معلومة

كيفية تحديد مجموعة الأصل القاري (العرق) ببيانات النسخ التي تم الحصول عليها باستخدام المصفوفة الدقيقة للحمض النووي الريبي؟


لنفترض أن لدي بيانات تعبير جينوم كاملة (نسخة) لبعض الأنسجة البشرية المأخوذة. هل هذه البيانات كافية لمعرفة مجموعة الأصل القاري لأحد المانحين؟


إذا كان بإمكانك استدعاء المتغيرات الجينومية من بياناتك ، اعتمادًا على تغطيتك للجينوم ، فيجب أن تكون قادرًا على تحديد الأصل. على سبيل المثال ، إذا كان لديك تسلسل قراءات ، فيمكنك محاذاة قراءاتك مع جينوم مرجعي ثم استدعاء المتغيرات باستخدام خطوط الأنابيب الحالية.

بمجرد إجراء مكالمات مختلفة ، يمكنك استخدام علامات إرشادية للأصول لاستنتاج أصل عينتك مباشرة.

أو يمكنك استخدام البرامج الحالية لتعيين أصل عينتك فيما يتعلق بعينات أخرى من أصل معروف ، باستخدام برنامج مثل ADMIXTURE أو STRUCTURE أو EIGENSOFT أو تحليل المكونات الأساسية فقط. للحصول على عينات مرجعية ، يمكنك استخدام مجموعة بيانات متاحة للجمهور مثل HapMap 3 أو مشروع تنوع الجينوم البشري.


شاهد الفيديو: DNA Microarray technique - تقنية رقائق الحمض النووى الدقيقة - بالعربى (كانون الثاني 2022).