاث مجموعات (جداول): mRNA و intron و exon. ترتبط سجلات mRNA بقواعد البيانات الجينية الأخرى من خلال أربعة مفاتيح وصول مختلفة مقدمة من NCBI: معرف Refseq ورقم GI والمعرف المؤقت ومعرف LocusLink. بالإضافة إلى ذلك ، تم تحديد كل سجل مرنا من خلال موقعه الجيني. تم ربط سجلات Intron و exon مع mRNA المقابل من خلال رقم GI.

البيانات لكل ألو يتضمن الإدخال تسلسل الحمض النووي والموقع الجينومي ، ألو الفصيلة التي تنتمي إليها ألو ينتمي الإدخال ، وهو عبارة عن محاذاة الإدخال إلى تسلسل الإجماع الخاص بالعائلة الفرعية وقائمة الاختلافات من تسلسل الإجماع الخاص بالعائلة الفرعية. ال ألو تتضمن البيانات أيضًا محتوى GC وطول ذيل بولي (A) ، أي الميزات التي ثبت أنها تؤثر على الدور الذي ألو قد تلعب في الجينوم (16 ، 17). قد يكون تحديد ذيل poly (A) مشكلة لأنه بالإضافة إلى تسلسل poly (A) الطرفي ، ألو تحتوي العناصر على بولي داخلي (A). وهكذا ، بقدر ما جزئية ألو بالنسبة للإدخالات ، قد يتم الخلط بين البولي الداخلي (A) والطرف الواحد. باستخدام المحاذاة الزوجية لكل منهما ألو إلى تسلسل إجماع العائلة الفرعية ، تمكنا من التأكد من أن poly (A) عند 3 من ألو مثيل التسلسل هو في الواقع ذيل.

بالطبع ، ليس غرضنا هنا تقديم وصف إحصائي شامل لـ " ألو ome '. في ما يلي ، نقدم بعض الإحصائيات التعدادية التوضيحية التي يمكن الحصول عليها من ألو الجين. العدد الإجمالي لل ألو العناصر الموجودة في الجينوم البشري المتسلسل حاليًا هي 1 169 291. خمسة وأربعون بالمائة (45٪) من المجموع ألو s موجودة داخل الجينات والباقي يقع داخل المناطق الجينية. يوجد 28049 نسخة في ألو الجين ، منها 17781 (63٪) تحتوي على واحد على الأقل ألو عنصر. ضمن مناطق 1 كيلو بايت المنبع من مواقع بدء النسخ ، هناك 9212 ألو س. هؤلاء ألو تم العثور على s في المواقع التي قد تؤثر على مستويات التعبير للجينات المصب.

بحث

ال ألو يمكن الوصول إلى قاعدة بيانات الجينات بحرية على http://Alugene.tau.ac.il/. هدفها الرئيسي هو تسهيل البحث عن ألو التي تقع إما داخل الجينات أو بالقرب منها مباشرة. عن طريق دمج المواقع الجينومية للجينات و ألو ق ، من الممكن العثور على مناطق متداخلة بين الاثنين ، مثل ألو يقيمون داخل exons. علاوة على ذلك ، باستخدام معلومات إضافية تتعلق ألو ق ، فمن الممكن دراسة ألو مجموعة فرعية تؤثر على عمليات مثل الإعفاء وتنظيم التعبير وما إلى ذلك. ألو يتيح الجين استعلامات محددة حول جينات أو مواقع معينة ، بالإضافة إلى مجموعة واسعة من الاستعلامات التي صممها المستخدم. يمكن أن تكون نتيجة الاستعلامات المحددة إما خريطة تخطيطية ، أو محاذاة لتسلسل النوكليوتيدات. في استعلامات المحاذاة ، يكون ملف ألو يتم محاذاة s إما إلى الموقع الجيني الذي يتم تضمينها فيه أو إلى التسلسل الإجماعي لعائلتها الفرعية. هكذا، ألو يمكن البحث عن s من خلال موقعها في الجينوم ، أو عن طريق الموقع في الجينات (في exons ، أو introns ، أو في مواقع لصق) ، وعن طريق خصائص مثل محتوى GC وطول ذيل A. وعلاوة على ذلك، ألو الجين يتيح البحث عن ألو عن طريق الزخارف المتسلسلة ، أي استرداد الكل ألو التي تحتوي على نمط تسلسل معين. تم إنشاء الخريطة التخطيطية بواسطة ألو يعرض الجين مدى ومواقع الجينات و ألو s في المنطقة المحددة بواسطة استعلام المستخدم. عرض معلومات موسعة حول العناصر ، مثل exons ، ألو s ، وما إلى ذلك ، عن طريق وضع المؤشر على رموز الخريطة.


عناصر Alu وعلم الوراثة البشري

تم إدخال عناصر Alu في جينومات الرئيسيات طوال تطور النظام. بدأ أحد سلالة Alu (Ye) في التضخيم مبكرًا نسبيًا في تطور الإنسان واستمر في الانتشار عند مستوى منخفض حيث تم العثور على العديد من أعضائه في مجموعة متنوعة من جينومات البشر. تمثل هذه الدراسة أول تطبيق قاطع للعناصر المختلطة القصيرة ، والتي تعتبر خالية من التجانس تقريبًا ، لتوضيح نسالة البشر. يكشف التحليل الوراثي لعناصر Alu Ye5 وعناصر من عدة عائلات فرعية أخرى عن مستويات عالية من الدعم للأحادية من Hominidae وقبيلة Hominini والقبيلة الفرعية Hominina. نقدم هنا أقوى دليل تم الإبلاغ عنه حتى الآن لعلاقة أخت بين البشر والشمبانزي مع التمييز بوضوح بين سلالات الشمبانزي والإنسان.

عناصر Alu قصيرة (≈300 نقطة أساس) عناصر متناثرة تتضخم في جينومات الرئيسيات من خلال عملية تسمى ارتداد (1-3). كان لتكاثر هذه العناصر تأثير كبير على بنية جينومات الرئيسيات (1). وهي تشكل & gt 10٪ من الجينوم البشري بالكتلة وهي العنصر الأكثر وفرة في الجينوم الرئيسي (SINE) في جينومات الرئيسيات (2). حدثت غالبية تضخيم Alu مبكرًا في تطور الرئيسيات ، والمعدل الحالي لرجوع Alu أبطأ 100 مرة على الأقل من ذروة التضخيم التي حدثت قبل 30-50 مليون سنة (mya) (2-5). لذلك ، تعد عناصر Alu مصدرًا غنيًا للتنوع الجيني بين الأنواع الرئيسية وداخل الأنواع.

لقد قمنا سابقًا بتمييز & gt2500 عنصر مدمج حديثًا من الجينوم البشري الذي يقع في ستة فصائل فرعية متميزة بناءً على طفراتها التشخيصية (6-18). في سياق هذه التحقيقات ، وجدنا نحن وآخرون أن المواقع الفردية من هذه العائلات الفرعية مفيدة لدراسة علم اللاهوت النظامي للرئيسيات (19) وكذلك علم الوراثة البشرية ويمكن أن تكون أدوات مفيدة لحل الأسئلة المتبقية من البشر (سيامانغ ، orangutan، gorilla، chimpanzee، and human) نسالة (20 ، 21).

كان حل العلاقات بين الإنسان (H) والشمبانزي (C) والغوريلا (G) (أي مشكلة انقسام ثلاثي الألوان) أمرًا صعبًا بشكل خاص. أي من العلاقات الأربعة المحتملة ، ((H ، C) G) ، ((H ، G) C) ، ((C ، G) H) ، و (H ، C ، G) ، تعكس التطور الحقيقي للثلاثة محيط؟ يُعرِّف نهج الإجماع الشمبانزي على أنه أقرب قريب حي للبشر ، لكن الدليل الذي يدعم هذا الاستنتاج ليس عالميًا ولا ساحقًا (22-26). في تفسير حديث لتصنيف الرئيسيات استنادًا إلى تطبيق الأساليب cladistic الحديثة لبيانات الأحياء المقارنة ، Shoshani وآخرون. (27) نستنتج: “نحن ندعم البيانات المورفولوجية الضعيفة ، و وطيمقلاة clade ، على الرغم من أن بعض الدراسات تفضل فرضية ثلاثية الأبعاد ".

تدعم بيانات تهجين الحمض النووي علاقات الأنواع الشقيقة بين البشر والشمبانزي (28). يبدو أن دراسات الحمض النووي للميتوكوندريا (mt) المستندة إلى تقييد هضم نوكلياز داخلي لجين ترميز الرنا الريباسي 12S تدعم إما علاقة متساوية البعد بين السلالات الثلاثة أو علاقة أخت بين الشمبانزي والغوريلا (29). دعم تسلسل mtDNA الإضافي إما العلاقة ((H ، C) G) أو ((H ، G) C) اعتمادًا على الجينات التي تم تحليلها (30 ، 31) ، بينما دعمت تسلسلات mtDNA الكاملة العلاقة السابقة (32).

دعمت بعض التحليلات للمواقع النووية (على سبيل المثال ، مجموعة β-globin) (21 ، 33) العلاقة ((H ، C) G) ، وأيدت أخرى (على سبيل المثال ، جين involucrin) (34) ((C ، G). ) ح) العلاقة. ساتا وآخرون. قام (24) بدراسة متواليات من 45 موقعًا نوويًا ووجد أن 60٪ من المواقع تدعم كليد الإنسان والشمبانزي وأن الـ 40٪ المتبقية من المواقع تدعم البديلين بالتساوي. 11 من 14 مجموعة بيانات تسلسل الحمض النووي التي تم تحليلها بواسطة Ruvolo (35) دعمت كليد بشري-شمبانزي ، واثنتان تدعمان كليد شمبانزي-غوريلا وواحدة تدعم كليد بشري-غوريلا. تختلف الشمبانزي وأنواع أشقائها ، البونوبو ، عن البشر بمتوسط ​​0.6٪ في مواقع غير مجهولة من 97 جينة بشرية تمت دراستها (25) و 1.2٪ في تسلسل الحمض النووي الجينومي الإجمالي (26) ، ويقدر أنهم شاركوا في سلف مشترك مع البشر 4.0–6.0 ميا (22). تختلف الغوريلا عن البشر بمتوسط ​​1.6٪ في تسلسل الحمض النووي الجينومي ويقدر أنها تشترك في سلف مشترك مع البشر والشمبانزي والبونوبو 6.2-8.4 ميا (26). وبالتالي ، بناءً على اختلاف النوكليوتيدات ، فإن الشمبانزي والبونوبو هما النوعان الأكثر ارتباطًا بالبشر.

تمثل عناصر SINE أداة جديدة قوية لعلم الأحياء النظامي التي يمكن أن تتكامل استراتيجيًا مع سمات النشوء والتطور التقليدية الأخرى ، وأبرزها مورفولوجيا وتسلسل الحمض النووي (36-38). لا توجد آلية معروفة لإزالة محددة لعناصر SINE من الجينوم البشري (2) ، ولم يتم تحديد سوى حذف جزئي واحد لعنصر Alu (39). نظرًا لأن نمط تطورها أحادي الاتجاه (أي أنها لا تعود إلى حالة أسلافها) ، يُعتقد عمومًا أن عناصر SINE الفردية خالية من التجانس تقريبًا وبالتالي فهي مفيدة في حل الأسئلة الجينية المتعلقة بالتطور والتطور السكاني (2 ، 36-38) ، 40-43). على سبيل المثال ، شيمامورا وآخرون. (42) استخدم بنجاح عناصر SINE لدعم الفرضية القائلة بأن الحيتان (الحيتان والدلافين وخنازير البحر) تشكل كليدًا داخل Artiodactyla (ذوات الحوافر حتى الأصابع ، بما في ذلك الأبقار والجمال والخنازير). تاكاهاشي وآخرون. (43) استخدم أيضًا عناصر SINE لتوضيح العلاقات بين أسماك البلطي في بحيرة ملاوي. في كل من هذه الدراسات ، انضم وجود SINE في أي سلالة معينة بشكل لا لبس فيه إلى أعضاء تلك العقدة مع تقديم حالة واحدة فقط من homoplasy المحتملة إما عن طريق فرز النسب أو عن طريق التهجين بين الأنواع.

هذا لا يعني أن عناصر Alu و SINEs الأخرى خالية من المشاكل فيما يتعلق بتحليل النشوء والتطور. من المعروف أن homoplasy الإدراج يمكن أن تحدث عبر الأصناف ذات الصلة البعيدة كدالة للوقت التطوري وأن معدلات الارتداد المتغيرة بين الأنواع يمكن أن تحد من تطبيق SINEs على علاقات النشوء والتطور المتباعدة مؤخرًا (37 ، 38 ، 44). ومع ذلك ، من المهم ملاحظة أنه لم يتم استرداد أي حالات من homoplasy الإدراج Alu في البشر من تحليل & gt2500 إدراج البشري المتكامل حديثًا Alu (13 ، 17 ، 18 ، 40 ، 45-47). تم تحديد الفرز العشوائي للأنساب الأليلية الأجداد ، وتقارب التسلسل ، والتبادلات التسلسلية بين الأليلات أو المواقع المكررة كعوامل محتملة تربك تفسير العلاقات المتبادلة بين الأنواع.

على الرغم من هذه المشاكل المحتملة ، فإن عناصر Alu هي شخصيات وراثية جديدة تفتقر إلى معظم أوجه القصور التي تمت مواجهتها عند استخدام بيانات موقع التسلسل أو التقييد. إن المعدل المنخفض نسبيًا للارتداد النسبي للأنساب المشتقة من Alu Y في جينومات الإنسان ضمن ترتيب الرئيسيات والإشعاع المتأخر نسبيًا من البشر (22) يجعل هذه الأنواع الفرعية من Alu شبه مثالية لعلامات النشوء والتطور لحل ترتيب التفرع في أشباه البشر. حتى الآن ، لم يتم تحديد سوى عدد قليل من مواقع Alu التي كانت مفيدة فيما يتعلق بقضية ثلاثية الأجزاء (18 ، 45). نجحت دراسة سابقة (41) في تحديد عدد محدود من عناصر Alu الخاصة بالنسب ، ومع ذلك ، نظرًا للعدد المحدود من عناصر Alu التي تم فحصها ، ظلت الأسئلة حول نسالة الإنسان. تسهل المواقع الإضافية المقدمة في هذه الدراسة إجراء تحليل شامل لتطور نسالة المجموعة بأكملها.

هنا ، حددنا وتميزنا ما مجموعه 153 من أفراد عائلة Alu Ye الفرعية من مسودة تسلسل الجينوم البشري. تم فحص مائة وسبعة عشر من هذه المواقع ، بالإضافة إلى 16 موقعًا من فصائل سلالة Alu Y الفرعية الأخرى (17 ، 18 ، 45) الموضحة في الشكل 1 ، باستخدام اختبارات PCR للتأكد من نقاط الإدراج النسبية في تطور الإنسان (البشر وأكبر وأكبر). القردة الصغرى).

توافق تسلسل التوافق Alu. الموضح هو محاذاة تسلسل الإجماع لكل عائلة Alu الفرعية المستخدمة في الدراسة. تمثل النقاط نفس القاعدة الموجودة في تسلسل إجماع العائلة الفرعية Y. يتم الإشارة إلى الطفرات بالقاعدة المناسبة ، ويتم الإشارة إلى عمليات الحذف بشرطة.


ألو العناصر المتحركة: من الحمض النووي غير المرغوب فيه إلى الأحجار الكريمة الجينية

أليس، التتابعات المتكررة القصيرة (SINEs) ، هي الينقولات العكسية التي تتناثر في الجينوم البشري والتي لطالما اعتبرت DNA غير هام. ومع ذلك ، فإن النتائج الحديثة التي تفيد بأن هذه العناصر المتنقلة يتم نسخها ، سواء كنصوص مميزة لـ RNA polymerase III وكجزء من نسخ RNA polymerase II ، تشير إلى وظائف بيولوجية وتدحض الفكرة القائلة بأن أليس غير مهم من الناحية البيولوجية. في الواقع، ألو ثبت أن الحمض النووي الريبي يتحكم في معالجة الرنا المرسال على عدة مستويات ، وله وظائف تنظيمية معقدة مثل قمع النسخ وتعديل التضفير البديل وتسبب مجموعة من الأمراض الوراثية البشرية. ألو يمكن أن تعزز RNAs المضمنة في نصوص Pol II التطور والتنوع البروتيني ، مما يشير أيضًا إلى أن هذه العناصر الرجعية المتنقلة هي في الواقع جواهر جينومية وليست خردة جينومية.

1 المقدمة

ألو عناصر التكرار هي أكثر التكرارات المتناثرة وفرة في الجينوم البشري. إنها عائلة من العناصر النووية القصيرة المتناثرة (SINEs) التي تستخدم النسخ العكسي والنوكلياز المشفرة بواسطة عناصر نووية متناثرة طويلة (LINEs) للاندماج في جينوم المضيف [1-3] وتوجد في الجينوم البشري في عدد من

10٪ من إجمالي طوله [4]. العمل كمنظمين معاملات للتعبير الجيني ، نسخ البول الثالث ألو و B1 / 2 (ألومثل العناصر الموجودة في الفأر) يمكن أن تتفاعل الحمض النووي الريبي مع pol II وقمع نسخ الرنا المرسال [5-7]. معكوسة ألو التكرارات هي هدف لتحرير A-to-I بواسطة ديمينازات الأدينوزين (ADARs) ويمكن أن تسبب تضفيرًا بديلًا وتحريك التنوع البروتيني [8]. إلى جانب دورها في التطور الجينومي البشري والتنوع ، ألو الإدخالات و ألوتساهم إعادة التركيب غير المتكافئ بوساطة في نسبة كبيرة من الأمراض الوراثية البشرية [9]. ألو يمكن أن تحفز الحمض النووي الريبي أيضًا التنكس البقعي المرتبط بالعمر بعد السمية المباشرة للخلايا لخلايا الظهارة الصبغية الشبكية (RPE) [10].

في هذه الورقة المختصرة ، سيصف المؤلف هيكل الإنسان (ألو) والمورين (B1 و B2 و ID و B4) ، نظرة عامة واسعة على مساهمة ألو الانقلاب الرجعي إلى الأمراض التي تصيب الإنسان ، وأخيراً وصف بعمق دورًا جديدًا للمزدوجين الذين تقطعت بهم السبل ألو تؤثر RNAs على تطور الضمور البقعي المرتبط بالعمر (AMD) و ألو التحرير بواسطة ADARs.

2. هيكل ألو و Murine Mobile Elements

ألو تسلسل نموذجي

يبلغ طول 300 نيوكليوتيد ويتم تصنيفها إلى عائلات فرعية وفقًا لأعمارها النسبية (للمراجعة ، انظر [11]). لديهم بنية قاتمة وتتكون من اثنين من المونومرات المتشابهة ولكن المتميزة: أذرع يسرى ويمنى بطول 100 و 200 نيوكليوتيد ، على التوالي ، متماسكة معًا بواسطة رابط غني بـ A وينتهي بواسطة ذيل قصير بولي (A) (الشكل 1 ( أ)). كل من ألو نشأت الوحدات الفرعية من 5 ′ و 3 مقاطع طرفية من 7 SL RNA [12-14]. ألو تحتوي التسلسلات على عناصر محفز Pol III داخلية (المربع A والمربع B) وهي غنية بـ CG و CpG [11]. ألو تطوى الوحدات الفرعية بشكل مستقل وتحافظ على أشكال البنية الثانوية لسلفها 7 SL RNA (الشكل 1 (ب)). تم اعتبارهم في البداية كيانات أنانية تنتشر في الجينوم المضيف كـ "DNA غير مرغوب فيه" [15]. الآن ، أصبح من الواضح أكثر فأكثر أن تطور ألو تتفاعل العائلات الفرعية بطريقة معقدة مع جوانب أخرى من الديناميكيات الجينومية بأكملها. ألو عناصر خاصة بالرئيسيات [11] ونوع واحد فقط من SINE في الجينوم البشري. يحتوي جينوم الفأر على أربع عائلات SINE مميزة: B1 و B2 و ID و B4. تحتل عناصر B1 و B2 حوالي 5٪ من جينوم الفأر بحوالي 550.000 و 350.000 نسخة ، على التوالي [16]. مشابه ل ألو، يُعتقد أيضًا أن B1 SINEs مشتق من 7SL RNA ونسخ بواسطة pol III إلى

135 نيوكليوتيد B1 RNA ، والذي يقترب من الذراع اليسرى لـ ألو [17] (الشكل 1 (ج)). B1 SINEs عبارة عن مونومرات مع تكرار داخلي للنيوكليوتيدات 29 [18]. مثل عنصر B1 ، يتم نسخ B2 بواسطة تسلسل مروج البلمرة III. على عكس B1 ، فإنه يشترك في تماثل مهم في نهاية 5′ مع الحمض الريبي النووي النقال ، ويعتقد أنها مشتقة من الحمض النووي الريبي [19] وترميز

200 نيوكليوتيد B2 RNA (الشكل 1 (ج)) [20]. يُعتقد أن عناصر تكرار الهوية مشتقة من جين BC1 المعبر عنه من الناحية العصبية ، وهي بطول 69 نيوكليوتيدًا وهي صغيرة في العدد حوالي 42200 نسخة ، ومع ذلك ، فإن لها حضورًا كبيرًا في جينوم الفئران [21]. يبدو أن عنصر التكرار B4 نتيجة اندماج عنصر ID عند الطرف 5′ والعنصر B1 عند الطرف 3′ [22] ، وهما بطول 147 نيوكليوتيد وحوالي 329838 نسخة.


(أ)
(ب)
(ج)
(أ)
(ب)
(ج) عمارة ألوتكرار العناصر B1 و B2. (أ) ألو تتكون العناصر من حوالي 300 نيوكليوتيد طويلة تتكون من ذراعين مرتبطين بنصف. امتداد A وينتهي بامتداد بولي (A). أنها تحتوي على صندوقين (A و B) من المروج الداخلي RNA polymerase III. (ب) ألو البنية الثانوية للحمض النووي الريبي (مقتبس من [23]) والبنية الثانوية (ج) B1 و B2 RNA (مقتبس من [24]).

3. ألو والتنوع الجينومي البشري

ألو تم التعرف على العناصر المتحركة في الأصل قبل 30 عامًا في الحمض النووي البشري [25] وتم تسميتها باسم داخلي ألوي موقع التعرف على إنزيم التقييد [26]. أشار تحليل التسلسل والهيكل إلى ذلك ألو تم اشتقاق العناصر سلفًا من جين 7SL RNA وهو أحد مكونات المركب الريبوزومي [13]. كانوا موجودين في 500000 نسخة [27] ، وقد نشأوا مؤخرًا إلى عدد نسخ يزيد عن مليون نسخة داخل الجينوم البشري [28]. تضخيم ألو يُعتقد أن العناصر تحدث عن طريق النسخ العكسي لملف ألو- نسخة مستمدة من RNA polymerase III في عملية تسمى retrotransposition [1]. آلية فتيلة ذاتية للنسخ العكسي بواسطة ألو كما تم اقتراح RNAs [29]. لأن ألو العناصر ليس لها إطارات قراءة مفتوحة ، فهي تستخدم لتضخيمها الآلية والوظيفة الأنزيمية الخارجية للعناصر النووية الطويلة المتناثرة (LINEs) [2 ، 30-32]. بالإضافة إلى ذلك ، فإن ذيول بولي (A) من LINEs و ألو يُعتقد أن العناصر هي السمات الهيكلية المشتركة التي تشارك في منافسة هذه العناصر المتحركة لنفس الآلية الأنزيمية للتعبئة [33]. ألو يمكن تقسيم التسلسلات داخل الجينوم البشري إلى عائلات فرعية بناءً على الطفرات التشخيصية المشتركة بين أفراد العائلة الفرعية ، ويبدو أنها من أعمار وراثية مختلفة [34 - 39]. أقرب وقت ممكن ألو كانت العناصر هي عائلة J ، تليها العائلات الفرعية S التي تشمل Sx ، و Sq ، و Sp ، و Sc ، وتليها العائلات الفرعية Y الأحدث بما في ذلك Ya5 و Yb8 وهي الأكثر انتشارًا في البشر [11 ، 40 ، 41]. الصغير ألو توفر العناصر معلومات جديدة حول الحفريات الجينية لدراسة التنوع الجيني البشري. معدل ألو يقدر التضخيم بترتيب واحد جديد ألو الإدخال في كل 20 ولادة [42 ، 43]. إعادة التركيب المتماثل بين المشتتة ألو قد تؤدي العناصر إلى عمليات تبادل جينية مختلفة ، بما في ذلك الازدواج والحذف والانتقال والتي يمكن أن تكون آلية لإنشاء التنوع الجيني في الجينوم البشري. يمكن استخدام تثبيت مواقع محددة لإدخال عنصر متحرك في مجتمع ما كسمة مميزة لتحليل النشوء والتطور ويمكن أن تكون علامات مفيدة لدراسات تنوع السكان البشري وأصولهم [44-47]. تم الإبلاغ عن وجود حوالي 5000 إدخال خاص بالنسب مثبتة في الجينوم البشري منذ الاختلاف [48 ، 49]. لكن، ألو يمكن أن يكون للإدخال أيضًا عواقب سلبية ويمكن أن يؤدي إلى تلف الجينوم البشري.

4. ألو- إعادة التركيب الوسيط وإسهام الطفرات الإدراجية في أمراض الإنسان

يمكن أن تنجم العديد من الاضطرابات الوراثية عن أنواع مختلفة من الطفرات التي تظهر بعد إدخال أحد أنواع ألو رجعي. حدد مشروع الجينوم البشري hg18 584 مرجعًا بشريًا محددًا ألو الإضافات [43]. ألو يمكن أن يؤثر الإدخال في استقرار الجينوم ، وهو مسؤول عن 0.1٪ من جميع الاضطرابات الوراثية البشرية [9] مثل المرض الوراثي الوراثي [50] ، والتليف الكيسي [51] ، ومرض دنت [52 ، 53] ، و agammaglobulinemia المرتبط بالكروموسوم X [54] –57] ، الهيموفيليا A و B [58-60] ، متلازمة التكاثر اللمفاوي المناعي الذاتي [61] ، متلازمة Apert [62] ، الورم العصبي الليفي من النوع 1 [63] ، نقص كيناز الجلسرين المعزول الحميد [64] ، فرط IgM مع متلازمة نقص المناعة [65] ] ، مرض مينكس [66] ، متلازمة ألستروم [67] ، التهاب الشبكية الصباغي [68] ، أكولين استيرازيميا [69] ، ضمور بصري جسمي سائد [70] ، فقر دم انحلالي [24] ، متلازمة فرعي-أوتو كلوي جسمية [71] ، البورفيريا الحادة المتقطعة [72] ، داء الشحميات المخاطية II [73] ، وأنواع عديدة من السرطان [23 ، 74-77] على سبيل المثال لا الحصر. هناك العديد من الآليات التي ألو يمكن أن تغير التركيب الجيني. بالإضافة إلى التأثير المحتمل لـ ألو إدراج العناصر الرجعية في التسبب في أمراض الإنسان ، وتشتت واسع في جميع أنحاء الجينوم يوفر فرصة لإعادة التركيب المتماثل والتقاطع غير المتكافئ. إعادة التركيب بين ألو تؤدي العناصر الرجعية على نفس الكروموسوم إلى تكرار أو حذف التسلسلات بين أليس. عندما يحدث إعادة التركيب على كروموسومات مختلفة ، فإنه يؤدي إلى عمليات نقل أو إعادة ترتيب الكروموسومات. تم الإبلاغ عن العديد من الأمراض البشرية المرتبطة ألو أحداث إعادة التركيب مثل مرض جوشر [78] ، فرط كوليسترول الدم [79-82] ، مرض الورم الحبيبي المزمن [83] ، α- الثلاسيميا [84 ، 85] ، السكري [86] ، أهبة التخثر [87] ، نقص البروتين الشحمي [88] ، والشلل النصفي التشنجي من النوع 11 [89].

الاغلبية العظمى من ألو الإدخالات التي أدت إلى إدخال مرض بشري في exons المشفرة ، بالقرب من مناطق المحفز / المحسن ، أو في الإنترونات نسبيًا بالقرب من exon. ألو تساهم عمليات الإدخال في المرض إما عن طريق تغيير نسخ الجين بالتأثير على محفزه (تغيير حالة المثيلة أو إدخال تسلسل تنظيمي إضافي) أو تعطيل منطقة الترميز أو تعطيل تضفير الجين. تمت مناقشة هذه الآليات بشكل مكثف سابقًا ، وتم توجيه القارئ إلى العديد من المراجعات الأنيقة [11 ، 90-92]. بالرغم ان ألو تنتشر العناصر على نطاق واسع في جميع أنحاء الجينوم البشري ، ويبدو أن بعض الجينات والكروموسومات والمناطق أكثر عرضة للإدخال المسببة للأمراض من غيرها.

5. ألو تراكم الحمض النووي الريبي يحث على التنكس البقعي المرتبط بالعمر (AMD)

ألو لقد ثبت مؤخرًا أن تعبير الحمض النووي الريبي وتراكمه ، بدلاً من التحويل الرجعي أو الإدخال أو إعادة التركيب بحد ذاته ، متورط في مرض التنكس البقعي "الجاف" المتقدم المرتبط بالعمر [10] ، وهو السبب الرئيسي للعمى لدى كبار السن في جميع أنحاء العالم [10 ، 93]. هذا الشكل الضموري ، الضمور الجغرافي (GA) ، يتضمن تغيرات في توزيع الصبغة ، وفقدان خلايا RPE والمستقبلات الضوئية وتناقص وظيفة الشبكية بسبب ضمور الخلايا الكلي [94]. تؤكد جميع الدراسات الاعتماد القوي للمرض على العمر ، والذي ينشأ على الأرجح من تفاعل معقد من العوامل الأيضية والوظيفية والجينية والبيئية [95-97]. على الرغم من أن الآليات الجزيئية التي يقوم عليها هذا المرض ليست مفهومة تمامًا ، إلا أن هناك أدلة مثيرة للاهتمام على أن الحمض النووي الريبي الخارجي (dsRNA) يمكن أن ينشط مستقبلات تشبه الرقم -3 (TLR3-) التهابات وإفراز البروتين الكيميائي وموت خلايا RPE الناجم عن [98-100]. فئران خروج المغلوب TLR3 محمية ضد تنكس RPE الناجم عن الرنا المزدوج الجديلة (dsRNAs) الخارجية [100]. أدت الظاهرة التي لوحظت في نموذج الفأر لـ AMD إلى فرضية أن تنشيط TLR3 بواسطة dsRNAs الذاتية قد يسبب AMD في البشر. اكتشف كانيكو وزملاؤه [10] نشاطًا مناعيًا وفيرًا للحمض الريبي النووي الريبي في الظهارة الظهارية من عيون بشرية مريضة ولكن ليست طبيعية. أظهر التضخيم المستقل عن التسلسل لهذه dsRNAs المنعزلة والممتدة مناعًا أن الأمبليكونات تنتمي إلى ألو فصيلة فرعية مربعة (انضمام GenBank رقم HN176584 و HN176585). لقد أصبح من الواضح أن النسخ ثنائي الاتجاه وتكوين الرنا المزدوج الجديلة (dsRNA) أكثر انتشارًا مما كان يُعتقد سابقًا [101-103]. أليس قادرة على طي الظهر لتكوين هياكل دبوس الشعر. اثنان قريبان (& lt2 kb) ألو قد تقوم العناصر في الاتجاه المعاكس بزوج أساسي يؤدي إلى تكوين dsRNA مستقر طويلًا ويصبح هدفًا رئيسيًا لنزع أمين الأدينوزين الذي يعمل على تحرير RNA (ADARs) A-to-I [104]. على الرغم من أن الدور الدقيق لتعديل الحمض النووي الريبي لا يزال تخمينيًا ، إلا أنه قد يؤثر على استقرار الحمض النووي الريبي (dsRNA) واحتفاظه النووي [105-107]. ألو يبدو أن الحمض النووي الريبي عبارة عن نسخ بوليميراز III حرة وغير مدمجة [10] وقد تراكمت بشكل أساسي في سيتوبلازم خلايا RPE مما يشير إلى أنها قد تفلت من تحرير ADARs والاحتفاظ النووي. ومع ذلك ، لا توجد بيانات متاحة ، على حد علمنا ، فيما يتعلق بـ ADARs والنشاط المعقد المرتبط بنقشة المظلة في RPE من GA مقارنة بالعين الطبيعية ، وستحتاج هذه المنطقة بلا شك إلى مزيد من التحقيقات. مرة واحدة في السيتوبلازم ، أليس يجب شقها بواسطة DICER1 حيث ثبت أنها ركائز لـ DICER1. تم إثبات أن إنزيم RNase DICER1 ، وهو إنزيم رئيسي لمعالجة الحمض النووي الريبي الصغير (miRNA-) ، يتم تنظيمه بشكل كبير في RPE من GA مقارنة بالعين الطبيعية مما يفسر تراكم ألو الحمض النووي الريبي [10]. ومن المثير للاهتمام ، أن DICER1 الذي يتم التعبير عنه أيضًا في نواة خلايا RPE ووظيفتها (سواء كانت مكعبات ألو أم لا) وكذلك مستويات التعبير النووي في GA مقارنة بالعين الطبيعية لا تزال غير معروفة. في تجربة موازية على الفئران ، تسبب فقدان Dicer1 في B1 / B2 (ألوالعناصر المشابهة) التراكم وتنكس خلايا الظهارة RPE. بدلاً من ذلك ، يؤدي هذا إلى أسئلة بيولوجية إضافية كما هو الحال في الظروف العادية حيث يعمل DICER1 بكامل طاقته ، ما هي ألو- (أو B1 / B2-) المنتجات المشقوقة؟ ما هي مدتها؟ وما هي (هي) وظيفتهم (وظائفهم) البيولوجية؟

بشكل غير متوقع وعلى عكس الحمض النووي الريبي الخارجي (dsRNAs) ، أليس تسبب في موت خلايا RPE بشكل مستقل عن miRNA و TLR3 بالإضافة إلى مجموعة متنوعة من مستشعرات TLRs و RNA [108]. في الجسم الحي و في المختبر أظهرت الدراسات الوظيفية ذلك أليس يسبب موت خلايا الظهارة RPE عن طريق مسار الاستشعار المناعي الفطري وعائلة NLR المنشط ، مجال البيرين الذي يحتوي على 3 (NLRP3) التهاب ملتهب [108].أدى تنشيط الجسيم الملتهب NLRP3 إلى تنشيط كاسباس -1 والنضج الناجم عن إنترلوكين -18 (IL-18) والذي بدوره أدى إلى تنشيط جين الاستجابة الأولية للتمايز النخاعي 88 (MyD88) (فسفرة الكيناز -1 المرتبط بمستقبلات إنترلوكين -1) و -4 (IRAK1 و IRAK4)) [108] (الشكل 2). تأثير ألو تم التوسط أيضًا في تنكس خلايا RPE عن طريق تنشيط كيناز منظم بالإشارة خارج الخلية (ERK) 1/2 MAPK [109] ومع ذلك ، لا تزال سلسلة التسلسل العلوي والسفلي غير معروفة وهناك ما يبرر إجراء مزيد من التحقيقات. من المتصور أن تنشيط ERK1 / 2 قد يكون في اتجاه المصب من IL-18 و MyD88 [110-112] ، والعديد من الإمكانات الأخرى ألوقد تكون مسارات الإشارات الوسيطة متضمنة.


نموذج لمصير ألو RNAs في RPE من GA eye. أليس يمكن أن تشكل هياكل RNA مزدوجة طويلة وأن تشكل أهدافًا لنشاط تحرير ADAR A-to-I RNA. المحرر ألو قد ترتبط الحمض النووي الريبي بالنقشة التي تحتوي على البروتينات النووية P54nrb و PSF و martin 3 ومن المتوقع أن يتم الاحتفاظ بها على المصفوفة النووية في العين العادية. في العين المريضة ، يكون DICER1 غير منظم و ألو يتم تصدير RNAs وتجميعها في السيتوبلازم مما يؤدي إلى تنشيط NLRP3 الملتهب و MyD88 ، والذي بدوره قد ينشط ERK1 / 2 ويحث على تنكس خلايا RPE.

6. عائلة ADAR الجينات و ألو تحرير RNA

إن ديمينازات الأدينوزين التي تعمل على الحمض النووي الريبي (ADARs) عبارة عن بروتينات ترتبط بالحمض النووي الريبي مزدوج الشريطة وتسبب تعديل الأدينوزين إلى إينوزين عبر تفاعل نزع الأمين المائي [113]. يمكن أن يؤدي تحرير الحمض النووي الريبي من A إلى I في مناطق الترميز لجينات معينة إلى تغييرات وظيفية في منتج البروتين [١١٤ ، ١١٥] ، في حين أن تحرير المناطق غير المشفرة قد يؤثر على التضفير ، أو الاستقرار ، أو الكفاءة التحويلية لهذه الرنا المرسال المستهدفة [١١٤ ، ١١٥]. 116 ، 117]. لا يزال الدور الدقيق لتعديل الحمض النووي الريبي تخمينيًا ، وقد يعمل ADAR كآلية دفاع مضاد للفيروسات ضد فيروسات الرنا المزدوج الجديلة [118] ، أو يعادي الرنا المزدوج الجديلة dsRNA الخاضع لمسار إسكات الجين بوساطة RNAi [119 ، 120] ، و / أو ضد dsRNA المتكون بواسطة ألو كرر العناصر أو عن طريق نصوص المعنى والمضاد.

تم التعرف على ثلاثة أفراد من عائلة ADAR [121-125] ، ويتم حفظهم في منطقة نزع الأمين الطرفي C وكذلك في نطاقات ربط الحمض النووي الريبي مزدوجة الشريطة. يتم التعبير عن الثدييات ADAR1 و ADAR2 في كل مكان في العديد من الأنسجة ومع ذلك ، يتم التعبير عن ADAR3 بشكل أساسي في الدماغ [126]. لقد ثبت أن ADAR3 يحتوي على مجالات ربط RNA مفردة ومزدوجة تقطعت بهم السبل. تشبه dsRBDs الخاصة بـ ADARs تلك الموجودة في بروتين كيناز PKR المنشط بحمض الحمض النووي الريبي (PKR) وهو مادة تحفيز مضاد للفيروسات تشارك في الآليات المضادة للفيروسات [127 ، 128] بالإضافة إلى Drosha و Dicer ، وهما إنزيمات رئيسية تشارك في التكوُّن الحيوي للـ miRNA [129]. تزداد كفاءة تحرير ADAR مع dsRNA الأطول [130]. يتم تحرير الميزات الهيكلية الثانوية للحمض النووي الريبي المكونة من دبابيس الشعر التي تحتوي على عدم التطابق والانتفاخات والحلقات بشكل انتقائي أكثر من الحمض النووي الريبي المزدوج المزدوج تمامًا. تعتمد كفاءة التحرير أيضًا على سياق تسلسل النيوكليوتيدات المحيطة بشق الأدينوزين المراد تحريره [131]. من المثير للاهتمام أن ADAR3 ليس نشطًا على الركائز الأخرى المعروفة لـ ADAR1 / 2 أو على dsRNA الطويل في المختبر. تعمل ADARs بمثابة ثنائى في الثدييات ، و ADAR1 و 2 لا يشكلان مقاييس متجانسة ويجب أن تشكل معايرات متجانسة لتكون نشطة [132] ومع ذلك ، فإن ADAR3 لا يتحول إلى ديمر مما يفسر افتقارها إلى النشاط. هناك نوعان من الأشكال الإسوية لـ ADAR1 ، الشكل الأطول ADAR1p150 الذي يتم التعبير عنه في السيتوبلازم والنواة والأقصر ADAR1p110 الذي يبقى في النواة [133]. يحمل كلا الشكلين الإسفيني إشارة توطين نووي [134]. كل من ADAR1 و ADAR2 موجودان في الحجرة النووية ويتم نقلهما إلى النيوكليوبلازم عند وجود ركيزة تحرير نشطة [135 ، 136]. يتم تنظيمها عن طريق الالتهاب ووجود الرنا المرسال الغني بالإينوزين [137]. تعتبر بروتينات ADARs بالإضافة إلى ركائزها dsRNA التي تتوسط في تحرير A-to-I مهمة ، ويحدد كلاهما التأثير الكلي لتحرير RNA.

أليس هي الأهداف الرئيسية لتعديل ADAR A-to-I [104 ، 138–141] لأنها تخلق هياكل دبوس شعر طويلة يمكن لـ ADARs القضاء عليها. أظهر تحليل حسابي أنه تم العثور على 88٪ من أحداث التحرير A-to-I في أليس ، على الرغم من أنها لا تشكل سوى 20٪ من إجمالي طول النصوص [140] ، ووجد أن التحرير هو الأكثر انتشارًا في الدماغ مقارنة بالأنسجة الأخرى [139]. قد يسأل المرء ما إذا كان ألو تصبح هياكل دبوس الشعر عند التحرير أكثر استقرارًا أو عدم استقرار (تقل في حبلاها المزدوج)؟ تشير الدراسات السابقة إلى عدم اتساق مجموعتي Levanon و Blow [139 ، 141] التي أشارت إلى أن تأثير التحرير يهدف إلى زعزعة استقرار ألو dsRNA ومع ذلك ، Athanasiadis et al. [104] اقترح أن التأثير الكلي هو استقرار ألو dsRNA وهذه المنطقة بحاجة إلى مزيد من التحقيقات. السؤال التالي هو ما هي العواقب الوظيفية والبيولوجية ألو التحرير بواسطة ADARs؟ كما ذكر المؤلفون سابقًا ، ألو التحرير بواسطة ADARs قد ينظم أنشطة النسخ من ألو أثناء الإجهاد الخلوي أو التأثير على المعالجة ، والاستقرار (عدم القدرة) ، والاحتفاظ النووي ، وتصدير ألو الحمض النووي الريبي. بينما لا يوجد دليل كيميائي حيوي مباشر على إسكات الكروماتين بوساطة الحمض النووي الريبي في حقيقيات النوى الأعلى ، هناك فرضية أنه في خلايا الثدييات يمكن أن تحفز الحمض النووي الريبي الحمض النووي الريبي إسكات الجينات المرتبطة بمثيل الحمض النووي [142]. علاوة على ذلك ، تشير الدراسات الحديثة إلى وجود صلة مباشرة لتورط ADARs في مسار إسكات الجين RNAi [143].

6.1 الآليات الخلوية الأخرى التي قد تتعامل معها ألو الرنا المزدوج الجديلة dsRNAs

تم تحديد أكثر من عشرين بروتينًا يؤوي مجالات ربط dsRNA (DRBPs) ، وهناك عدة طرق متميزة يمكن من خلالها اكتشاف dsRNAs وحلها. قد تتفاعل العوامل النووية المرتبطة بـ dsRNA (NFAR) [144–147] ، الأعضاء النوويين في DRBPs ، مع ألو dsRNA ، على الرغم من ألو تحفز dsRNAs تنكس خلايا RPE بشكل مستقل عن PKR [108] وترتبط NFARs فعليًا بـ PKR ، وقد تعمل في أحداث إشارات بوساطة PKR في الخلية [147]. ألو قد يتفاعل الرنا المزدوج الجديلة أيضًا مع البروتين المرتبط بالحمض النووي الريبي المحيط بالنواة (SPNR) والذي يتم التعبير عنه في العديد من الأنسجة بما في ذلك الخصية والمبيض والدماغ. على الرغم من أن تعبير البروتين SPNR يقتصر على الخصية ، فإن العيوب العصبية في الفئران التي تفتقر إلى وظيفة SPNR تشير إلى أدوار أخرى لـ SPNR خارج تكوين الحيوانات المنوية [148]. ألو يمكن أن تتحلل الرنا المزدوج الجديلة بواسطة نوكليازات محددة من الرنا المزدوج الجديلة [149] أو تنحل بواسطة هليكازات الرنا المزدوج الجديلة [150 ، 151]. يحتوي RNA Helicase A (RHA) على اثنين من DRBPs ويربطان بـ dsRNA بالإضافة إلى ssRNA و ssDNA من خلال صندوق RGG طرفي كربوكسيل [152 ، 153]. قد يتفاعل أعضاء نوويون آخرون في DRBPs مثل بروتين ربط العنصر التنظيمي السلبي (NREBP) [154 ، 155] وكانادابتين [156 ، 157] مع ألو dsRNA ، على الرغم من أن دورها لا يزال تخمينيًا. لقد أظهرنا أن dysregulation الناجم عن Dicer ألو التراكم والسمية الخلوية في خلايا RPE ، ولكن لا يمكننا استبعاد التورط المحتمل لأعضاء السيتوبلازم الآخرين في DRBPs مثل منشط البروتين PKR (PACT) [158] و staufen [159] ، وهناك حاجة إلى مزيد من الدراسات لتحديد ما إذا ألو يرتبط الحمض الريبي النووي النقال بهذه البروتينات DRBPs النووية و السيتوبلازمية وأهميتها البيولوجية في العين العادية والمريضة.

7. ملاحظات ختامية

عناصر التكرار هي مكونات تحدد المناظر الطبيعية لجينومنا ، وهي عناصر "نقاط ساخنة" يمكن أن تؤثر على صحتنا من خلال آليتين مختلفتين على الأقل: (1) التكاثر الذاتي والانتقال الرجعي و (2) التراكم والسمية الخلوية. لا يزال هناك العديد من الأسئلة دون حل: لماذا وكيف ألو RNAs تتراكم في RPE لمرضى GA؟ من الممكن أن تؤدي إهانات الإجهاد المزمنة (الإجهاد التأكسدي ، والصدمة الحرارية ، والعدوى الفيروسية ، وما إلى ذلك) إلى جانب التقدم في السن والشيخوخة إلى تحفيز ألو تراكم الحمض النووي الريبي [160-163]. سؤال مهم آخر هو: هي ألو RNAs المتراكمة في أمراض التنكس العصبي الأخرى المرتبطة بالعمر؟ ومع ذلك ، فقد اقترحت بعض الدراسات أن الجهاز العصبي المركزي هو بيئة مميزة للتبديل. بالإضافة إلى ذلك ، فقد ثبت أن DICER1 والضبط الدقيق لشبكة الجينات ميرنا حاسمان لسلامة الخلايا العصبية. في الواقع ، يؤدي الاستئصال الجيني لـ DICER1 إلى تحفيز التنكس العصبي عن طريق فرط فسفرة بروتين تاو وتفعيل ERK1 / 2 [164 ، 165]. علاوة على ذلك ، فقد ثبت أن الجسيم الملتهب NALP3 متورط في مرض الزهايمر (AD) [166]. لقد ثبت أن اللوائح المعدلة لـ DICER1 و miRNA متورطة في أمراض تنكسية عصبية أخرى مثل مرض هنتنغتون [167] وأمراض باركنسون [168] ومع ذلك ، ألو لم يتم الإبلاغ عن التنميط RNA حتى الآن.

تتوفر تقنيات التسلسل الجديدة جنبًا إلى جنب مع التحليلات الوظيفية الصارمة لدراسة الموبيلوم ، وسوف تسفر بالتأكيد عن رؤى أكثر قيمة في كل من الخصائص الوظيفية للأحجار الجينية والتسبب في المرض.

إعتراف

يود المؤلف أن يشكر Whitfield R. و Bennett B. و Albright J. على المناقشات.

مراجع

  1. روجرز ، "Retroposons المعرفة ،" طبيعة سجية، المجلد. 301 ، لا. 5900 ، المقالة 460 ، 1983. عرض في: موقع الناشر | منحة جوجل
  2. إس إل ماتياس ، إيه إف سكوت ، إتش إتش كازازيان جونيور ، جي دي بوك ، وأيه غابرييل ، "النسخ العكسي المشفر بواسطة عنصر بشري قابل للتبديل ،" علم، المجلد. 254 ، لا. 5039، pp. 1808–1810، 1991. View at: Google Scholar
  3. م.ديوانيو ، سي إسنو ، وت.هايدمان ، "التحويل الرجعي المتوسّط للخط ألو التسلسلات ، " علم الوراثة الطبيعي، المجلد. 35 ، لا. 1، pp. 41–48، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  4. سي دبليو شميد و دبليو آر جيلينك ، "إن ألو عائلة من المتواليات المتكررة المتفرقة ، " علم، المجلد. 216 ، لا. 4550 ، ص 1065-1070 ، 1982. عرض على: الباحث العلمي من Google
  5. T.A Allen ، S. von Kaenel ، J.A Goodrich ، and J.F Kugel ، "يقوم الفأر المشفر SINE B2 RNA بقمع نسخ mRNA استجابةً للصدمة الحرارية ،" علم الأحياء الهيكلية والجزيئية الطبيعة، المجلد. 11 ، لا. 9، pp.816–821، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  6. C.A Espinoza و T. علم الأحياء الهيكلية والجزيئية الطبيعة، المجلد. 11 ، لا. 9، pp.822–829، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  7. بي دي مارينر ، آر دي والترز ، سي إيه إسبينوزا وآخرون ، "الإنسان ألو RNA هو مثبط معاملات معياري لنسخ mRNA أثناء الصدمة الحرارية ، " الخلية الجزيئية، المجلد. 29 ، لا. 4 ، ص 499-509 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  8. G. Lev-Maor و R. Sorek و N. Shomron و G. Ast ، "ولادة exon المقسم البديل: 3" تحديد موقع لصق في ألو exons ، " علم، المجلد. 300 ، لا. 5623 ، ص 1288-1291 ، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  9. بي إل دينينجر وإم إيه باتزر ، "ألو يتكرر والمرض البشري ، " علم الوراثة الجزيئية والتمثيل الغذائي، المجلد. 67 ، لا. 3، pp. 183–193، 1999. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  10. H. Kaneko، S. Dridi، V. Tarallo et al.، “يحفز العجز DICER1 ألو سمية الحمض النووي الريبي في التنكس البقعي المرتبط بالعمر " طبيعة سجية، المجلد. 471، pp.325–330، 2011. View at: Google Scholar
  11. إم إيه باتزر وبي. إل دينينجر ، "ألو يكرر والتنوع الجيني البشري ، " مراجعات الطبيعة علم الوراثة، المجلد. 3 ، لا. 5، pp.370–379، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  12. E.D Gundelfinger و M. di Carlo و D. Zopf و M. Melli ، "هيكل وتطور مكون 7SL RNA لجسيم التعرف على الإشارة" مجلة EMBO، المجلد. 3 ، لا. 10 ، ص 2325 - 2332 ، 1984. عرض على: الباحث العلمي من Google
  13. E. Ullu و C. Tschudi ، "ألو يتم معالجة تسلسل الجينات 7SL RNA ، " طبيعة سجية، المجلد. 312 ، لا. 5990 ، الصفحات من 171 إلى 172 ، 1984. عرض على: الباحث العلمي من Google
  14. سيجل و P. والتر ، "إزالة ألو المجال الهيكلي من جسيم التعرف على الإشارة يترك نشاط نقل البروتين سليمًا ، " طبيعة سجية، المجلد. 320 ، لا. 6057 ، ص 81-84 ، 1986. عرض على: الباحث العلمي من Google
  15. سي دبليو شميد ، "ألو: طفيلي طفيلي؟ " علم الوراثة الطبيعي، المجلد. 35 ، لا. 1، pp. 15–16، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  16. R.H Waterston ، K. Lindblad-Toh ، E. Birney et al. ، "التسلسل الأولي والتحليل المقارن لجينوم الفأر ،" طبيعة سجية، المجلد. 420 ، ص.520-562 ، 2002. عرض على: الباحث العلمي من Google
  17. Y. Quentin ، "تسلسل رئيسي متعلق باليسار الحر ألو مونومر (FLAM) في أصل عائلة B1 في جينومات القوارض ، " بحوث الأحماض النووية، المجلد. 22 ، لا. 12، pp. 2222–2227، 1994. View at: Google Scholar
  18. لابودا ، دي سينيت ، سي ريتشر ، جي إم ديراجون ، وجي سترايكر ، "تطور الفأر B1 يكرر: 7SL RNA نمط الطي محفوظ ،" مجلة التطور الجزيئي، المجلد. 32 ، لا. 5، pp.405–414، 1991. View at: Google Scholar
  19. A. S. Krayev و T. بحوث الأحماض النووية، المجلد. 10 ، لا. 23 ، ص 7461-7475 ، 1982. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  20. G.R.Daniels و P. L.Deininger ، "تكرار تسلسل العائلات المستمدة من جينات الحمض النووي الريبي للثدييات ،" طبيعة سجية، المجلد. 317 ، لا. 6040 ، ص 819-822 ، 1985. عرض على: الباحث العلمي من Google
  21. J. Kim and P. L. Deininger ، "التضخيم الأخير لتسلسلات معرف الفئران ،" مجلة البيولوجيا الجزيئية، المجلد. 261 ، لا. 3، pp.322–327، 1996. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  22. I.M Serdobova and D. A. Kramerov ، "retroposons short of the B2 superfamily: Evolution and application for the study of the Obent phylogeny،" مجلة التطور الجزيئي، المجلد. 46 ، لا. 2، pp. 202–214، 1998. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  23. C. S. Lin ، D. A. Goldthwait ، و D. Samols ، "تحديد ألو التحويل في خلايا سرطان الرئة البشرية ، " زنزانة، المجلد. 54 ، لا. 2، pp. 153–159، 1988. View at: Google Scholar
  24. مانكو ، إل ريلفاس ، سي إس بينتو ، جي بيريرا ، أ. الدم، المجلد. 91 ، لا. 2، pp.266–267، 2006. View at: Google Scholar
  25. C.W.S Schmidt and P. L. Deininger، "Sequence Organization of the human genome،" زنزانة، المجلد. 6 ، لا. 3، pp.345–358، 1975. View at: Google Scholar
  26. سي إم هوك ، إف بي رينهارت ، وسي دبليو شميد ، "عائلة منتشرة في كل مكان من تسلسلات الحمض النووي المتكررة في الجينوم البشري ،" مجلة البيولوجيا الجزيئية، المجلد. 132 ، لا. 3، pp.289–306، 1979. View at: Google Scholar
  27. سي إم روبين ، سي إم هوك ، وبي إل دينينجر ، "تسلسل النوكليوتيدات الجزئي من 300 نيوكليوتيد يتخلل تسلسل الحمض النووي البشري المتكرر ،" طبيعة سجية، المجلد. 284 ، لا. 5754، pp.372–374، 1980. View at: Google Scholar
  28. E. S. Lander ، L.M Linton ، B. Birren et al. ، "التسلسل الأولي وتحليل الجينوم البشري ،" طبيعة سجية، المجلد. 409 ، ص 860-921 ، 2001. عرض على: الباحث العلمي من Google
  29. M.R Shen و J. Brosius و P. L. Deininger ، "BC1 RNA ، نسخة من جين رئيسي لتضخيم عنصر المعرف ، قادرة على تمهيد النسخ العكسي الخاص بها ،" بحوث الأحماض النووية، المجلد. 25 ، لا. 8، pp.1641–1648، 1997. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  30. Q. Feng ، J.V Moran ، H. H. Kazazian ، and J.D Boeke ، "Human L1 retrotransposon يشفر نوكليازًا داخليًا محفوظًا مطلوبًا للنقل الرجعي ،" زنزانة، المجلد. 87 ، لا. 5، pp. 905–916، 1996. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  31. جيه في موران ، إس إي هولمز ، تي بي ناس ، آر جيه ديبيراردينيس ، جيه دي بوك ، هـ إتش كازازيان جونيور ، "التحويل الرجعي عالي التردد في خلايا الثدييات المستزرعة ،" زنزانة، المجلد. 87 ، لا. 5، pp.917–927، 1996. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  32. J. Jurka ، "تشير أنماط التسلسل إلى تورط إنزيمي في تكامل retroposons للثدييات ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 94 ، لا. 5، pp. 1872–1877، 1997. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  33. جيه دي بوك ، "LINEs and ألو& # x2014 اتصال polyA ، " علم الوراثة الطبيعي، المجلد. 16 ، لا. 1 ، الصفحات 6-7 ، 1997. عرض على: الباحث العلمي من Google
  34. سلاجيل وإي فليمنجتون وف. تراينا دورجي ، "المجموعات والعلاقات الأسرية من ألو الأسرة في الجينوم البشري ، " علم الأحياء الجزيئي والتطور، المجلد. 4 ، لا. 1، pp. 19–29، 1987. View at: Google Scholar
  35. بي إل دينينجر وف.ك.سلاجيل ، "تضخمت مؤخرًا ألو يشترك أفراد الأسرة في والد مشترك ألو تسلسل،" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 8 ، لا. 10، pp. 4566–4569، 1988. View at: Google Scholar
  36. J. Jurka و T. Smith ، "قسم أساسي في ألو عائلة من التسلسلات المتكررة ، " وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 85 ، لا. 13 ، ص 4775-4778 ، 1988.عرض على: الباحث العلمي من Google
  37. جي بي هاتشينسون ، إس إي أندرو ، إتش ماكدونالد وآخرون ، "آن ألو عنصر رجعي في عائلتين مصابتين بمرض هنتنغتون يحدد نشاطًا جديدًا ألو فصيلة فرعية ، " بحوث الأحماض النووية، المجلد. 21 ، لا. 15، pp. 3379–3383، 1993. View at: Google Scholar
  38. J. Jurka ، "فصيلة فرعية جديدة من الإنسان المعاد طرحه مؤخرًا ألو يتكرر ، " بحوث الأحماض النووية، المجلد. 21 ، لا. 9 ، ص. 2252، 1993. عرض على: الباحث العلمي من Google
  39. M.A Batzer، P. L. Deininger، U. Hellmann-Blumberg et al.، "التسميات الموحدة لـ ألو يتكرر ، " مجلة التطور الجزيئي، المجلد. 42 ، لا. 1، pp.3–6، 1996. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  40. إم آر شين ، إم إيه باتزر ، وبي إل دينينجر ، "تطور السيد ألو الجينات ، " مجلة التطور الجزيئي، المجلد. 33 ، لا. 4، pp 311–320، 1991. View at: Google Scholar
  41. بي إل دينينجر ، إم إيه باتزر ، سي إيه هاتشيسون ، وإم إتش إيدجيل ، "جينات رئيسية في تضخيم الحمض النووي المتكرر للثدييات ،" الاتجاهات في علم الوراثة، المجلد. 8 ، لا. 9، pp.307–311، 1992. View at: Google Scholar
  42. إيه إم روي ، إم إل كارول ، دي إتش كاس وآخرون ، "إنسان متكامل مؤخرًا ألو يكرر: العثور على إبر في كومة القش ، " جينيتيكا، المجلد. 107 ، لا. 1 & # x20133 ، الصفحات من 149 إلى 161 ، 1999. عرض على: الباحث العلمي من Google
  43. J. Xing ، Y. Zhang ، K. Han et al. ، "العناصر المتنقلة تخلق تباينًا هيكليًا: تحليل جينوم بشري كامل ،" أبحاث الجينوم، المجلد. 19 ، لا. 9 ، ص 1516-1526 ، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  44. M.A Batzer، M. Stoneking، M. Alegria-Hartman et al.، "الأصل الأفريقي لتعدد الأشكال الخاص بالإنسان ألو عمليات الإدراج ، " وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 91 ، لا. 25، pp. 12288–12292، 1994. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  45. إم ستونكينج ، جيه جيه فونتيوس ، إس إل كليفورد وآخرون ، "ألو تعدد الأشكال الإدراج والتطور البشري: دليل على زيادة حجم السكان في أفريقيا ، " أبحاث الجينوم، المجلد. 7 ، لا. 11، pp.1061–1071، 1997. View at: Google Scholar
  46. دبليو إس واتكينز ، سي إي ريكر ، إم جيه بامشاد وآخرون ، "أنماط التنوع البشري الأسلاف: تحليل ألو-الإدراج وتعدد الأشكال في موقع التقييد ، " الصحيفة الامريكية لجينات الانسان، المجلد. 68 ، لا. 3، pp.738–752، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  47. P. Medstrand و L.N van de Lagemaat و D.L Mager ، "توزيعات Retroelement في الجينوم البشري: الاختلافات المرتبطة بالعمر والقرب من الجينات ،" أبحاث الجينوم، المجلد. 12 ، لا. 10، pp. 1483–1495، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  48. D. J. Hedges، P. A. Callinan، R. Cordaux، J. Xing، E. Barnes، and M.A Batzer، “التفاضل ألو التعبئة وتعدد الأشكال بين سلالات الإنسان والشمبانزي ، " أبحاث الجينوم، المجلد. 14 ، لا. 6 ، ص 1068-1075 ، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  49. آر إي ميلز ، إي إيه بينيت ، آر سي إيسكو وآخرون ، "الينقولات التي تم تعبئتها مؤخرًا في جينومات الإنسان والشمبانزي ،" الصحيفة الامريكية لجينات الانسان، المجلد. 78 ، لا. 4 ، ص 671-679 ، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  50. K.C Halling، C.R Lazzaro، R. Honchel et al.، "وراثي مرض ديسمويد في عائلة مع سلالة جرثومية ألو أكرر طفرة في جين APC ، " الوراثة البشرية، المجلد. 49 ، لا. 2، pp. 97–102، 1999. View at: Google Scholar
  51. J.M Chen ، E. Masson ، M. Macek et al. ، “اكتشاف اثنين ألو إدخال في جين CFTR ، " مجلة التليف الكيسي، المجلد. 7 ، لا. 1، pp.37–43، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  52. F. Claverie-Martin و H. Gonz & # xe1lez-Acosta و C. Flores و M. Ant & # xf3n-Gamero و V. Garc & # xeda-Nieto ، "De novo insertion of an ألو يؤدي التسلسل في منطقة الترميز لجين CLCN5 إلى مرض دنت ، " علم الوراثة البشرية، المجلد. 113 ، لا. 6 ، الصفحات 480-485 ، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  53. F. Claverie-Mart & # xedn و C. Flores و M. Ant & # xf3n-Gamero و H. Gonz & # xe1lez-Acosta و V. Garc & # xeda-Nieto ، "The ألو يؤدي إدخال جين CLCN5 لمريض مصاب بمرض دنت إلى تخطي exon 11 "، مجلة علم الوراثة البشرية، المجلد. 50 ، لا. 7، pp.370–374، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  54. روهرر ، واي.مينيجيشي ، د. ريختر ، ج. إيجيورين ، وإم إي كونلي ، "الطفرات غير العادية في Btk: إدخال ، تكرار ، انعكاس ، وأربع عمليات حذف كبيرة ،" علم المناعة السريرية، المجلد. 90 ، لا. 1، pp.28–37، 1999. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  55. E.K Jo و Y. Wang و H. Kanegane et al. ، "تحديد الطفرات في جين Bruton tyrosine kinase ، بما في ذلك إعادة الترتيب الجيني الجديدة التي تؤدي إلى حذف كبير ، في مرضى agammaglobulinemia الكوري المرتبط بـ X ،" مجلة علم الوراثة البشرية، المجلد. 48 ، لا. 6 ، ص 322 - 326 ، 2003. عرض على: الباحث العلمي من Google
  56. كريستوفيك ، آر إم أسبالتر ، إم إم إيبل ، وإتش إم وولف ، "توصيف طفرات جينيز التيروزين كيناز الجديدة لبروتون في مرضى أوروبا الوسطى المصابين ب agammaglobulinemia ،" علم المناعة الجزيئي، المجلد. 44 ، لا. 7 ، ص 1639-1643 ، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  57. T. Arai ، M. Zhao ، H. Kanegane et al. ، "التحليل الجيني لمتلازمة حذف الكروموسوم X المتجاورة التي تشمل جينات BTK و TIMM8A ،" مجلة علم الوراثة البشرية، المجلد. 56 ، ص 577-582 ، 2011. عرض على: الباحث العلمي من Google
  58. Vidaud، M. Vidaud، B. R. Bahnak et al.، "Haemophilia B بسبب إدخال de novo لـ ألو عضو في العائلة الفرعية داخل منطقة ترميز جين العامل IX ، " المجلة الأوروبية لعلم الوراثة البشرية، المجلد. 1 ، لا. 1، pp. 30–36، 1993. View at: Google Scholar
  59. E. Sukarova ، و A. J. Dimovski ، و P. Tchacarova ، و G. H. Petkov ، و G. D. Efremov ، "An ألو يُدرج كسبب للشكل الحاد من الهيموفيليا أ ، " اكتا هيماتولوجيكا، المجلد. 106 ، لا. 3، pp. 126–129، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  60. A. Ganguly و T. Dunbar و P. Chen و L. Godmilow و T. Ganguly ، "تخطي Exon الناجم عن إدخال داخلي لشاب ألو يؤدي عنصر Yb9 إلى الإصابة بمرض الهيموفيليا أ شديد " علم الوراثة البشرية، المجلد. 113 ، لا. 4، pp.348–352، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  61. P. J. Tighe، S. E. Stevens، S. Dempsey، F. le Deist، F.Rieux-Laucat، and J.D Edgar، “Inactivation of the Fas gene by ألو الإدراج: التحويل الرجعي في الإنترون يسبب تباين التضفير ومتلازمة التكاثر اللمفاوي المناعي الذاتي ، " الجينات والمناعة، المجلد. 3 ، الملحق 1 ، الصفحات من S66 إلى S70 ، 2002. عرض على: الباحث العلمي من Google
  62. إم أولدريدج ، إي إتش زاكاي ، دي إم ماكدونالد ماكجين وآخرون ، "دي نوفو ألو- تحدد عمليات إدخال العنصر في FGFR2 أساسًا مرضيًا متميزًا لمتلازمة Apert ، " الصحيفة الامريكية لجينات الانسان، المجلد. 64 ، لا. 2، pp. 446–461، 1999. View at: Google Scholar
  63. إم آر والاس ، إل بي أندرسن ، إيه إم ساولينو ، بي إي غريغوري ، تي دبليو جلوفر ، إف إس كولينز ، "A de novo ألو يؤدي الإدخال إلى ورم ليفي عصبي من النوع 1 ، " طبيعة سجية، المجلد. 353 ، لا. 6347 ، ص 864-866 ، 1991. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  64. Y. Zhang ، K.M Dipple ، E. Vilain et al. ، "ألوإدخال Y (IVS4-52ins316ألو) في جين الجلسرين كيناز من فرد مصاب بنقص كيناز الجلسرين الحميد ، " الطفرة البشرية، المجلد. 15، pp.316–323، 2000. View at: Google Scholar
  65. P. A. Apoil و E. Kuhlein و A. Robert و H. Rubie و A. Blancher ، "متلازمة HIGM الناتجة عن إدخال ألوعنصر Yb8 في exon 1 من جين CD40LG ، " علم الوراثة المناعية، المجلد. 59 ، لا. 1، pp. 17–23، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  66. Y. Gu و H. Kodama و S. Watanabe et al. ، "أول حالة تم الإبلاغ عنها لمرض مينكس ناجم عن ألو طفرة الإدراج ، " الدماغ والتنمية، المجلد. 29 ، لا. 2، pp.105–108، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  67. M. Taskesen ، G.B Collin ، A. V. Evsikov et al. ، “Novel ألو إدخال ينقّل خلفيّ يؤدي إلى متلازمة ألستروم ، " علم الوراثة البشرية، المجلد. 131 ، ص 407-413 ، 2012. عرض على: الباحث العلمي من Google
  68. B. A. Tucker ، T. E. Scheetz ، R.F Mullins et al. ، "تسلسل Exome وتحليل الخلايا الجذعية المستحثة متعددة القدرات تحدد الجين المرتبط بالأهداب كيناز الذكري المرتبط بالخلايا الجرثومية (MAK) كسبب لالتهاب الشبكية الصباغي ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 108 ، الصفحات من E569 إلى E576 ، 2011. عرض على: الباحث العلمي من Google
  69. موراتاني ، ت. هادا ، واي ياماموتو وآخرون ، "تعطيل جين استيراز الكولين عن طريق ألو الإدراج: الآلية المحتملة لتبديل الجينات البشرية ، " وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 88 ، لا. 24، pp. 11315–11319، 1991. View at: Google Scholar
  70. G. N. Gallus ، E. Cardaioli ، A. Rufa et al. ، "ألو- إدخال عنصر في تسلسل intron OPA1 المرتبط بضمور بصري جسمي سائد ، " الرؤية الجزيئية، المجلد. 16، pp. 178–183، 2010. View at: Google Scholar
  71. S. Abdelhak، V. Kalatzis، R. Heilig et al.، "Clustering of mutations المسؤولة عن المتلازمة التفرع oto-oto-renal (BOR) في العيون الغائبة للمنطقة المتجانسة (eyaHR) من EYA1 ،" علم الوراثة الجزيئية البشرية، المجلد. 6 ، لا. 13 ، ص 2247-2255 ، 1997. عرض على: الباحث العلمي من Google
  72. S. Mustajoki ، H. Ahola ، P. Mustajoki ، و R. Kauppinen ، "Insertion of ألو العنصر المسؤول عن البورفيريا الحادة المتقطعة ، " الطفرة البشرية، المجلد. 13، pp.431–438، 1999. View at: Google Scholar
  73. B. Tappino ، S. Regis ، F. Corsolini ، و M. Filocamo ، “An ألو إن الإدخال في تغاير الزيجوت المركب مع مضاعفة دقيقة في جين GNPTAB هو الأساس وراء داء الشحوم المخاطية II ، " علم الوراثة الجزيئية والتمثيل الغذائي، المجلد. 93 ، لا. 2، pp. 129–133، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  74. S. M. Rowe، S.J Coughlan، N.J McKenna et al.، “المبيض المرتبط بسرطان المبيض المرتبط بتقييد طول جزء تعدد الأشكال في intron G من جين مستقبل البروجسترون يرجع إلى ألو إدخال التسلسل " ابحاث السرطان، المجلد. 55 ، لا. 13، pp.2743–2745، 1995. View at: Google Scholar
  75. Y.Miki ، T. Katagiri ، F. Kasumi ، T. Yoshimoto ، and Y. Nakamura ، "تحليل الطفرات في جين BRCA2 في سرطانات الثدي الأولية ،" علم الوراثة الطبيعي، المجلد. 13 ، لا. 2، pp.245–247، 1996. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  76. T. Wang ، I. Lerer ، Z. Gueta et al. ، "طفرة حذف / إدخال في جين BRCA2 في عائلة سرطان الثدي: دور محتمل لـ ألو-البولي ذيل في تطور الحذف ، " الجينات والكروموسومات والسرطان، المجلد. 31 ، لا. 1، pp.91–95، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  77. أميت ، إن سيلا ، هـ. كيرين وآخرون ، "الاستثناء المتحيز للعناصر المنقولة في الجينات المضاعفة: درس من جين TIF-IA ،" علم الأحياء الجزيئي BMC، المجلد. 8 ، المادة 109 ، 2007. عرض في: موقع الناشر | منحة جوجل
  78. M. Cozar ، B. Bembi ، S. Dominissini et al. ، "التوصيف الجزيئي لحذف جديد للجين GBA1 بسبب تداخل ألو حدث إعادة التركيب "، علم الوراثة الجزيئية والتمثيل الغذائي، المجلد. 102 ، لا. 2، pp.226–228، 2011. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  79. إم إيه ليرمان ، دبليو جيه شنايدر ، وتي سي سودهوف ، "الطفرة في مستقبل LDL: ألو-ألو إعادة التركيب يحذف exons ترميز المجالات عبر الغشاء والهيولي ، " علم، المجلد. 227 ، لا. 4683 ، ص 140 - 146 ، 1985. عرض على: الباحث العلمي من Google
  80. M.A Lehrman، J.L Goldstein، D.W Russell، and M. S. Brown، "الازدواجية لسبعة إكسونات في جين مستقبل LDL الناجم عن ألو-ألو إعادة التركيب في موضوع مصاب بفرط كوليسترول الدم العائلي ، " زنزانة، المجلد. 48 ، لا. 5، pp.827–835، 1987. View at: Google Scholar
  81. J. J. Chae، Y.B Park، S.H Kim et al.، “اثنان من طفرات الحذف الجزئي التي تنطوي على نفس الشيء ألو تسلسل داخل intron 8 لجين مستقبل LDL في المرضى الكوريين المصابين بفرط كوليسترول الدم العائلي ، " علم الوراثة البشرية، المجلد. 99 ، لا. 2، pp. 155–163، 1997. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  82. R. Goldmann ، L. Tichy ، T. Freiberger et al. ، "التوصيف الجيني لعمليات إعادة ترتيب كبيرة لجين LDLR في المرضى التشيك الذين يعانون من فرط كوليسترول الدم العائلي ،" علم الوراثة الطبية BMC، المجلد. 11 ، المادة 115 ، 2010. عرض على: الباحث العلمي من Google
  83. M. Gentsch و A. Kaczmarczyk و K. Van Leeuwen et al. ، "ألو- عمليات الحذف التي يسببها التكرار داخل جين NCF2 التي تسبب مرض الورم الحبيبي المزمن الناجم عن نقص p67-phox (CGD) ، " الطفرة البشرية، المجلد. 31 ، لا. 2، pp.151–158، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  84. آر دي نيكولز ، إن فيشل-غودسيان ، ودي آر هيغز ، "إعادة التركيب عند الإنسان & # x3b1- مجموعة جينات الجلوبين: ميزات التسلسل والقيود الطوبولوجية ، " زنزانة، المجلد. 49 ، لا. 3، pp.369–378، 1987. View at: Google Scholar
  85. K. L. Harteveld، M. Losekoot، R. Fodde، P.C Giordano، and L.F Bernini، “مشاركة ألو يكرر في أحداث إعادة التركيب في & # x3b1الكتلة الجينية للجلوبين: توصيف اثنين & # x3b1(س) - نقاط توقف حذف الثلاسيميا ، " علم الوراثة البشرية، المجلد. 99 ، لا. 4 ، ص 528-534 ، 1997. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  86. F. Shimada ، M. Taira ، Y. Suzuki et al. ، "السكري المقاوم للأنسولين المرتبط بالحذف الجزئي لجين مستقبل الأنسولين ،" المشرط، المجلد. 335 ، لا. 8699 ، ص 1179-1181 ، 1990. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  87. روير ، إم. ألو-ألو إعادة التركيب " زنزانة، المجلد. 51 ، لا. 3، pp.417–425، 1987. View at: Google Scholar
  88. هوانغ ، إم إي ريبس ، إس إتش كورمان ، آر جيه ديكلباوم ، وجيه إل بريسلو ، "نقص البروتين الشحمي بسبب حذف جين 21 من البروتين الشحمي B المشتق من ألو-ألو إعادة التركيب " مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 264 ، لا. 19، pp. 11394–11400، 1989. View at: Google Scholar
  89. M. C. Pereira ، J.L Loureiro ، J. Pinto-Basto et al. ، "ألو العناصر تتوسط في إعادة ترتيب جينات SPG11 الكبيرة: المزيد من الطفرات spatacsin ، " علم الوراثة في الطب، المجلد. 14، pp. 143–151، 2012. View at: Google Scholar
  90. J. H & # xe4sler و K. Strub ، "ألو عناصر كمنظمين للتعبير الجيني ، " بحوث الأحماض النووية، المجلد. 34 ، لا. 19 ، ص 5491-5497 ، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  91. آر دي والترز ، وجيه إف كوجل ، وجيه إيه جودريتش ، "Invألوخردة قادرة: التأثير الخلوي ووظيفة ألو و B2 RNAs " الحياة IUBMB، المجلد. 61 ، لا. 8، pp.831–837، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  92. K. H. Burns و J.D Boeke ، "Human Transposon tectonics ،" زنزانة، المجلد. 149 ، الصفحات من 740 إلى 752 ، 2012. عرض على: الباحث العلمي من Google
  93. D. S. Friedman ، B. J. O'Colmain ، B. Mu & # xf1oz et al. ، "انتشار الضمور البقعي المرتبط بالعمر في الولايات المتحدة ،" محفوظات طب وجراحة العيون، المجلد. 122 ، لا. 4 ، ص 564-572 ، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  94. J. Ambati ، B. K. Ambati ، S. H. Yoo ، S. Ianchulev ، and A.P. Adamis ، "التنكس البقعي المرتبط بالعمر: المسببات ، والتسبب المرضي ، والاستراتيجيات العلاجية ،" مسح طب وجراحة العيون، المجلد. 48 ، لا. 3، pp.257–293، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  95. J. Ambati و B. J. Fowler ، "آليات الضمور البقعي المرتبط بالعمر ،" عصبون، المجلد. 75 ، ص 26 - 39 ، 2012. عرض على: الباحث العلمي من Google
  96. S. Khandhadia ، و J. Cherry ، و A. J. Lotery ، "التنكس البقعي المرتبط بالعمر ،" التقدم في الطب التجريبي وعلم الأحياء، المجلد. 724 ، الصفحات من 15 إلى 36 ، 2012. عرض على: الباحث العلمي من Google
  97. L. S. Lim ، P. Mitchell ، J.M Seddon ، F.G. Holz ، and T.Y. Wong ، "التنكس البقعي المرتبط بالعمر" المشرط، المجلد. 379 ، ص 1728-1738 ، 2012. عرض على: الباحث العلمي من Google
  98. S. Shiose ، Y. Chen ، K. Okano وآخرون ، "المستقبل الشبيه بالتول 3 مطلوب لتطوير اعتلال الشبكية الناجم عن ضعف إزالة الشبكية عبر الشبكية في الفئران ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 286 ، لا. 17 ، ص 15543-15555 ، 2011. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  99. M. Wornle ، M. Merkle ، A. Wolf et al. ، "تثبيط التأثيرات الالتهابية بوساطة TLR3 بواسطة Alkylphosphocholines في الخلايا الطلائية الصبغية لشبكية العين ،" طب العيون الاستقصائي & # x26 العلوم المرئية، المجلد. 52 ، ص 6536-6544 ، 2011. عرض على: الباحث العلمي من Google
  100. M. E. Kleinman ، H. Kaneko ، W.G. Cho et al. ، "تحفز الحمض النووي الريبي قصير التداخل تنكس الشبكية عبر TLR3 و IRF3 ،" العلاج الجزيئي، المجلد. 20، pp.101–108، 2012. View at: Google Scholar
  101. بي لينر ، جي ويليامز ، آر دي كامبل ، وسي إم ساندرسون ، "النصوص المضادة للتعبير في الجينوم البشري ،" الاتجاهات في علم الوراثة، المجلد. 18 ، لا. 2، pp.663–65، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  102. R. Yelin ، D. Dahary ، R. Sorek et al. ، "انتشار واسع للنسخ المضاد للمعنى في الجينوم البشري ،" التكنولوجيا الحيوية الطبيعة، المجلد. 21 ، لا. 4، pp.379–386، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  103. جيه تشين ، إم صن ، دبليو جي كينت وآخرون ، "أكثر من 20 & # x25 من النصوص البشرية قد تشكل أزواجًا من المعنى والمضاد للمعنى ،" بحوث الأحماض النووية، المجلد. 32 ، لا. 16 ، ص 4812-4820 ، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  104. أثناسياديس ، أ.ريتش ، وس. ماس ، "تحرير واسع النطاق لـ A-to-I RNA لـ ألو- تحتوي على mRNAs في نسخة الإنسان ، " بلوس علم الأحياء، المجلد.2 ، لا. 12 ، المقالة e391 ، 2004. عرض في: موقع الناشر | منحة جوجل
  105. Z. Zhang و GG Carmichael ، "مصير الرنا المزدوج الجديلة في النواة: يتوسط المركب المحتوي على p54nrb في الاحتفاظ النووي بالـ RNAs التي تم تحريرها بطريقة غير مشروعة ،" زنزانة، المجلد. 106 ، لا. 4، pp.465–475، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  106. ديكيربو وجي جي كارمايكل ، "الاحتفاظ والقمع: مصائر الحمض النووي الريبي المفرط في النواة ،" الرأي الحالي في بيولوجيا الخلية، المجلد. 17 ، لا. 3 ، الصفحات 302-308 ، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  107. L.L Chen و G.G.Carmichael ، "الاحتفاظ النووي المتغير لـ mRNAs التي تحتوي على تكرارات مقلوبة في الخلايا الجذعية الجنينية البشرية: الدور الوظيفي للـ RNA النووي غير المشفر ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 35 ، لا. 4، pp.467–478، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  108. V. Tarallo ، Y. Hirano ، B. D. Gelfand et al. ، "خسارة DICER1 و ألو يسبب الحمض النووي الريبي التنكس البقعي المرتبط بالعمر عبر الجسيم الملتهب NLRP3 و MyD88 ، " زنزانة، المجلد. 149 ، ص 847-859 ، 2012. عرض على: الباحث العلمي من Google
  109. S. Dridi ، Y. Hirano ، V. Tarallo et al. ، "تنشيط ERK1 / 2 هو هدف علاجي في التنكس البقعي المرتبط بالعمر" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 109، pp. 13781–13786، 2012. View at: Google Scholar
  110. U. Kalina ، D. Kauschat ، N. Koyama et al. ، "IL-18 ينشط STAT3 في خط الخلية القاتلة الطبيعية 92 ، ويزيد من النشاط السام للخلايا ، ويتوسط IFN-& # x3b3 الإنتاج بواسطة كيناز الإجهاد p38 وبواسطة الكينازات المنظمة خارج الخلية p44 (erk-1) و p42 (erk-21) ، " مجلة علم المناعة، المجلد. 165 ، لا. 3، pp.1307–1313، 2000. View at: Google Scholar
  111. H. Yang ، و H. Wang ، و C.J. Czura ، و K. J. Tracey ، "The cytokine activity of HMGB1 ،" مجلة بيولوجيا الكريات البيض، المجلد. 78 ، لا. 1، pp. 1–8، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  112. N. McNamara و M. Gallup و A. المجلة الأمريكية لخلية الجهاز التنفسي والبيولوجيا الجزيئية، المجلد. 34 ، لا. 6، pp.653–660، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  113. R.Wagner ، J.E.Smith ، B. S. Cooperman ، and K. Nishikura ، "يقدم نشاط فك ارتباط RNA مزدوج الشريطة تغييرات هيكلية عن طريق تحويلات الأدينوزين إلى inosine في خلايا الثدييات و Xenopus بيض،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 86 ، لا. 8، pp. 2647–2651، 1989. View at: Google Scholar
  114. P. H. Seeburg ، "تحرير A-to-I: مواقع ووظائف وتكهنات جديدة وقديمة ،" عصبون، المجلد. 35 ، لا. 1، pp. 17–20، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  115. هووبنغاردنر ، ت. بهالا ، سي ستابر ، ور. رينان ، "أهداف الجهاز العصبي لتعديل الحمض النووي الريبي التي تم تحديدها بواسطة علم الجينوم المقارن ،" علم، المجلد. 301 ، لا. 5634 ، ص 832-836 ، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  116. S. M. Rueter ، T. R. Dawson ، و R.B Emeson ، "تنظيم التضفير البديل عن طريق تحرير RNA ،" طبيعة سجية، المجلد. 399 ، لا. 6731 ، الصفحات 75-80 ، 1999. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  117. D.P. Morse ، P. J. Aruscavage ، and B. L. Bass، “RNA hairpins in noncoding of the human brain and أنواع معينة انيقة يتم تحرير الرنا المرسال بواسطة أدينوسين ديميناسز التي تعمل على الحمض النووي الريبي ، " وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 99 ، لا. 12، pp.7906–7911، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  118. A. D.J.Scadden و C.W.J Smith ، "انشقاق محدد من الرنا المزدوج الجديلة شديدة التحرير ،" مجلة EMBO، المجلد. 20 ، لا. 15 ، ص 4243-4252 ، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  119. إس دبليو نايت وبي إل باس ، "دور تحرير الحمض النووي الريبي بواسطة ADARs في RNAi ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 10 ، لا. 4، pp. 809–817، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  120. دي جي لوتشيانو ، هـ.ميرسكي ، إن جيه فينديتي ، وس. ماس ، "تحرير الحمض النووي الريبي لسلائف ميرنا ،" RNA، المجلد. 10 ، لا. 8 ، الصفحات 1174-1177 ، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  121. U. Kim ، Y. Wang ، T. Sanford ، Y. Zeng ، and K. Nishikura ، "الاستنساخ الجزيئي لـ cDNA من أجل نزع الأمين أدينوسين RNA مزدوج الشريطة ، وهو إنزيم مرشح لتحرير الحمض النووي الريبي النووي ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 91 ، لا. 24، pp. 11457–11461، 1994. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  122. M.A O'Connell، S. Krause، M. Higuchi et al. ، "استنساخ الحمض النووي الريبي (cDNAs) الذي يشفر الثدييات مزدوجة الشريطة أدينوزين ديميناس خاص بالثدييات ،" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 15 ، لا. 3، pp. 1389–1397، 1995. View at: Google Scholar
  123. T. Melcher ، S. Maas ، A. Herb ، R. Sprengel ، P. H. Seeburg ، M. Higuchi ، "إنزيم تحرير الرنا للثدييات ،" طبيعة سجية، المجلد. 379 ، لا. 6564، pp.460–464، 1996. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  124. F. Lai ، C. X. Chen ، K. C.Carter ، and K. Nishikura ، "تحرير مستقبلات الغلوتامات B لقناة أيونات فرعية RNAs بواسطة أربعة تقطيع بديل DRADA2 مزدوج الشريطة أدينوزين ديمينازات RNA ،" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 17 ، لا. 5، pp.2413–2424، 1997. عرض على: الباحث العلمي من Google
  125. CX Chen و DSC Cho و Q. Wang و F. Lai و KC Carter و K. Nishikura ، "العضو الثالث من عائلة جينات أدينوزين ديميناز الخاصة بـ RNA ، ADAR3 ، يحتوي على نطاقات ربط RNA مفردة ومزدوجة تقطعت بهم السبل ، " RNA، المجلد. 6 ، لا. 5 ، الصفحات 755-767 ، 2000. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  126. T. Melcher ، S. Maas ، A. Herb ، R. Sprengel ، M. Higuchi ، و P. H. Seeburg ، "RED2 ، عضو خاص بالدماغ من عائلة أدينوزين ديميناز الخاصة بـ RNA ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 271 ، لا. 50، pp. 31795–31798، 1996. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  127. C.G Proud ، "PKR: اسم جديد وأدوار جديدة ،" الاتجاهات في العلوم البيوكيميائية، المجلد. 20 ، لا. 6، pp.241–246، 1995. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  128. M. J. Clemens ، "بروتين كيناز PKR & # x2014a الذي ينظمه RNA مزدوج الشريطة" المجلة الدولية للكيمياء الحيوية وبيولوجيا الخلية، المجلد. 29 ، لا. 7، pp.945–949، 1997. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  129. L.R Saunders and G.N Barber ، "عائلة بروتين الرنا المزدوج الجديلة: الأدوار الحاسمة ، والوظائف الخلوية المتنوعة ،" مجلة FASEB، المجلد. 17 ، لا. 9، pp. 961–983، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  130. هربرت وأ.ريتش ، "دور المجالات الملزمة لـ dsRNA و Z-DNA في التحرير في الجسم الحي للركائز الدنيا بواسطة ADAR1 ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 98 ، لا. 21، pp. 12132–12137، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  131. T. مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 279 ، لا. 6 ، ص 4941-4951 ، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  132. D. S.C Cho و W. Yang و J. T. Lee و R. Shiekhattar و J.M Murray و K. Nishikura ، "متطلبات dimerization لنشاط تحرير RNA من adenosine deaminases التي تعمل على RNA ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 278 ، لا. 19، pp.17093–17102، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  133. جي بي باترسون وسي إي صموئيل ، "التعبير والتنظيم عن طريق الإنترفيرون لنزع أدينوسين أدينوسين مزدوج الشريطة خاص بـ RNA من الخلايا البشرية: دليل على شكلين من ديميناز ،" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 15 ، لا. 10 ، ص 5376-5388 ، 1995. عرض على: الباحث العلمي من Google
  134. C.R Eckmann و A. Neunteufl و L. Pfaffstetter و M.F Jantsch ، "إن الإنسان ولكن ليس Xenopus يحتوي إنزيم تحرير الحمض النووي الريبي ADAR1 على إشارة توطين نووي غير نمطية ويعرض خصائص بروتين متنقل ، " البيولوجيا الجزيئية للخلية، المجلد. 12 ، لا. 7، pp. 1911–1924، 2001. View at: Google Scholar
  135. J.M P. Desterro و L.P Keegan و M. Lafarga و M. T. Berciano و M. O'Connell و M. Carmo-Fonseca ، "الارتباط الديناميكي لإنزيمات تحرير RNA بالنواة ،" مجلة علوم الخلية، المجلد. 116 ، لا. 9، pp. 1805–1818، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  136. C.L Sansam ، K. S. Wells ، and R.B Emeson ، "تعديل تحرير RNA عن طريق عزل نووي وظيفي لـ ADAR2 ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 100 ، لا. 2، pp.14018–14023، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  137. J.H Yang ، X. Luo ، Y. Nie et al. ، "انتشار الحمض النووي الريبي الذي يحتوي على مادة إينوزين في الخلايا الليمفاوية التي ينظمها ADAR1 استجابةً للالتهاب ،" علم المناعة، المجلد. 109 ، لا. 1، pp. 15–23، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  138. R. Kikuno و T. Nagase و M. Waki ​​و O. Ohara ، "HUGE: قاعدة بيانات للبروتينات البشرية الكبيرة التي تم تحديدها في مشروع تسلسل Kazusa cDNA ،" بحوث الأحماض النووية، المجلد. 30 ، لا. 1، pp. 166–168، 2002. View at: Google Scholar
  139. إم.بلو ، إيه بي فيوتريل ، آر ووستر ، إم آر ستراتون ، "مسح لتعديل الحمض النووي الريبي في الدماغ البشري ،" أبحاث الجينوم، المجلد. 14 ، لا. 12 ، ص 2379-2387 ، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  140. كيم ، تي تي واي كيم ، تي والش وآخرون ، "تحرير الحمض النووي الريبي على نطاق واسع ألو عناصر في النسخة البشرية ، " أبحاث الجينوم، المجلد. 14 ، لا. 9 ، ص 1719-1725 ، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  141. ليفانون ، إي أيزنبرغ ، آر يلين وآخرون ، "التحديد المنهجي لمواقع تحرير A-to-I الوفيرة في النسخة البشرية ،" التكنولوجيا الحيوية الطبيعة، المجلد. 22 ، لا. 8، pp. 1001–1005، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  142. C. Tufarelli ، J.A Sloane Stanley ، D.Garrick et al. ، "نسخ الحمض النووي الريبي المضاد للدلالة مما يؤدي إلى إسكات الجينات والميثيل كسبب جديد للأمراض الوراثية البشرية ،" علم الوراثة الطبيعي، المجلد. 34 ، لا. 2، pp. 157–165، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  143. W. Yang، Q. Wang، K.L Howell et al.، "ADAR1 RNA deaminase تحد من فعالية RNA قصيرة التداخل في خلايا الثدييات ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 280 ، لا. 5، pp. 3946–3953، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  144. H. J. Liao ، R. Kobayashi ، and M.B Mathews ، "أنشطة الحمض النووي الريبي المرتبط بالفيروس الغدي: تنقية وتوصيف بروتينات ربط الحمض النووي الريبي ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 95 ، لا. 15، pp. 8514–8519، 1998. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  145. J.O. Langland، P.N Kao، and B. L. Jacobs، "Nuclear factor-90 of Activated T-cells: a double-stranded RNA-رابط البروتين والركيزة لـ RNA مزدوج الشريطة المعتمد على البروتين كيناز ، PKR ،" الكيمياء الحيوية، المجلد. 38 ، لا. 19، pp. 6361–6368، 1999. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  146. R.C Patel، D.J Vestal، Z. Xu et al.، “DRBP76 ، بروتين نووي مزدوج الشريط مرتبط بالـ RNA ، يتم فسفرته بواسطة بروتين كيناز الذي يسببه الإنترفيرون ، PKR ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 274 ، لا. 29، pp.20432–20437، 1999. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  147. LR Saunders، DJ Perkins، S. Balachandran et al. ، "توصيف اثنين من البروتينات الفسفورية النووية المحفوظة تطوريًا ، NFAR-1 و -2 ، والتي تعمل في معالجة الرنا المرسال وتتفاعل مع بروتين كيناز المعتمد على RNA مزدوج السلسلة ، " مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 276 ، لا. 34، pp. 32300–32312، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  148. A. Pires-daSilva، K. Nayernia، W. Engel et al. ، "تظهر الفئران التي تعاني من نقص في البروتين المرتبط بالحيوان المنوي حول النواة RNA تشوهات مورفولوجية عصبية ومولدة للحيوانات المنوية والحيوانات المنوية ،" علم الأحياء التنموي، المجلد. 233 ، لا. 2 ، ص 319-328 ، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  149. H. Wu، A.R MacLeod، W.F Lima، and S. T. Crooke، “تحديد وتنقية جزئية لنشاط RNase مزدوج حبلا الإنسان. آلية إنهاء جديدة للأدوية المضادة لتحفيز قليل النوكليوتيدات ، " مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 273 ، لا. 5، pp.2532–2542، 1998. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  150. D. A. Wassarman و J. A. Steitz ، "حي مع البروتينات الميتة ،" طبيعة سجية، المجلد. 349 ، لا. 6309 ، ص 463-464 ، 1991. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  151. J. P. Staley و C. Guthrie ، "الأجهزة الميكانيكية من spliceosome: المحركات ، والساعات ، والينابيع ، والأشياء ،" زنزانة، المجلد. 92 ، لا. 3، pp. 315–326، 1998. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  152. S. Zhang ، و C. Herrmann ، و F. مجلة علوم الخلية، المجلد. 112 ، ص 1055-1064 ، 1999. عرض على: الباحث العلمي من Google
  153. S. Aratani ، R. Fujii ، T. Oishi et al. ، "الأدوار المزدوجة لـ RNA heliase a في النسخ المعتمد على CREB ،" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 21 ، لا. 14، pp. 4460–4469، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  154. R. Apweiler ، T. K. Attwood ، A. Bairoch et al. ، "قاعدة بيانات InterPro ، مورد توثيق متكامل لعائلات البروتين ، المجالات والمواقع الوظيفية ،" بحوث الأحماض النووية، المجلد. 29 ، لا. 1 ، ص 37-40 ، 2001. عرض على: الباحث العلمي من Google
  155. C. T. Sun ، W. Y. Lo ، I.H Wang et al. ، "نسخ قمع جينات فيروس التهاب الكبد B البشري بواسطة بروتين ملزم للعنصر التنظيمي السلبي / SON ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 276 ، لا. 26 ، ص 24059-24067 ، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  156. J. Chen ، S. Vijayakumar ، X. Li ، and Q. Al-Awqati ، "Kanadaptin هو بروتين يتفاعل مع الكلى ولكن ليس شكل الكريات الحمر في النطاق 3 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 273 ، لا. 2 ، ص 1038-1043 ، 1998. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  157. S. H & # xfcbner ، و D.A Jans ، و C.Y. Xiao ، و A.P. مجلة الكيمياء الحيوية، المجلد. 361 ، لا. 2، pp.287–296، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  158. C.V Patel ، I. Handy ، T. Goldsmith ، and R.C Patel ، "PACT ، منشط خلوي معدّل الإجهاد من بروتين كيناز RNA المنشط مزدوج الشريطة الذي يسببه الإنترفيرون ، PKR ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 275 ، لا. 48، pp.37993–37998، 2000. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  159. D.RMicklem و J. Adams و S. Gr & # xfcnert و D. St Johnston ، "الأدوار المميزة لاثنين من مجالات Staufen المحفوظة في تعريب oskar mRNA والترجمة" مجلة EMBO، المجلد. 19 ، لا. 6، pp. 1366–1377، 2000. View at: Google Scholar
  160. T. H. Li و C.W Schmid ، “تحريض الإجهاد التفاضلي للفرد ألو loci: الآثار المترتبة على النسخ والنقل الرجعي ، " الجين، المجلد. 276 ، لا. 1-2 ، ص 135 - 141 ، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  161. C.M Rudin و C.B Thompson ، "التنشيط النسخي للعناصر القصيرة التي تتخللها عوامل إتلاف الحمض النووي ،" جينات الكروموسومات السرطان، المجلد. 30، pp.64–71، 2001. View at: Google Scholar
  162. سي آر هاجان ، آر إف شيفيلد ، سي إم رودين ، "الإنسان ألو إعادة نقل العنصر الناجم عن الإجهاد السام للجينات ، " علم الوراثة الطبيعي، المجلد. 35 ، لا. 3، pp. 219–220، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  163. R. Pandey ، A. K. Mandal ، V. Jha ، و M. Mukerji ، "ارتباط عامل الصدمة الحرارية في ألو تكرر توسع مشاركتها في الإجهاد من خلال آلية مضادة للحساسية ، " بيولوجيا الجينوم، المجلد. 12 ، مقالة R117 ، 2011. عرض على: الباحث العلمي من Google
  164. S. S. H & # xe9bert ، A. S. Papadopoulou ، P. Smith et al. ، "ينتج عن الاستئصال الجيني للمقامر في الخلايا العصبية للدماغ الأمامي البالغ حدوث فرط فسفرة تاو وتنكس عصبي غير طبيعي ،" علم الوراثة الجزيئية البشرية، المجلد. 19 ، لا. 20، pp. 3959–3969، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  165. S. S. Hebert ، N. Sergeant ، and L. Buee ، "MicroRNAs وتنظيم استقلاب تاو ،" المجلة الدولية لمرض الزهايمر، المجلد. 2012 ، معرف المقالة 406561 ، 6 صفحات ، 2012. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  166. A. Halle ، V. Hornung ، G.C Petzold et al. ، "إن الجسيم الملتهب NALP3 متورط في الاستجابة المناعية الفطرية للأميلويد-& # x3b2,” مناعة الطبيعة، المجلد. 9 ، لا. 8، pp.857–865، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  167. S. T. Lee ، K. Chu ، W. S. Im et al. ، "تعديل تنظيم microRNA في نماذج مرض هنتنغتون ،" علم الأعصاب التجريبي، المجلد. 227 ، لا. 1، pp. 172–179، 2011. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  168. U. Bhadra ، S. Santosh ، N. Arora ، P. Sarma ، و M. Pal-Bhadra ، "خريطة التفاعل واختيار أهداف microRNA في الجينات المرتبطة بمرض باركنسون ،" مجلة الطب الحيوي والتكنولوجيا الحيوية، المجلد. 2009 ، معرف المقال 363145 ، 11 صفحة ، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل

حقوق النشر

حقوق النشر & # xa9 2012 سامي دريدي. هذا مقال مفتوح الوصول يتم توزيعه بموجب ترخيص Creative Commons Attribution License ، والذي يسمح بالاستخدام غير المقيد والتوزيع والاستنساخ في أي وسيط ، بشرط الاستشهاد بالعمل الأصلي بشكل صحيح.


Ullu E ، Weiner AM: الجينات البشرية والجينات الخادعة لمكون 7SL RNA لجسيم التعرف على الإشارة. EMBO J 3: 3303 - 3310 ، 1984

Walter P ، Blobel G: يحتوي جسيم التعرف على الإشارة على 7S RNA ضروري لنقل البروتين عبر الشبكة الإندوبلازمية. Nature (لندن) 299: 691-698 ، 1982

Weiner AM: الحمض النووي الريبي 7S السيتوبلازمي الوفير مكمل لعائلة تسلسل الحمض النووي المتكرر المنتشر في الجينوم البشري. الخلية 22: 209-218 ، 1980

Weiner AM، Deininger PL، Estratiadis AE: retroposons غير فيروسية: الجينات ، psuedogenes والعناصر القابلة للنقل الناتجة عن التدفق العكسي للمعلومات الجينية. Annu Rev Biochem 55: 631-662 ، 1986

هي XP ، Bataille N ، Friend HM: التصدير النووي لجسيمات التعرف على الإشارة RNA هي عملية مُيسرة تتضمن مجال تسلسل Alu. J Cell Sci 107: 903-912 ، 1994

شميد سي ، ماريا آر: تنظيم النسخ والاختيار الانتقالي لتسلسلات SINE النشطة. العملة المفتوحة في Genet Dev 2: 874-882 ، 1992

Ariga H: تكرار الحمض النووي المستنسخ الذي يحتوي على تسلسل عائلة alu أثناء تخليق الحمض النووي لفيروس القرد 40 المعزز لاستخراج الخلايا. مول سيل بيول 4: 1476-1482 ، 1984

Saegusa، Y، Sato، M.، Gali، I.، Nakagawa، T.، Ono، N.، Iguchi-Ariga، S.M.M. و Ariga ، H: تحفيز نسخ ونسخ الحمض النووي SV40 بواسطة تسلسل عائلة Alu. Biochimica et Biophysica Acta 1172: 274-282، 1993

Perelygina L و Tomilin N و Podgornaya O: تكرر عائلة Alu بروتين الارتباط من خلايا هيلا التي تتفاعل مع المنطقة التنظيمية لجينوم فيروس SV40. Mol Biol Rep 12: 111-116، 1987

Tomilin N ، Buzhkov V: بروتين نووي بشري يتفاعل مع نموذج تسلسل محافظ من الحمض النووي لعائلة Alu يتكرر. FEBS Lett 251: 79-83 ، 1989

Boyko V ، Svetlova M ، Negishi Y ، Ariga H ، Tomilin N: الركيزة الخلوية الرئيسية لـ kinases البروتين ، الملحق الثاني ، هو بروتين ملزم للحمض النووي. FEBS Lett 345: 139–142، 1994

Jindal HK و Chaney WG و Anderson CW Davis RG و Vishwanatha JK: ركيزة بروتين التيروزين كيناز ، سلسلة ثقيلة كالباكتين I (p36) ، هي جزء من مركب بروتين التعرف التمهيدي الذي يتفاعل مع DNA polymerase a. J بيول كيم 266: 5169-5176 ، 1991

Klee CB: Ca 2+ - فوسفوليبيد - بروتينات ملزمة (وغشاء). الكيمياء الحيوية 27: 6645 - 6653 ، 1988

Vishwanatha JK ، Jindal HK ، Davis RG: دور بروتينات التعرف على التمهيدي في تكرار الحمض النووي: الارتباط مع المصفوفة النووية في خلايا هيلا. J Cell Sci 101: 25–34 ، 1992

Laemmli UK: انقسام في بنية البروتينات أثناء تجميع رأس العاثية T4. طبيعة 227: 680-685 ، 1970

Fanning E ، Knippers R: هيكل ووظيفة مستضد الورم الكبير 40 لفيروس القردة. Annu Rev Biochem 61: 55–85 ، 1992

Mimori T و Hardin JA و Steitz JA: توصيف مستضد البروتين المرتبط بالحمض النووي Ku المعترف به بواسطة الأجسام المضادة الذاتية من المرضى الذين يعانون من اضطرابات الروماتيزم. جي بيول كيم 261: 2274-2278 ، 1986

Glenney JR: تنقية الكالباكتين الأول والثاني وعزل ذيل N- طرفي من كالباكتين I. ميث إيزيمول 196: 65-69 ، 1991

Chang D.-Y، Nelson B، Bilyeu T، Hsu K، Darlington GJ، Maraia RJ: بروتين مرتبط بالحمض النووي الريبي البشري Alu RNA يرتبط تعبيره بتراكم الحشوية الصغيرة Alu RNA. Mol Cell Biol 14: 3949–3959، 1994

Yamazaki H ، Nomoto S ، Mishima Y ، Kominami R: بروتين 35 كيلو دالتون يرتبط بحبل غني بالسيتوزين من الحمض النووي للأقمار الصناعية متغير للغاية. J Biol Chem 267: 12311–12316، 1992


الوحدة الفرعية SRP9 / 14 لجسيم التعرف على الإشارة (SRP) موجودة في أكثر من 20 ضعفًا من SRP في خلايا الرئيسيات وهي موجودة بشكل أساسي مجانًا ولكنها أيضًا معقدة مع الحمض النووي الريبي Alu RNAs السيتوبلازمي الصغير.

يعتبر البروتين غير المتجانسة SRP9 / 14 المرتبط بتسلسلات Alu لـ SRP RNA ضروريًا لوظيفة التحكم الترجمي لجسيم التعرف على الإشارة (SRP). يُعتقد أن Alu RNAs لخلايا الرئيسيات مشتق من SRP RNA وقد ثبت أنه يرتبط ببروتين مرتبط بـ SRP14 في المختبر. لقد استخدمنا الأجسام المضادة لتوصيف SRP9 / 14 وفحص ارتباطها بـ RNAs الصغيرة في الجسم الحي. على الرغم من أن بروتينات SRP9 لها نفس الحجم في كل من خلايا القوارض والرئيسيات ، إلا أن الوحدات الفرعية SRP14 تكون أكبر بشكل عام في خلايا الرئيسيات. هناك مجال إضافي غني بالألانين عند الطرف C لحجم أكبر لشكل إسوي بشري واحد. على الرغم من أن بروتينات SRP الأربعة الأخرى يتم تجميعها إلى حد كبير في SRP في كل من خلايا القوارض والرئيسيات ، وجدنا أن المغير المتغاير SRP9 / 14 موجود في 20 ضعفًا زائدًا عن SRP في خلايا الرئيسيات. قد يساهم معدل تخليق كلا البروتينين في تراكمهما. الغالبية العظمى من SRP9 / 14 الزائدة هي حشوية ولا يبدو أنها مرتبطة بأي من الحمض النووي الريبي الصغير ، ومع ذلك ، فإن جزءًا مهمًا من الحمض النووي الريبي السيتوبلازمي الصغير معقد مع SRP9 / 14 في جسيم 8.5 S. تشير النتائج التي توصلنا إليها إلى وجود فائض كبير من SRP9 / 14 في خلايا الرئيسيات وأن Alu RNAs مرتبطة بـ SRP9 / 14 في الجسم الحي تشير إلى أن هذا البروتين غير المتجانس قد يلعب أدوارًا إضافية في التحكم الترجمي للتعبير الجيني و / أو استقلاب نسخة Alu.


ما هي الوظيفة الرئيسية للأحماض النووية؟

الأحماض النووية عبارة عن جزيئات كيميائية حيوية كبيرة تخزن وتنقل المعلومات الوراثية في الخلية. يستخدمون معلوماتهم الجينية المخزنة لتوجيه توليف البروتينات الجديدة في الخلية. يمكن تصنيع بروتينات جديدة بواسطة الريبوسومات من الحمض النووي والجينات الموجودة في الأحماض النووية.

توجد الأحماض النووية في كروموسومات كل خلية حية. توجد الكروموسومات في نواة كل خلية حية. تعد الأحماض النووية جزءًا مهمًا من الكروموسومات لأنها تحتوي على جميع الجينات التي تشكل الحمض النووي للكائن الحي. يقوم الحمض النووي باستمرار بتوجيه والحفاظ على صحة الكائن الحي والبيئة الداخلية من خلال توجيه إنتاج البروتينات ، التي توجه إنتاج الهرمونات والبروتينات والإنزيمات الأخرى.


النتائج

الفصائل الفرعية Alu Yb9 و Yc1 و Yc2: سمح لنا تحليل مجموعة من 243 عنصرًا من عناصر Yb8 Alu المسترجعة من قاعدة بيانات GenBank بتحديد عائلة فرعية مفترضة تحتوي على جميع الطفرات التشخيصية المعروفة لـ Yb8 بالإضافة إلى طفرة جديدة واحدة ، والتي يشار إليها باسم Yb9 وفقًا لمعيار Alu الفرعي تسمية الأسرة (B atzer وآخرون. 1996). يظهر تسلسل إجماع Yb9 في الشكل 1. استردت عمليات البحث من nr و htgs و gss إجمالي 56 عنصرًا من Yb9. من بين هذه العناصر ، تم استرداد 25 عنصرًا من قاعدة بيانات nr (30.4٪ من الجينوم البشري في ذلك الوقت) ، مما يعطي حجمًا تقديريًا يبلغ 82 عضوًا لعائلة Yb9 الفرعية. يتوافق هذا التقدير أيضًا مع البحث في مسودة التسلسل الجيني البشري (L ander وآخرون. 2001) التي حددت 79 تطابقًا تامًا مع تسلسل استعلام Yb9 الخاص بالعائلة الفرعية.

باستخدام نهج مختلف ، استرجعنا أيضًا عائلة فرعية تم تحديدها مسبقًا ، Yc1 [كان يُطلق عليها سابقًا Sb0 (J urka 1995)] ، ومتغير جديد ، Yc2. جلبت عمليات البحث في قاعدة بيانات GenBank عن عناصر Alu Y التي تتطابق تمامًا مع تسلسل الإجماع انتباهنا إلى العديد من عناصر Alu Y التي تشترك في واحد أو اثنين من الطفرات المحددة التي تختلف عن إجماع Y. سهّل الفحص الدقيق استرجاع فصائل Alu الفرعية الإضافية. ستؤدي عمليات بحث بلاست باستخدام تسلسل الإجماع لـ Alu Yc1 و Yc2 أيضًا إلى استرداد عدد كبير من العناصر التي تتطابق مع عائلة Alu Y الفرعية أيضًا ، مما يجعل تحليل العناصر المحددة بهذه الطريقة غير عملي. لذلك ، اخترنا فقط عناصر هذه العائلات الفرعية ذات الهوية بنسبة 100٪ لتسلسل استعلام قليل النوكليوتيد الذي يحتوي على قواعد التشخيص الخاصة بالعائلة الفرعية. تم استرداد ما مجموعه 176 Yc1 (13 تطابقًا مثاليًا مع تسلسل إجماع العائلة الفرعية بالكامل) و 17 Yc2 (11 تطابقًا مثاليًا مع تسلسل إجماع العائلة الفرعية بالكامل). أسفر عدد جميع عناصر Yc1 التي تم استردادها بواسطة BLAST في بحث أولي واحد من قاعدة بيانات nr عن ما مجموعه 116 عنصرًا ، مما يعطي عددًا تقديريًا للنسخة من 381 عنصر Yc1 في الجينوم البشري (تحتوي قاعدة البيانات nr على 30.4٪ من تسلسل الجينوم البشري وقت البحث). ومن المثير للاهتمام أن ثلاثة من العناصر الأربعة المصنفة سابقًا على أنها عناصر Alu Y مرتبطة بالمرض (D eininger و B atzer 1999) تنتمي إلى عائلة Alu Yc1 الفرعية (الشكل 2): من جديد الإدراج في جين مثبط C1 (C1inh S toppa -L yonnet وآخرون. 1990) ، آخر من جديد الإدراج في BRCA2 (BRCA2 M iki وآخرون. 1996) ، ونقص الجلسرين كيناز (GK Z hang وآخرون. 2000).

شارك حوالي نصف إجمالي 56 عنصرًا من Yb9 (29) في هوية النوكليوتيدات بنسبة 100 ٪ مع تسلسل إجماع العائلة الفرعية. للحصول على تقدير تقريبي لعمر عائلة Yb9 الفرعية ، قمنا بتقييم عدد الطفرات غير CpG الموجودة داخل عناصر Alu المختلفة كما هو موضح سابقًا (R oy وآخرون. 2000). حدث ما مجموعه 19 طفرة CpG ، و 25 طفرة غير CpG ، واثنين من 5 اقتطاع داخل 56 من أفراد عائلة Alu Yb9 المحددة. استخدام معدل تطور محايد لتسلسل الحمض النووي المتدخل في الرئيسيات بنسبة 0.15٪ لكل مليون سنة (M iyamoto وآخرون. 1987) وكثافة طفرة غير CpG بنسبة 0.1908 ٪ (25/13104 قواعد باستخدام قواعد غير CpG فقط) ضمن 56 عنصر Yb9 Alu ينتج متوسط ​​عمر تقديري يبلغ 1.27 مليون سنة (Myr). تم توقع عمر أفراد عائلة Yb9 بمستوى ثقة 95٪ في نطاق 0.8-1.8 myr ، بالنظر إلى أن الطفرات كانت عشوائية وتناسب التوزيع ذي الحدين. لا يمكن إجراء تحليل لعنصري Yc1 و Yc2 Alu ، لأنه تم عزل أفراد العائلة الفرعية فقط الذين لديهم هوية كاملة لتسلسل إجماع العائلة الفرعية أو عدم تطابق واحد من قاعدة البيانات باستخدام أحد إجراءات فحص قاعدة البيانات.


شاهد الفيديو: ما هي عضيات الخلية وما وظائفها - الخلية الجزء (كانون الثاني 2022).